Dit is een samenvatting van bio-chemie (onderdeel organische chemie). Hierin staat alles wat te kennen is voor Prof. E. Meyer. Er staat duidelijk aangegeven wat te kennen is en wat je moet kunnen tekenen of enkel herkennen. Hiermee was ik geslaagd.
Samenvatting bio-organische
chemie
Deel 1: Beschrijvende biochemie
Hoofdstuk 1: inleiding tot biochemie
1.1 Definitie biochemie
- Bestudeert de processen in de cel op moleculair niveau.
- In metabolisme van levende organismen kunnen 2 processen onderscheiden worden:
Katabole -> afraak.
Anabole -> opbouw.
- pH:
P staat voor power -> protonen -> zuur.
De negatieve logaritme van H.
1.2 Elementen
- 6 belangrijkste: C,H,O,N,P,S.
- 5 essentiile ionen: K, Na, Cl, Ca, Mg.
- Biopolymeren:
Proteïnen of eiwiten elk enzyme, in gelijk wel organisme is een eiwit)
Veten of lipiden.
Nucleïnezuren
Suikers heef altijd uitgang –ose)
1.3 Basis organische chemie
- Verschil biochemie en organische chemie is de snelheid van de reacties. In biochemie
worden bijna steeds enzymen gebruikt als biologische katalysatoren.
- Kennis van biochemie wordt gebruikt voor ontwikkeling van geneesmiddelen en
behandeling van ziekten.
- Basisprincipe biochemie: vorming biopolymeren of macromoleculen. Bouwstenen voor
polymeren zijn monomeren die aan elkaar gekoppeld worden via waterafsplitsing.
Biopolymeren hebben een driedimensionale structuur.
1.4 Levensenergie
- Biochemie is de som van alle dynamische processen van opbouw en afraak die gepaard
gaan met transformatie van energie.
- Thermodynamica functioneert als drijfveer achter de biochemische reacties, waarin de
verandering in vrije energie deltaG) centraal staat:
Spontane reactie als vrije energie < 0.
Input externe energie als vrije energie > 0.
Evenwichtsreactie als vrije energie = 0.
1
,- Vrije energie = DeltaH – T x DeltaS. = de verandering in vrije energie = het verschil tussen de
veranderingen in enthalpie/ warmteinhoud en het product van de temperatuur met de
verandering in entropie/ wanorde.
1.5 De cel is de basiseenheid van leven
- Elke cel is een dynamische en interactieve eenheid.
- Eukaryote versus prokaryote cel. -> steeds meer specialisatie door compartimentalisatie.
- Celvorm en intracellulair transport via cystoskelet.
- Grote densiteit en activiteit in cel: continu proces van difusie en botsing. Er is een
gecontroleerde choas.
- Organisatie van gepecialiseerde celgroepen in weefsel: metabole samenwerking tussen
weefsels.
1.6 Water
- Functie: basissolvent + celtonus.
- Watermolecule heef unieke fysicochemische eigenschappen:
Permant dipool.
H-brugvorming, intra en intermoleculair.
Ook met andere dipolen worden H-bruggen gevormd.
Warmte en dampspanning zijn hoog, wat een stabiele lichaamstemperatuur mogelijk
maakt.
Bij ionisatie wordt 1 proton en 2 hydroxide-anion gevormd.
- Twee kritische parameters maken H-brugvorming tussen H en een elektronegatief atoom
mogelijk:
Afstand
Oriintatie.
- Like likes like regel:
Polair: wateroplosbaar = hydrofel
Apolair: wateronoplosbaar = hydrofoob = lypofel.
Apolair + polair: deel water on)oplosbaar = amfpaat. Bv. detergentia, zepen of
surfactantia en galzouten.
1.7 Niet-covalente binding
- Deze zijn zwakker, maar toch belangrijk omdat de som van deze zwakkere bindingen een
totale bindingsenergie vertegenwoordigt in een grote molecule.
- Omdat er in een cel vele biopolymeren zijn, zorgen de grote aantallen niet-covalente
bindingen zoals h-bruggen voor de stabilisatie van proteïnen en nucleïnezuren.
- Niet covalente bindingen in dalende volgorde van bindingssterkte:
Electrostatische interacties:
o H-bruggen
o Ladings-ladings interacties
o Van der Waals-krachten
Hydrofobe interacties
- Het dynamisch karakter van biochemische reacties is mogelijk dankzij de niet-covalente
bindingen.
2
,1.8 Reactiemechanismen
- Nucleofele reacties: bevat een O N Of S als functionele groep. Ook water heef een
nucleofel karakter -> hydrolyserend vermogen van water.
- Biologische katalysatoren zijn enzymen, een gespecialiseerde groep van proteïnen, ze
hebben een 3D structuur. Enzymen helpen de thermodynamische barrière te overwinnen
die spontane reacties hindert.
- Energie nodig voor enzymatische reacties wordt geleverd door fosforylatie via de molecule
adenosine-trifosfaat ATP). ATP zorgt meestal voor de transfer van een anorganische P-groep
naar het intermediair dat hierdoor reactief wordt.
1.9 PH
- Ph van maagsap tussen 1 en 3.
- Ph = -log h)
- Henderson-Hasselbalch vergelijking kunnen afeiden en toepassen): pH: pKa + log A- / HA
Hoofdstuk 2: aminozuren en proteïnen
- Algemene structuurformule aminozuur:
3
, 4
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
√ Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, Bancontact of creditcard voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper vetstudente. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €14,99. Je zit daarna nergens aan vast.
