Samenvatting

Samenvatting farmaceutische toepassingen van de moleculaire biologie (16/20)

0 keer verkocht

Instelling
Universiteit Antwerpen (UA)

Volledige samenvatting van het vak 'farmaceutische toepassingen van de moleculaire biologie' gedoceerd door prof. Yann Sterckx. Het examen is openboek, maar deze samenvatting mag je meenemen naar het examen!

[Meer zien]

Voorbeeld 4 van de 56 pagina's

Bekijk voorbeeld

Geupload op 20 februari 2024
Aantal pagina's 56
Geschreven in 2021/2022
Type Samenvatting

master go
moleculaire biologie
geneesmiddelenontwikkeling
farmaceutische toepassingen van de moleculaire

Volgen

nikitacassimon Lid sinds 11 maanden 23 documenten verkocht

€10,49

In winkelwagen

Op verlanglijstje

100% tevredenheidsgarantie
Direct beschikbaar na je betaling
Lees online óf als PDF
Geen vaste maandelijkse kosten

Nikita Cassimon 1e master geneesmiddelenontwikkeling s0184207

Farmaceutische toepassingen van de moleculaire
biologie
Chapter 2: Molecular Basis of Genetic Diseases

Mutatie = verandering in de nucleotide sequentie van een chromosoom

 Af en toe fouten in DNA  belangrijk voor evolutie ‘survival of the fittest’
 Mutatie kan zowel positief (gain-of-function) als negatief (loss-of-function) zijn
o Loss-of-function is meestal recessief in een diploïd organisme
o Gain-of-function is meestal dominant in een diploïd organisme

 MAAR een mutatie dat een voordeel biedt aan een organisme is zeldzaam

Centraal dogma van de moleculaire biologie:

 DNA replicatie fout  probleem
 Transcriptie fout  geen probleem
 Translatie fout  geen probleem

Indien eiwitten niet mooi opvouwen (chaperones) 
uitstekende hydrofobe oppervlakten  vorming aggregaten

Amyloidoses = aggregatieziekten waarbij amyloïde fibrillen aangetast zijn

Bv. Type 2 diabetes, Alzheimer, Parkinson, Huntington

Diploïd = cellen bevatten twee kopieën van elk chromosoom (2x22 autosomale chromosomen + 2
geslachtschromosomen =3*109 bp = 2m DNA per cel)

2003: eerste genoom  composiet uit verschillende anonieme donoren

Genome annotation = locatie van genen(groepen)sequenties aan functie koppelen

Exons en interons: meerderheid codeert niet voor informatie (maar 1,5% voor 20.000 eiwitten)

Alternative gene expression/RNA
splicing = de productie van meerder

, Nikita Cassimon 1e master geneesmiddelenontwikkeling s0184207

eiwitten uit een enkel gen door alternatieve combinaties van exons (cryptische splicing, exon
skipping, intron retentie,etc.)

Transposons = mobiele DNA segmenten die van de ene positie naar de andere kunnen springen en
zich kunnen repliceren

 ‘Moleculaire parasieten’
 Transposases = enzymen die het transpositie
proces beïnvloeden
 Retrotransposons = transposons opgepikt uit
retrovirussen (insereren genoom)
 LINEs = Long Interspersed Nuclear Elements
 SINEs = Short Interspersed Nulcear Elements

Simple-sequence repeats (SSRs) Short tandem repeats (STRs)
 10 bp lang  3 tot 6 bp lang
 Miljoen keer per cel  Dozijn keer op een specifieke locatie
 Vooral in centromeren en telomeren  Gebruikt bij forensische analyse  uniek
voor een groep mensen aan elkaar verwant

20% is DNA dat niet-coderend is en niet
80% van DNA wordt
overgeschreven wordt maar bevat regulatorische
overgeschreven in RNA
elementen  kunnen de expressie van proteïnen
en RNA beïnvloeden  mutaties  ziekten
Waar komt de menselijke variatie vandaan?

Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) = veranderingen op specifieke genomische locaties, kleine
wijzigingen in nucelotiden/baseparen

 Mensen gaan indelen in bevolkingsgroepen op basis van SNPs
 Om de 1000 basisparen is er tussen 2 personen een SNP (3*10 6 verschillen)

! Sommige SNP zijn zo dicht tegen elkaar dat die nauwelijks aangetast worden door recombinatie
(linkage decay) tijdens meiose  samen overgeërfd

Haplotype = groep van SNPs die altijd samen doorgegeven worden, meestal 1000 bp uit elkaar

Tag SNP = SNP die typerend is voor een bepaald haplotype merkers gaan geven aan bepaalde
bevolkingsgroepen

1. Positie van SNP lokaliseren
2. Set van SNPs die samen overgeërfd worden definiëren als haplotype
3. Specifiek aantal SNPs uitkiezen die specifiek zijn voor een bepaald haplotype

Voordeel: Minder gaan sequeneren door (door associatie via linkage disequilibrium)

,Nikita Cassimon 1e master geneesmiddelenontwikkeling s0184207

 Stabiele haplotypes: mitochondriaal genoom en op het Y chromosoom (ondergaan geen
recombinatie tijdens meiose)

Exome sequencing = gedeelte van genoom sequeneren dat codeert voor eiwitten (1%)

‘Big data’ gecollecteerd door systems biology in
biobanken:

 Genome
 Exome
 Transcriptome
 Proteome
 Metabolome

Gepersonaliseerde geneeskunde:

Pharmacogenomics = de toepassing van genetische informatie of methoden om farmacogenetische
problemen op te lossen

Pharmacogenetics= het onderdeel binnen de biochemische genetica dat zich bezighoud met de
impact van genetische variatie op medicatie respons en metabolisme te bestuderen

Bv.

 6-mercaptopurine: gemakkelijk te metaboliseren tenzij voor poor ‘metabolizers’  toxisch
 Glucose-6-fosfaat dehydrogenase deficiëntie: niet behandelen met primaquine (malaria) of
favabonen in dieet  anemiecrisis

Types of Insults to DNA:

Puntmutatie = mutatie die bestaat uit de verandering van één enkele base, één basepaar, technisch
gezien SNPs

Transities = puntmutaties waarbij een purine bp uitgewisseld wordt door een ander purine (A T
of CG)

Transversies = puntmutaties waarbij een purine-pyrimidine base paar uitgewisseld wordt voor een
pyrimidine-purine basepaar of omgekeerd (AT of AC of GT of GC)

! Transities komen vaker voor want bp hebben dezelfde grootte (gemakkelijker door de vingers zien)

, Nikita Cassimon 1e master geneesmiddelenontwikkeling s0184207

Voor coderende:

Silent mutations = nucleotide veranderd waardoor codon veranderd maar het gemuteerde codon
nog steeds codeert voor hetzelfde AZ

Missense mutations = nucleotide veranderd waardoor codon veranderd en codeert voor een ander
AZ

Nonsense mutations = nucleotide veranderd waardoor codon veranderd in een prematuur
stopcodon  Nonsense Mediated Decay

Tweestapsproces om puntmutaties te induceren:

1. Fout van DNA polymerase
2. Mismatch wordt niet hersteld door DNA polymerase of DNA repair mechanismen
Indels

Insertions = extra nucleotide(n) (indien dit in coderend
deel is potentiële leesraam verschuivingen)

Deletions = nucleotide(n) verwijderd (indien dit in
coderend deel is potentiële leesraam verschuivingen)

Oorzaak: afwijkende recombinatie of slippage (= DNA
polymerase gaat op template of nieuw
gesynthetiseerde strand ter plaatse slippen  lusjes
waardoor extra ingebouwd of niet mee gerepliceerd

Frameshift mutaties = leesraam verschuiving/verlies door insertie of deletie  gen codeert niet
meer voor functioneel eiwit + aanleiding tot premature stopcodons

 In frame: 3 nucleotiden of veelvoud  milder
 Out of frame: 1, 2 nucleotiden of veelvoud  ernstiger

Bv. polyQ (Glutamine) - en polyR (Arginine) diseases (hebben natuurlijk een repeat van een aantal
tripletten)

Triplet repeats (herhalingen van 3 bp)

 Normale individuen hebben een klein aantal repeats (20 tot 40)
 Repeats kunnen van generatie op generatie toenemen  PCR en
gelekeltroforese
o Niet-coderend: expressie van het gen stilleggen
o Coderend: negatieve nieuwe functie aan het eiwit toevoegen
 CAG-repeat: poly-glutamine

Dit zijn jouw voordelen als je samenvattingen koopt bij Stuvia:

Bewezen kwaliteit door reviews

Studenten hebben al meer dan 850.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet jij zeker dat je de beste keuze maakt!

In een paar klikken geregeld

Geen gedoe — betaal gewoon eenmalig met iDeal, Bancontact of creditcard en je bent klaar. Geen abonnement nodig.

Focus op de essentie

Studenten maken samenvattingen voor studenten. Dat betekent: actuele inhoud waar jij écht wat aan hebt. Geen overbodige details!

Veelgestelde vragen

Wat krijg ik als ik dit document koop?

Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.

Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?

Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.

Van wie koop ik deze samenvatting?

Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper nikitacassimon. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.

Zit ik meteen vast aan een abonnement?

Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €10,49. Je zit daarna nergens aan vast.

Is Stuvia te vertrouwen?

4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)

Afgelopen 30 dagen zijn er 68175 samenvattingen verkocht

Opgericht in 2010, al 15 jaar dé plek om samenvattingen te kopen

Start met verkopen

Samenvatting

Samenvatting farmaceutische toepassingen van de moleculaire biologie (16/20)

Document informatie

Onderwerpen

Geschreven voor

Verkoper

Ontvangen beoordelingen

Voorbeeld van de inhoud