100% tevredenheidsgarantie Direct beschikbaar na betaling Zowel online als in PDF Je zit nergens aan vast
logo-home
Eerder door jou gezocht
Eerder door jou gezocht
logo
Samenvatting hulpdocument examen bio-informatica €4,49   In winkelwagen
Snel navigeren naar
Voorbeeld
  2.  
  3. Katholieke Universiteit Leuven (KU Leuven)
  4.  
  5. Biomedische Wetenschappen
  6.  
  7. Bio informatica (E06E2B)

Samenvatting

Samenvatting hulpdocument examen bio-informatica
 23 keer bekeken  1 keer verkocht

Dit bestand bevat links naar de websites gebruikt in de les en de syntax gebruikt in jupyter (wel niet van het gedeelte van python) Ik persoonlijk heb gewoon dit document gebruikt tijdens het oefenen thuis en dan op het openboek examen had ik genoeg tijd omdat ik alles hier snel in terug kon vinde...

[Meer zien]

Voorbeeld 2 van de 8  pagina's

Document informatie

  • 10 maart 2024
  • 8
  • 2022/2023
  • Samenvatting

Onderwerpen

Geschreven voor

Alle documenten voor dit vak (15)

Verkoper

avatar-seller
gudrunopdebeeck

Voorbeeld van de inhoud

Websites, links en syntax
Websites en links
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
=entrez gene
FASTA RefSeq, NM_, Nucleotide, Genbank format, Text editor, genexpressie
RefSeq_id = NM… of NP…

https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/home
= europees alternatief van genbank
EMBL formaat
DBfetch

https://www.ebi.ac.uk/Tools/dbfetch/dbfetch?db=ena_sequence&id=L07770&style=raw
geeft rechtstreeks alle informatie van id
id nog aanpassen

https://www.ensembl.org/index.html
gencode annotatie
ENSG: gen-id
ENST: transcript-id
Ortholoog en paraloog predicties
Biomart: lijsten
Ook bv van genenlijst de sequenties downloaden

http://www.openhelix.com/


https://genome.ucsc.edu/
= ucsc
Bv exonen

http://obofoundry.org/
open biomedical ontology

https://www.omim.org/
genetische varianten en hun effecten

https://www.ebi.ac.uk/QuickGO/annotations
gene ontology en annotaties

CELLS.UCSC.EDU
cellxgene.cziscience.com
http://www.ebi.ac.uk/gxa

, gen expressive atlas

https://flybase.org/
alles van fruitvlieg

https://www.informatics.jax.org/
alles van de muis

https://rgd.mcw.edu/
alles van de rat

https://wormbase.org//#012-34-5
alles van de worm

https://zfin.org/
alles van de zebravis

https://www.yeastgenome.org/
alles van gist

https://bio.tools/ecogene
alles van E. coli

https://www.omim.org/
ziektes, phenotypes

sequelpro login
hostname: genome-mysql.cse.ucsc.edu
username: genome
zonder wachtwoord

https://cells.ucsc.edu/
ucsc cell browser
genen van celsoorten vinden
downloaden als gzipt

https://biit.cs.ut.ee/gprofiler/gost
gprofiler
lijst van namen omzetten tot bv alle refseq
functional profiling (data sources, berekent kansen)
functies van genen/cellen te weten komen


Syntax
Opslaan: ctrl s

Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:

√ Verzekerd van kwaliteit door reviews

√ Verzekerd van kwaliteit door reviews

Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!

Snel en makkelijk kopen

Snel en makkelijk kopen

Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, Bancontact of creditcard voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.

Focus op de essentie

Focus op de essentie

Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!

Veelgestelde vragen

Wat krijg ik als ik dit document koop?

Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.

Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?

Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.

Van wie koop ik deze samenvatting?

Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper gudrunopdebeeck. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.

Zit ik meteen vast aan een abonnement?

Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €4,49. Je zit daarna nergens aan vast.

Is Stuvia te vertrouwen?

4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)

Afgelopen 30 dagen zijn er 82191 samenvattingen verkocht

Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen

Start met verkopen
€4,49  1x  verkocht
  • (0)
  Kopen