7.1 Taxonomie
Taxonomie = wetenschappen die zich bezighoudt met de classificatie, nomenclauurr羠 (naamgeving)
en identificatie van de levende organismen.
Bij bacetriën niet evident :
- planten zich meestal asexueel voort
- zijn niet soortgebonden
M.b.v: biochemische, fysiologische en ecologische kenmerken
Tegenwoordig: op basis van evoluteve verwantschap (sysuuematiek) à fylogenetische
ve羠wanuuschap (tot hoeverre deze bacteriën evolutef verwant zijn)
Soo羠uunaam
Binomiale nomenclauurr羠 = elke biologische soort krijgt een naam die uit 2 soorten bestaat.
- Genrs + species
- Altjd in cursief en 1ste leter van de genusnaam: hoofdleter en 1 ste leter van de specienaam: klein
leters Vb: Escherichia (genusnaam) coli(specienaam) à E.coli
- Zegt iets over fysiologische, morfologische en ecologische kenmerken van een organism
Nieuwe bacterie à isolate à onderzoek à bij voldoende verschil à apart species of zelfs genus
à aan isolaauu: nieuwe naam voorgesteld en reincultuur aan ATCC (= cultuurcollecte waarbij alle
gekende stammen bewaard worden)
Va羠iatie binnen species(
Biouuype (ve羠iëuueiuuen):
o variate in biochemische eigenschappen
Se羠ouuype (se羠ova羠os):
o variate in antgenen (bloadtype)
Faaguuype羠ing:
o Bacteriofaagtype alleen zeer specifeke stammen binnen een soort aantasten
7.2 Classificatiesysuuemen
Biologische classificatie
= klassieke manier
à hiërarchisch systeem (door Linneaus):
1. Orde vb.: Eubacteriales
2. Familie vb.: Enterobacteriaceae
3. Genus vb.: Escherichia
4. Species vb.: Escherichia coli
1 en 2: onderscheid op basis van mo羠fologische eigenschappen( vorm, gramkleuring, aanw. v
flagellen,…
3 & 4: onderscheid op basis van meuuabole eigenschappen: fermentates, enzymreactes,…
àUit moleculaire studies: fysiologische en morfologische kenmerken erg zwak om het basis van
fylogenetsche verwantschap
Oplossing: mac羠omolecrlai羠e meuuhoden
Mac羠omolecrlen
Groei moleculaire biologie à nieuwe inzichten van karakterisering
Grote impact op klassieke taxonomie!
Welke molecrlen?
, - Eiwiten
- Veten en vetzuren
- DNA!
1. Eiwiuupauu羠oon
= Belangrijk aandeel in cel (50%)
à Grote verscheidenheid
= afhankelijk v kweekomsuuandigheden
Onde羠zoek(
1. Eiwiten spliuusen m.b.v. detergent
2. Subeenheden scheiden m.b.v. gelelecuu羠ofo羠ese
3. Pauu羠oon specifiek voor een bacterie
4. Identificatie
Belangrijk: gestandaardiseerde kweekomstandigheden
1. Veuuzrr羠pauu羠oon
Vetzuursamenstelling cel à specifek per stam
= Afhankelijk van kweekomsuuandigheden
m.b.v. gasch羠omauuog羠afie
= snel, betrouwbaar & geautomatseerd en grote databanken als refrente beschikbaar
2. Signauur羠e lipid bioma羠ke羠s (SLBs)
Sommige groepen bacteriën bevaten zeer specifieke SLB’s(
Vb: steroïden, diglyceriden, triglyceriden, ademhalingsquininen, lipopolysaccharide
hydroxyvetzuren, polyhydroxyalkanoaten en fosfolipiden veuuzr羠en (PFLA)
PFLA à vaak gebruikt: voor de identfcate van stammen en detecte van levende organismen in
milieumonsters.
Analyse eiwiten, peptiden en polyme羠en
1. Kolonie op een plaatje en behandeld met matrix
2. Kristallisate
3. Bestraling met laser (desorpte +ionisate)
4. Massaspectrometer: bepaling massa
5. Vergelijking met bekende profelen
6. Identfcate
DNA-onderzoek
= onafhankelijk van milier-omsuuandigheden
Ve羠schillende analysemeuuhoden(
G+C gehalte DNA
Hybridisate
Seqentebepaling DNA
1. G + C gehaluue analyse
G≡C ↔ A=T
à G ≡ C hangt sterker aaneen (meer temperatuur nodig om deze los te maken)
Co羠羠elaties uurssen bacuue羠iën(
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
√ Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, Bancontact of creditcard voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper fariha1234567. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €3,49. Je zit daarna nergens aan vast.