Dit document omvat de samenvatting (info slides + lesnotities) van les 9 van het vak 'genome technology and applications'. Les 4 was gewoon een inleiding van NGS voor de taak. Hierbij moet je in groep een presentatie geven over een bepaalde NGS techniek.
Induced pluripotent stem cells (iPSCs)
1. What
Stem cells
- Can divide and create an iden-cal copy of themselves, a process called self-renewal
- Can differen-ate/mature into cells that make up every type or several types of
-ssue(s) and organ(s) in the body, a process called
pluripotency/to-potency/mul-potency
o Pluripotent: differen-ate to many other celtypes
o To-potent: differen-ate to all celtypes
o Mul-potent: selec-on of celtypes
Potency
- Different types:
o Early embryonic cells – to-potency
§ First cells created -> generated placenta and embryo-c cells
o Embryonic stem cells – pluripotency
§ AJer one week you have cells surrounding the the embryo
o Adult stem cells: e.g., hematopoie-c stem cell – mul-potency
§ Differen-ate to certain celtypes
o Induced pluripotent stem cells – pluripotency
Induced
- You start from a soma-c cell -> bring them back to a stem cell
- You add Yamanaka cells
IPSC discovery
- Different TF will bring your soma-c cells back to stem cells
- Human IPSC
o Start from fibroblast
o Couple of TF that are crucial
o It needs to be able to form 3 germ layers
2. How?
IPSC crea5on
Soma,c cells
- Start from fibroblast
- Puncture skin
o Advantages: easily to get
o Disadvantage: for some people it is s-ll to invasive and UV exposure
§ Muta-on from sun exposure is and you don’t want this
- Alterna-ves
Yamanaka factors
- 4 factors
- Different hypothesis how it is possible to go to stem cells with only 4 factors
o S-ll need to be inves-gated
, - How do you get them in
o Integrated in the genome
§ You can do it with viral methods
• + transduc-on efficiency
• + You can do it for dividing and non-dividing cells
• - Random integra-on in te genome -> disadvantage
o cMyc is a oncological driver -> can be a problem, oncological
proper-es
• - Reac-va-on of transgene
§ Non viral methods
• - Nucleofec-on/transfec-on efficiency
• - They can also re-integrate in the genome
o Non-integra-ve system
§ Viral
• It can stay quite long in the cell -> it taked quite of passages to get it out
or you can do a heat shock
• Good transduc-on efficiency
§ Non-viral
• Effect is gone quite rapidly
• Transient
• Lower reprogramming efficiency
-
Valida,on
iPSC-specific
- Morphology: visual inspec-on of colonies
o Group of cells that are iden-cal = colony
o Well defined boarder without spikes
o Cells -ghtly packed
o Ra-o of the nucleus in comparison with the cytoplasm is very high
o Nucleoli are very prominent
o Bright center in the middle
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
√ Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, Bancontact of creditcard voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper evagoormans. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €7,16. Je zit daarna nergens aan vast.
