Summary Molecular Biology of the Cell (5234MOBC6Y) partial exam 1+2
Notes for all lectures of cell metabolism and metabolic control
Cellen en Weefsels hoofdstuk 6 Transcriptie en RNA processing
Alles voor dit studieboek (21)
Geschreven voor
Universiteit Utrecht (UU)
Biologie
Cellen en Weefsels
Alle documenten voor dit vak (80)
Verkoper
Volgen
thomvd
Ontvangen beoordelingen
Voorbeeld van de inhoud
Cellen en weefsels – DT2
Hoofdstuk 13: Intracellular membrane traffic
Voordelen intracellulaire compartimenten:
-verschillende milieus
-lysosomen hoge zuurgraad -> functionaliteit enzymen
-membraanvergroting
-ER groot bij cellen die veel secretie doen
-geconcentreerde reactanten -> substraten/enzymen/cofactoren
Wat maakt compartimenten verschillend:
-eiwitcompositie
-lipidecompositie
-pH en ionische concentraties
Transport tussen componenten endomembraansysteem is vesiculair
-maakt uitwisselen componenten mogelijk zonder identiteitsverlies
-lumen meeste compartimenten zijn topologisch gelijk aan elkaar en de buitenkant van de cel
-secretie: eiwitmoleculen van ER -> endosomen -> lysosomen of van ER -> plasmamembraan
-endocytose: plasmamembraan -> endosomen -> (late endosomen -> lysosomen
Monomerische GTPases van de Rab familie controleren vesiculair transport en docking
-effectors: motoreiwitten, tethers, membraan fusie eiwitten
-GEFs: guanine exchange factor (activator) -> RabA membraan patch assembly
-RabA rekruteert ook GEF voor RabB -> RabB rekruteren op membraan
-hierbij zit ook een GAP voor RabA
-GAPs: GTPase activating protein (inactivatie) -> RabA GTP hydrolyse
-RabA membraan patch valt uit elkaar en vervangen door RabB
-volgende GEF door RabB vervolgt sequentie
-cascades aan eiwitactivaties/inactivaties
-elk compartiment heeft een eigen Rab -> sorteren organellen
1
,Eiwit specifiteit in endomembraan compartimenten: Rab eiwitten
-v-SNARE (vesicle) & t-SNARE (targeting)
-integrale membraaneiwitten
-moeten samenkomen voor fuseren membraan
-Rab-GTP (Rab eiwit) wordt herkent door tethering eiwitten (Rab effector) en vesicles kunnen docken
-conformatieverandering (GTP -> GDP) door Rab GAP brengt vesicle bij membraan
-dan kunnen v-SNARE met t-SNARE interactie aangaan
-Rab-GDP dissociatie inhibitor (GDI) bindt Rab-GDP zodat deze weer geactiveerd kan worden
-Rab3A, Rab5, Rab7 onthouden
Exocytose synaptische vesicles: via SNARES
-trans-SNARE (SNAP25 + syntaxin) complex dockt vesicle op plasmamembraan via v-SNARE
(synaptobrevin)
-synaptotagmine (Ca2+ sensor) en complexin moduleren de SNARES
-openen bij binden Ca2+ en halen block eraf
2
,Vorming Rab5 domein op endosoom membraan
-inactieve Rab5-GDP geactiveerd door Rab5-GEF (GDP->GTP, GDI laat hierbij los)
-conformatieverandering en membraaninsertie Rab5-GTP
-mogelijk door lipide groep die vrijkomt
-actieve Rab5 activeert PI3 kinase -> PI(3)P formatie vanuit PI (fosfaatgroep op lipide)
-Rekruteren meer Rab-5-GEF (positieve feedback)
-Rekruteren Rab effector eiwitten (bv. Tethering)
-hierdoor Rab5-geassocieerde membraan patch
-cyclus GTP hydrolyse en GDP-GTP uitwisseling reguleert Rab patches
Verschillende fosfatidylinositol lipiden markeren organellen en membraandomeinen
-plextrine homologie (PH) domein bindt specifieke fosfolipiden
-hiermee lokalisatie weergeven
-een individueel transport vesicle fuseert hierdoor met één type membraan
-bv. Secratory vesicles: PI(4)P fuseren met membraan als PI-5-Kinase dit omzet in PI(4,5)P2, deze
rekruteert adaptines die de clathrine-coated pit vormen -> PI(5P)-fosfatase hydrolyseert PI(4,5)P2 en
verzwakt binding waardoor vesicle uncoating begint
3
, Lipide rafts zijn plekken in een cel met bepaalde functie
-hierin liggen phosphatidylinositol lipiden georganiseerd
-1:1:1 mix van phosphatidylcholine, sphingomyeline en cholesterol lokaliseren zich in lipide domeinen
(rafts)
-rood cirkeltje in afbeelding = raft
-dit gebeurd dus ook in gewone cellen
Phosphatidyl inositol lipiden
-glycerol backbone met 3 OH (hydroxyl) groepen
-twee vetzuurstaarten
-3’ positie zit een fosfaatgroep met inositol
-positie 3-4-5 glycerol backbone van inositol worden gefosforyleerd -> PIP2
-meestal PI(4,5)2
-via fosfatases (groen – bv. PI 3-Kinase PIP2 -> PIP3) en kinases (rood - bv. PI 3-Kinase door
Rab5)
-vaak specifieke kinases/fosfatases bij verschillende
membraandomeinen/compartimenten
-na vormen samenstelling blijft deze bestaan
4
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
√ Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, Bancontact of creditcard voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper thomvd. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €8,96. Je zit daarna nergens aan vast.