Deze samenvatting combineert de aanvullende informatie die tijdens de lessen door de docent is gegeven met het handboek "Principles of Biochemistry eight edition" door David L. Nelson en Michaem M. Cox
3. aminozuren, peptiden en eiwitten
3.1 aminozuren
- chiraal (behalve Gly)
- 20 AZ basis voor eiwitten (= covalent gebonden AZ)
- L-stereoisomeren (aminogroep links) zijn per toeval meer abundant
- klassiek 5 groepen
1) apolair
- Gly G, Ala A, Pro P, Val V, Leu L, Iso I, Met M
- hydrofobe interacties
2) aromatische
- Phe F, Tyr Y, Trp W
- Trp, Tyr: absorberen licht → absorptie van eiwitten bij 280 nm
- Wet van Lambert-Beer: absorptie
log(I0/I)= epsilon*c*l
3) polair, ongeladen
- Ser S, Thr T, Cys C, Asn N, Gln Q
- meer wateroplosbaar door H-bruggen
, 4) positief geladen zijgroepen
- Lys K, His H, Arg R
5) Negatief geladen zijgroepen
- Asp D, Glu E
verder: 300 AZ niet in eiwitten: ze zijn niet proteïnogeen
- 4-hydroxyproline: afgeleid van Pro, planten CW, collageen
- Selenocysteine (Sec, U): afgeleid van serine
- Ornithine,citruline:intermediairen in arginine synthese en ureumcyclus
⇒ post-translationele modificatie
- reageren als zuren en basen
- in water ⇒ zwitterion (zowel pos als neg lading) (amfoteer of amfolyt)
pI= iso-elektrisch punt=pH waar de
nettolading 0 is
,3.2 peptiden en eiwitten
- peptide: ketens van AZ
- condensatie reactie
- N → C-terminus
(ook AZ sequentie qua naamgeving)
- verbreken peptidebinding is exotherm
- veel proteine bestaan enkel uit AZ groepen, maar sommige
- geconjugeerde proteïnen: proteïnen die een permanente associatie van een
niet-AZ groep bevatten
- niet-AZ groep = prosthetische groep
- vb: lipoproteines: lipids
- glycoproteine:suikers
- metalloproteins: metalen
3.3 werken met eiwitten (EXAMEN: methodiek kennen, met voor- en nadelen)
.eiwitten kunnen worden gescheiden en gezuiverd
- eiwitten kunnen worden gescheiden en gezuiverd
1) extractie: breken weefsels/cellen in een buffer (zodat de proteine in de cel vrijkomen)
- differentiële centrifugatie: scheiding naar densiteit
- stapsgewijze scheiding door de snelheid op te voeren (lichte en zware
fractie)
- snelheid opvoeren ⇒ zware deeltjes sedimenteren
, - kolomchromatografie
- vaste (stationaire) fase: poreuze matrix
- mobiele fase: vloeistof, beweegt door matrix
- bewegingssnelheid afh van eigenschappen
- fractioneren= scheiden eiwitmengsel in fracties
- de proteine opl vormt een band door diffusie spreiding ⇒ bandverbreding,
maar dit zorgt voor een verdunning (nadeel)
- separatie verbetert naarmate de lengte groter wordt(en ook de
verdunning is minder)
- ionenuitwisselingschromatografie
- interactie geladen eiwitten met matrix
- matrix synthetisch polymeer met geladen groepen
- kationen uitwisseling: matrix met anionen
- anionen uitwisseling: matrix met kationen
- scheiding afh van pH van opl
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
√ Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, Bancontact of creditcard voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper YLilla. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €3,49. Je zit daarna nergens aan vast.
