Samenvatting
samenvatting biochemie hoofdstuk 1 en 2
met deze samenvatting was ik ruim geslaagd
[Meer zien]Voorbeeld 2 van de 5 pagina's
Voorbeeld 2 van de 5 pagina's
In winkelwagenVerkoper
Volgen
Voorbeeld van de inhoud
1: Zwakke krachten tussen biomoleculen- Covalente bindingen
- Zwakke, x-covalente bindngen:
1.1 ionaire of elektrostatische aantrekking of zoutbrug
- Anion en kation trekken elkaar aan
- Sterkte w gegeven door wet van coulomb
o F is recht evenredig met de ladingen
o F is omgekeerd evenredig r2 en
dielektriciteitsconstante D
D = 1 in luchtledige, en D = 80 in water: water zwakt aantrekkingskracht af
- 33kJ/mol en 4A
- De zijketens van deze AZ zijn geladen bij fysiologische pH
- Tussen polaire molec of polaire functionele groepen met partiele ladingen zal ook
aantrekking optreden dipool-dipoolkracht of keesomkracht
o F is recht evenredig met het product van de nettodipoolmomenten vd molec
o F is omgekeerd evenredig met r3
- Komen voor in watervrije omgeving in biomolec
1.2 waterstofbruggen
- elektrostatische aantrekking waarmee watermoleculen elkaar aantrekken
- kan ook tussen moleculen met geschikte functionele groepen waarin atomen elektronegatief
karakter hebben
- in biomolecule tussen:
o O-H en N-H groepen (waterstofbrugdonoren)
o Elektronegatieve atomen N en O (waterstofbrugacceptoren)
(met nog vrij elektronenpaar ter beschikking) oefent aantrekking uit op H
- vb: alcohol en aminogroep
o hebben beide H gebonden op O of N en een vrij elektronenpaar op O of N
hierdoor vormt zich:
een sterk +partiele lading op H
sterk – lading io N of O
op basis hiervan is er aantrekking, zonder e_ uitwisseling
- naargelang betrokken groepen varieert de lengte (2,6-3,1Å) van de binding en energie
(10-30 kJ/mol)
- 40x minder sterk dan cov
- sterkte binding hangt af van positie van
deelnemende atomen tov elkaar (lineaire
waterstofbruggen zijn sterkst)
- belangrijk bij stabiliseren van
structuurelementen in eiwitten (𝛼-helix
vormt H-bruggen)
1
, - vormen basis van interacties tussen complementaire basen van DNA of RNA
1.3 van der Waals krachten of Londonkrachten
- Tussen apolaire/hydrofobe molec kan een dipool geinduceerd worden aantrekking
- mogelijk door: verdeling van de elektronen rond atomen varieert in functie van de tijd en
altijd asymmetrisch
- Aantrekkingskracht afhankelijk van afstand tussen twee atomen: elk atoom neemt
volume in (bepaal door van der Waals radius = afstand tussen kern en effectieve
oppervlak van de elektronen)
- twee atomen naderen te dicht = afstoting (dringen elkaars volume binnen), te ver weg van
elkaar dan kracht sterk verminderen
- optimale afstand voor maximale interactie
de som van de van der Waals radius van betrokken atomen
(2x afstand van covalente binding (3-4Å)
- energie = 4kJ/mol (gering maar nog steeds belangrijk)
- complementaire stapeling van passende oppervlakken:
herkenning en binding van juiste partnermoleculen of
intramoleculaire herkenning bij opvouwing van eiwitten
1.4 het effect van water op zwakke aantrekkingskrachten
- water is polair
o O zuigt gemeenschappelijk elektronenpaar naar zich toe
er ontstaat een permanent dipool
- Iedere watermolec kan 2 maal als donor en acceptor optreden waterstofbruggen
- 20kJ/mol en bij cov binding tss O-H 1.2A en bij Hbrug 2.7A
- doordat Hbruggen continu uitwisselen ontstaat er een dynamisch netwerk H2o = cohesief
- goed solvent voor polaire moleculen en ionen
ze worden gehydrateerd: ze krijgen een watermantel doordat H-molec ermee via x-cov
(Hbrug,dipoolkrachten) wijze ermee in interactie gaan
- water is ideaal solvent maar werkt ook competitief vs x-cov interacties tussen geladen molec
o door mantel worden ladingen van de groepen afgeschermd
ionaire interacties en Hbruggen tussen biomolec w afgezwakt in water
1.5 het hydrofoob effect
- hydrofobe interacties: apolaire/hydrofobe verbindingen zijn moeilijk oplosbaar in water
energetisch ongunstig (waternetwerk wordt verstoord)
- watermoleculen fixeren rond hydrofobe molec meer orde entropie daalt
vrije energie van systeem stijgt-
- meerdere hydrofobe moleculen gaan associëren zodat totale hydrofobe oppervlakte verkleint
associatie komt door slechte oplosbaarheid in water
2
Dit zijn jouw voordelen als je samenvattingen koopt bij Stuvia:
Bewezen kwaliteit door reviews
Studenten hebben al meer dan 850.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet jij zeker dat je de beste keuze maakt!
In een paar klikken geregeld
Geen gedoe — betaal gewoon eenmalig met iDeal, Bancontact of creditcard en je bent klaar. Geen abonnement nodig.
Focus op de essentie
Studenten maken samenvattingen voor studenten. Dat betekent: actuele inhoud waar jij écht wat aan hebt. Geen overbodige details!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper faialsouleymane. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €6,49. Je zit daarna nergens aan vast.
Is Stuvia te vertrouwen?
4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)
Afgelopen 30 dagen zijn er 69052 samenvattingen verkocht
Opgericht in 2010, al 15 jaar dé plek om samenvattingen te kopen