Overig
Practicumverslag MoBi 2
- Instelling
- Universiteit Gent (UGent)
Practicumverslag voor het vak MoBi 2
[Meer zien]Voorbeeld 2 van de 5 pagina's
Voorbeeld 2 van de 5 pagina's
In winkelwagenVoorbeeld van de inhoud
Academiejaar 2020-2021_Online versie BMW Ba3Instructies & verslag bij PRACTICUM II:
LEPTINE-LEPTINERECEPTOR-INTERACTIE: experimenteel deel
en literatuurstudie
VERSLAG in te dienen met deze wordfile als template na aanvullen, indienen als wordfile via
opdracht in ufora door student met naam 1.
Studenten (alfabetisch aub):
1: Over Leptine
Lees de start van de practicumnota’s: p 1-2 inleiding en doel van het practicum.
2: Dubbel DOEL en experimentele strategie
Materiaal: Practicumnota’s p 3-5 en VIDEO PII-A (over doel en strategie)
Je kiest zelf in welke richting je dit doet.
● Ofwel lees je eerst p 3-5 in de nota’s door en gebruikt de video (20 min in speed 1x) ter
vervollediging van je inzicht in de experimentele strategie.
● Ofwel bekijk je de video met de nota’s erbij en evalueer je daarna voor jezelf door nalezen
nota’s of je doel en strategie volledig doorhebt.
3: Experimentele uitvoering
Materiaal: practicumnota’s p6-7; PII-Video B
Bekijk PII-Video B samen met de nota’s (15 min in speed 1x). De video toont aan de hand van foto’s
met commentaar de stappen zoals je ze zou gezien hebben tijdens het eigenlijke experiment. Vanuit
jullie practicumervaring uit vorige jaren (e.g. Algemene Biochemie en MOBI II, sem 1 Ba 2) laat dit
hopelijk toe het practicum toch in enige mate te ‘ervaren’
Van Video A en B is ook de pdf van de ppt op ufora aanwezig
IN VERSLAG:
A. Beschrijf in verslag in max. twee zinnen wat gebeurt tijdens de incubatie in stap 3.
Tijdens de incubatie in stap 3 worden bindingen (of een complex) gevormd tussen het fusie-EW
(leptine-SEAP) met de leptine-bindende domein(en) van de leptine-receptor.
B. Beschrijf in verslag in max. twee zinnen wat gebeurt tijdens de incubatie in stap 6.
Tijdens het incuberen in stap 6 zullen de Co 2+-ionen, die gedragen worden door de sepharose-
parels, kunnen binden aan de poly-His-tags van de leptine-bindende receptoren.
C. Beschrijf in verslag in max. twee zinnen wat gebeurt tijdens de incubatie in stap 17.
Tijdens de incubatie in stap 17 zal het alkalisch-fosfatase enzym (aanwezig als fusie-eiwit leptine-
SEAP) het substraat para-nitrofenylfosfaat (PNF) omzetten in het gele para-nitrofenol. Dit gebeurt
enkel als leptine-SEAP gebonden is op het receptor fragment.
1
, Academiejaar 2020-2021_Online versie BMW Ba3
4: Beschrijving van resultaat
A. Beschrijf het resultaat (de waarneming) (zie Video B of pdf_videoA/B)
We detecteren een gele kleur in volgende epjes: A, D en E.
Epje A kunnen we verklaren doordat dit epje het volledig extracellulair domein van de
leptine-receptor bevat. Epje D bevat het cytokine receptor homologie domein 2 (CRH2) +
Ig. Epje E bevat het cytokine receptor homologie domein 2 (CRH2).
B. Beantwoord op basis van dit experiment: Welk(e) domein(en) van de leptine-receptor is
van belang in de interactie met leptine
Het CRH2-domein van de leptine-receptor is van belang in de interactie met het leptine-
ligand. Het Ig-domein niet, omdat deze ook aanwezig is in epje C en in dat epje geen gele
kleur gedetecteerd werd.
5. Wetenschappelijke publicatie: informatie extraheren
omtrent de kennis en modellen van de leptine-
leptinereceptorinteractie
Publicatie (zie pdf op ufora); Video PII_C (6 minuten, speed 1x)
20 years of leptin: insights into signaling assemblies of the leptin receptor.
Peelman F, Zabeau L, Moharana K, Savvides SN, Tavernier J.
J Endocrinol. 2014 Oct;223(1):T9-23. doi: 10.1530/JOE-14-0264. Epub 2014 Jul 25.
Lees de review op een gerichte wijze in functie van het oplossen van onderstaande vragen; gebruik de
verwijzingen hieronder om gericht te lezen.
Laat je vooral leiden door de aanwezige figuren (overloop deze bij start behalve Figuur 3).
Afkortingen: L: leptine; LR: leptinereceptor, ecto_LR: extracellulair deel van de leptinereceptor.
A. Bespreek de tertiaire structuur van het ligand Leptine (L).
Focus hierbij op de aanwezige secundaire structuurelementen en hun topologie en op
mogelijk extra stabilisatie van de opvouwing (geen details).
Gebruik Figuur 1 en bijhorende tekst op pagina T11.
Leptine bestaat uit vier anti-parallelle α-helices (A, B, C en D) in een up-up-down-down
schikking. Zowel tussen parallelle helices A en B als tussen de parallelle helices C en D is
er een lange lus aanwezig. De anti-parallelle helices C en D zijn verbonden met een korte
lus. De lange CD lus bevat een extra helix E. De opvouwing wordt extra gestabiliseerd
door een disulfidebrug tussen de C-terminus van helix D en de CD lus.
B. Bespreek de gekende of gemodelleerde tertiaire structuur van de domeinen van het
extracellulair deel van de Leptine receptor ecto_LR.
Beschrijf hier enkel de belangrijke secundaire structuurelementen en de topologie (geen
details). Vermeld ook algemeen het voorkomen van mogelijk extra stabilisatie van de
opvouwing en covalente modificaties (geen details!).
2
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
√ Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, Bancontact of creditcard voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper marievancaenegem. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €4,49. Je zit daarna nergens aan vast.
Is Stuvia te vertrouwen?
4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)
Afgelopen 30 dagen zijn er 53340 samenvattingen verkocht
Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen