Summary
Samenvatting Biochemie course 5 blok 2
- Course
- Institution
Samenvatting lessen Biochemie van course 5 gegeven in blok 2
[Show more]
Seller
Follow
linngeubbels
Content preview
Samenvatting biochemieNaamgeving van eiwitten
- Naamgeving start bij het amino terminale uiteinde
- 3 vormen
o Volle namen gebruiken
Serylglycyltyrosylalanylleucine
Alleen laatste eiwit krijg volledige naam
o De 3 letter code gebruiken
Ser-Gly-Tyr-Ala-Leu
o Bij lange peptides de letter kan gebruikt worden
SGYAL
Aminozuur classificatie
- Gemeenschappelijke aminozuren kunnen in vijf basisgroepen
worden ingedeeld afhankelijk van hun R-substituenten
o Apolair, alifatisch (7)
o Aromatisch (3)
o Polair, ongeladen (5)
o Positief geladen (3)
o Negatief geladen (2)
- Alle aminozuren behalve glycerine zijn chiraal
o Kunnen gespiegeld worden
o L en D kant
- Verschillende classificaties kunnen worden toegepast:
o Polar (maar ongeladen): Cys, Asn, Gln, Ser, Thr, Tyr
o Niet-polair: Ala, Leu, Ile, Val, Met, Phe, Trp, Gly en Pro
o Alcoholische: Ser, Thr, Tyr
o Zwavelbevattende: Met, Cys
o Aromatische: Phe, Tyr, Trp
o Polar geladen: Asp en Glu (zuur); Arg, Lys, His (basis)
o Speciale: Gly (geen R), Pro (cyclisch, iminozuur)
Apolaire, alipatische R groepen
,Aromatische aminozuren
- Tyrosine is polair, fenylalanine en tryptofaan zijn apolair
- De zijketens van deze aminozuren absorberen UV-licht bij 270-280 nm
Polair ongeladen eiwitten
- De zijketens van deze aminozuren kan waterstofbruggen vormen
- Cysteïne kan disulfidebruggen vormen
Positief geladen eiwitten
- Histidine R-groepen zijn belangrijk voor bufferen van de pH in het bloed
o Histidine R-groepen gecoördineerd maken bindingen met Ni2+-ionen
- Positief geladen R-groepen zijn positief geladen als de pH lager is de pKR-waarde
- De pKR-waarden van Lys, Arg en His zijn resp. 10,5, 12,5 en 6,0;
o Bij pH = 7 zijn de R van Lys en Arg positief geladen, maar niet van His
Positief geladen eiwitten Negatief geladen eiwitten
, Zuren en basen
- Aminogroepen en carboxylgroepen kunnen protonen accepteren en protonen doneren
o Functioneren als zwakke zuren en basen (bijvoorbeeld te vergelijken met azijnzuur) •
o Bij lage pH zijn alle groepen volledig geprotoneerd
o Bij hoge pH doneerden alle groepen hun protonen
o Bij neutrale pH vormen ze dipolaire zwitterionen
Geen netto lading
pH afhankelijke lading van aminozuren
- In een zure omgeving alle groepen zijn in zure vorm
o R-NH3 + and R- COOH
- In een basische omgeving alle groepen zijn in basische vorm
o R-NH2 and R- COO-
- pKa : zuurdissociatieconstante; PH waarde; hoe lager de pKa , de sterker de neiging om een
proton te dissociëren
- pK(a)1 van aminozuur:
o De pH waarbij 50% van de protonen wordt gedissocieerd van de COOH-groep
o
o pK-waarden van carboxylgroepen van de meeste aminozuren liggen rond de 2
negatieve lading boven pH 2 (boven pK1 )
- pK(a)2 van aminozuur:
o De pH waarbij 50% van de NH2-groepen geprotoneerd zijn:
o
o pK-waarden van aminogroepen van de meeste aminozuren liggen rond de 9-10 →
positieve lading onder pH 9-10 (pK)
- Zwitterionen overheersen bij pH-waarden tussen de pKa-waarden van de amino- en
carboxylgroepen
- Voor aminozuren zonder ioniseerbare zijketens, het Isoelectric Point (equivalentiepunt, pI) is:
o Op dit punt is de netto lading nul
AA is het minst oplosbaar in water
AA migreert niet in elektrisch veld
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller linngeubbels. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for CA$9.99. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
53022 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now