100% satisfaction guarantee Immediately available after payment Both online and in PDF No strings attached
logo-home
Microbiologie labo: identificatie van een onbekende bacterie CA$5.40   Add to cart

Other

Microbiologie labo: identificatie van een onbekende bacterie

 21 views  0 purchase
  • Course
  • Institution

In het kader van het practicum Microbiologie was het doel om een onbekende bacterie te identificeren, die afkomstig was van een zelfgekozen contaminatiebron. Wij kozen het speeksel van een Hollandse herder genomen. Uit een gemengde cultuur werd één soort geïsoleerd om een reincultuur op te k...

[Show more]

Preview 2 out of 15  pages

  • January 12, 2024
  • 15
  • 2023/2024
  • Other
  • Unknown
avatar-seller
Biochemie & Biotechnologie
Groepsnummer 10
Maud Debaene, Solène Lemaire, Cara Mestdag, Lorn Vanderperren


Microbiologie - [G0N16a]
Identificatie van een onbekende bacterie uit het speeksel van een Hollandse Herder


1. Abstract
In het kader van het practicum Microbiologie was het doel om een onbekende bacterie te identificeren, die afkomstig
was van een zelfgekozen contaminatiebron. Hiervoor werd het speeksel van een Hollandse herder genomen. Uit een
gemengde cultuur werd één soort geïsoleerd om een reincultuur op te kweken. Verschillende testen, waaronder
visuele testen en het gebruik van selectieve media zoals de ureasetest en de mannitol-zout-agarplaat (MSA-plaat),
werden uitgevoerd om de metabolische activiteit van het onbekende organisme te achterhalen. Morfologische
karakterisering gebeurde door microscopische en macroscopische onderzoeken met kleuringen en selectieve media.
Ten slotte werd DNA-barcoding toegepast als laatste stap om de onbekende bacterie te identificeren, waarbij
polymerase chain reaction (PCR) werd toegepast op het 16S ribosomaal RNA. Op basis van onze bevindingen
concluderen we dat de onbekende bacterie waarschijnlijk Stenotrophomonas rhizophila sp. is.




2. Inleiding
Micro-organismen, waaronder bacteriën, vormen een onmisbaar onderdeel van onze wereld. Hun veelzijdige
functies reiken ver tot de kern van ons bestaan en vinden toepassingen in diverse domeinen, waaronder de natuur,
wetenschap, gezondheid en technologie.

Dit onderzoek richt zich op de identificatie van een onbekende bacterie, afkomstig uit het speeksel van een
Hollandse Herder. Gedurende zes practica hebben we uitgebreide testen uitgevoerd met als voornaamste doel de
identificatie van de onbekende bacterie. Door een combinatie van experimenten hebben we getracht de
karakteristieken van de bacterie te ontrafelen, wat essentieel is voor een nauwkeurige identificatie.

We vermoeden dat de onbekende bacterie afkomstig is uit de mondflora. De Hollandse Herder ervaart tandplak, wat
deels veroorzaakt wordt door de fermentatie van suikers tot zuren en andere metabolieten. Op basis hiervan
veronderstellen we dat de onbekende bacterie suikers kan fermenteren.

Dit onderzoek draagt bij aan de wetenschappelijke nieuwsgierigheid over microbiële diversiteit en heeft praktische
relevantie door het identificeren van één specifieke bacteriesoort.




1

, 3. Methoden
3.1 Microbiële staalname van Hollandse Herder
Met een steriel werkvelddoek uit een wondzorgset werd speeksel afgenomen uit de mond van een
Hollandse Herder en vervolgens in het laboratorium overgebracht naar een gemerkte
tryptische soja- agarplaat (TSA- plaat). Dit gebeurde door met 70 % ethanol ontsmette handschoenen eerst
de contaminatiebron aan te raken en vervolgens over de plaat te wrijven. De TSA-plaat werd gedurende
drie dagen geïncubeerd bij 25 °C om de mogelijk aanwezige micro-organismen te laten groeien.


3.2 Reincultuur maken
Één kolonie werd geselecteerd op de TSA-plaat (Bijlage Figuur 1) en overgeënt met een steriele oogentnaald
op een nieuwe gemerkte TSA-plaat via streepentingen (strijkplaatmethode). Daarna volgde een incubatie
van drie dagen bij 25 °C om de reincultuur op te kweken.


3.3 Differentiële en selectieve media
Er werd telkens één kolonie uit de reincultuur (Bijlage Figuur 2) overgeënt naar een gemerkte
mannitol- zout-agar (MSA) (Bijlage Figuur 3) en een gemerkte MacConkey-agar (Bijlage Figuur 4) via
streepentingen. Vervolgens volgde een incubatie van twee dagen bij 37 °C. Het resultaat gaf aan of de
bacterie mannitol en/of lactose fermenteerde.

De MSA-plaat bevatte een medium met een hoge zoutconcentratie, samen met mannitol en een pH-indicator
fenolrood. Bij fermentatie worden zuren gevormd, waardoor de agarplaat geel kleurt.

De MacConkey-agar bevatte lactose, galzouten, kristalviolet en de pH-indicator neutraalrood. Wanneer
bacteriën zuren produceren door lactosefermentatie wordt de plaat rood. Zonder lactosefermentatie zal de
agarplaat geel en transparant zijn. Daarnaast is de MacConkey-agar selectief voor gram-negatieve bacteriën.


3.4 Kleuringen
3.4.1 Enkelvoudige kleuring
Op een gemerkt draagglaasje plaatsten we een druppel water, waarna we met een steriele entnaald het
inoculum met de druppel vermengden en uitsmeerden tot een diameter van twee centimeter. Vervolgens
droogde het preparaat aan de lucht, waarna drie druppels methyleenblauw werden toegevoegd. Deze
kleurstof kleurde de cellen, waardoor de structuur van de cel zichtbaar werd. Na drie minuten spoelden
we de overmaat aan kleurstof voorzichtig weg met kraantjeswater. Ten slotte droogden we het
droogglaasje en bekeken we het onder de lichtmicroscoop met vergroting 6,5 (Bijlage Figuur 5).

3.4.2 Negatieve kleuring
Op een gemerkt draagglaasje plaatsten we een druppel nigrosine, waarna we met een steriele entnaald
het inoculum met de druppel vermengden en uitsmeerden door een dekglaasje. Vervolgens droogde het
preparaat aan de lucht en bekeken we het onder de lichtmicroscoop met vergroting 6,5
(Bijlage Figuur 6).
2

The benefits of buying summaries with Stuvia:

Guaranteed quality through customer reviews

Guaranteed quality through customer reviews

Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.

Quick and easy check-out

Quick and easy check-out

You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.

Focus on what matters

Focus on what matters

Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!

Frequently asked questions

What do I get when I buy this document?

You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.

Satisfaction guarantee: how does it work?

Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.

Who am I buying these notes from?

Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller caramestdag. Stuvia facilitates payment to the seller.

Will I be stuck with a subscription?

No, you only buy these notes for CA$5.40. You're not tied to anything after your purchase.

Can Stuvia be trusted?

4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)

81311 documents were sold in the last 30 days

Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now

Start selling
CA$5.40
  • (0)
  Add to cart