HOOFDSTUK 1
Leven Afgescheiden, Communicatie staat
energieopname en door communicatie
verbruik, groei, tussen levensvormen
voortplanting, gelijkt aan
beweging, interpretatie biodiversiteit
van prikkels en
communicatie e
Genen Coderen voor erfelijke
eigenschappen
Experiment van Het kruizen van Waarneembare
Mendel erwtenvarieteiten eigenschappen zijn
overerfbare eenheden,
een individu bestaat uit
twee gekoppelde
genen en genen zijn
dominant, recessief of
intermediair.
Garrod Alkaptonurie De urine van babies Is recessief en komt
kleurt zwart door een defect,
waardoor de urine
hoge concentraties
homogentisinezuur
bevat.
Chromosomen De dragers van genen
Cel fractioneren Detergent, lossen de Mechanisch, sonicatie
celmembranen op of mixer
Di erentiële Opvoerende G kracht Kleine organellen
centrifugatie worden naar de bodem
gedreven
Densiteitscentrifugatie Verschil in densiteit Sucrose Organellen migreren
naar de sucrose
oplossing die
overeenkomt met de
eigen densiteit
Gri th experiment S en R stam bij S en gedood S + R Conclusie is dat
longontsteking in zorgen voor de bacteriën de dragers
muizen ontsteking, enkel R of van genen uit de
gedood S niet omgeving kunnen
opnemen en dat genen
vervat zitten in DNA
Hershey-Chase E.coli geïnfecteerd met Bijvoegen van 32P of Besluit is dat DNA
bacteriofagen 35S informatie bevat over
de bouwsten van
zowel DNA als eiwitten
1
ffffi
, DNA suiker + fosfaat + Deoxyribose, Nucleoside is wanneer
basen fosfaatgroepen, een base is verbonden
nucleobasen (purine en aan een suiker via een
pyrimidines), N-beta-glycosidische
nucleoside en een + een fosfaat =
nucleotide nucleotide
dNTP drie fosfaatgroepen op Via een fosfo- alfa, beta en gamma.
ribose anhydride binging Beta en gamma
kunnen splitsen
ATP Heeft een extra 3’OH
op C2
Fosfordiesterbinding Bindt ribose met elkaar Van 5C via een
fosfaatgroep aan de
C3 van de volgende
cAMP Signaalmolecule Door adenylaatcyclase Afgebroken door
die een binding maakt cAMP fosfodiesterase
tussen alfa fosfaat van naar AMP door
ATP met 3’OH van hydrolyse
eigen ribose
S-adenosyl-methionine Methylatie
Ca eine Purine of pyrimidine inhibitor van cAMP e ecten
ananloog fosfodiesterase versterken
AZT Inhibeert reverse N3 staart is giftig voor
transcriptase van het AIDS
HIV virus
Coenzyme A Betrokken bij NAD en FAD Bij elektrontransfer
acetyltransfer-reacties
DNA Helicaal en Anti parallel, 5’ naar 3’ Negatieve ladingen
dubbelstrengs is parallel, maar wijzen van fosfaat zit naar de
in tegenovergestelde buitenkant en
richting waterstofbruggen
worden gevormd door
complementariteit
B-helix Grote en kleine groeve N glycoside bindingen
staan niet diametraal
tegenover elkaar
DNA stabiliteit Waterstofbruggen van der Waals polaire oppervlakten
krachten zijn naar buiten gericht
Hyperchromiciteit DNA absorbeert licht, Als we de temperatuur
meer wanneer ze enkel doen dalen dan
zijn, dit gebeurt bij hybridiseren de
hogere temperatuur tot strengen weer
het een plateau berijkt
Electroforese DNA bekijken,
scheiden of zuiveren
2
ff ff
, Agarose Hydro el niet ionisch Sterk gelerend
polysaccharide uit
zeewier die een
netwerk voor DNA
vormt
Visualisatie Ethidiumbromide + UV SYBRsafe
HOOFSTUK 2
Replicatie DNA kopiëren
Semi conservatieve Experimenten van Tijdens replicatie gaan Er wordt een streng
replicatie Watson en Crick met twee strengen uit doorgegeven en een
stikstof 15 en 14 elkaar en wordt er een streng nieuw
tweede aangemaakt
complementaire streng
aangemaakt
DNA polymerase Staat in voor DNA Op de 5’ van dNMP’s Nodig is een 3’OH en
synthese worden twee de richting gaat van 5’
fosfaatgroepen naar 3’. 5’ van dNTP
geplaatst door kinase, bindt met 3’OH van
hierdoor ontstaan DNA. Polymerisatie is
dNTP’s onomkeerbaar
Replicatie vork (2x) Startplaats voor DNA
replicatie
Helicase DNA strengen uit Door middel van ATP Een van de twee
elkaar halen hydrolyse strengen wordt door
de helices ring gehaald
Topoisomerase I Relaxeert de
superwinding door een
strengt te knippen
Topoisomerase II Superwinding Beide strengen worden ATP
introduceren verborken en de
tweede helix wordt
door de opening
gehaald
Camptothecin Inhibitor van Anti tumor reagens
topoisomerase I
Single strand binding Beschermt
protein SSBP enkelstrengs DNA
tegen afbraak
Primase 3’OH uiteinde maken Is een kort RNA Is een RNA
voor DNA pol fragmenet polymerase met een
3’OH uiteinde
DNA polymerase DNA maken in 5’-3’ DNA pol III bij E.coli
Sliding clamp houdt DNA pol op het Processief gebeuren
DNA van DNA pol
3
fi
Leven Afgescheiden, Communicatie staat
energieopname en door communicatie
verbruik, groei, tussen levensvormen
voortplanting, gelijkt aan
beweging, interpretatie biodiversiteit
van prikkels en
communicatie e
Genen Coderen voor erfelijke
eigenschappen
Experiment van Het kruizen van Waarneembare
Mendel erwtenvarieteiten eigenschappen zijn
overerfbare eenheden,
een individu bestaat uit
twee gekoppelde
genen en genen zijn
dominant, recessief of
intermediair.
Garrod Alkaptonurie De urine van babies Is recessief en komt
kleurt zwart door een defect,
waardoor de urine
hoge concentraties
homogentisinezuur
bevat.
Chromosomen De dragers van genen
Cel fractioneren Detergent, lossen de Mechanisch, sonicatie
celmembranen op of mixer
Di erentiële Opvoerende G kracht Kleine organellen
centrifugatie worden naar de bodem
gedreven
Densiteitscentrifugatie Verschil in densiteit Sucrose Organellen migreren
naar de sucrose
oplossing die
overeenkomt met de
eigen densiteit
Gri th experiment S en R stam bij S en gedood S + R Conclusie is dat
longontsteking in zorgen voor de bacteriën de dragers
muizen ontsteking, enkel R of van genen uit de
gedood S niet omgeving kunnen
opnemen en dat genen
vervat zitten in DNA
Hershey-Chase E.coli geïnfecteerd met Bijvoegen van 32P of Besluit is dat DNA
bacteriofagen 35S informatie bevat over
de bouwsten van
zowel DNA als eiwitten
1
ffffi
, DNA suiker + fosfaat + Deoxyribose, Nucleoside is wanneer
basen fosfaatgroepen, een base is verbonden
nucleobasen (purine en aan een suiker via een
pyrimidines), N-beta-glycosidische
nucleoside en een + een fosfaat =
nucleotide nucleotide
dNTP drie fosfaatgroepen op Via een fosfo- alfa, beta en gamma.
ribose anhydride binging Beta en gamma
kunnen splitsen
ATP Heeft een extra 3’OH
op C2
Fosfordiesterbinding Bindt ribose met elkaar Van 5C via een
fosfaatgroep aan de
C3 van de volgende
cAMP Signaalmolecule Door adenylaatcyclase Afgebroken door
die een binding maakt cAMP fosfodiesterase
tussen alfa fosfaat van naar AMP door
ATP met 3’OH van hydrolyse
eigen ribose
S-adenosyl-methionine Methylatie
Ca eine Purine of pyrimidine inhibitor van cAMP e ecten
ananloog fosfodiesterase versterken
AZT Inhibeert reverse N3 staart is giftig voor
transcriptase van het AIDS
HIV virus
Coenzyme A Betrokken bij NAD en FAD Bij elektrontransfer
acetyltransfer-reacties
DNA Helicaal en Anti parallel, 5’ naar 3’ Negatieve ladingen
dubbelstrengs is parallel, maar wijzen van fosfaat zit naar de
in tegenovergestelde buitenkant en
richting waterstofbruggen
worden gevormd door
complementariteit
B-helix Grote en kleine groeve N glycoside bindingen
staan niet diametraal
tegenover elkaar
DNA stabiliteit Waterstofbruggen van der Waals polaire oppervlakten
krachten zijn naar buiten gericht
Hyperchromiciteit DNA absorbeert licht, Als we de temperatuur
meer wanneer ze enkel doen dalen dan
zijn, dit gebeurt bij hybridiseren de
hogere temperatuur tot strengen weer
het een plateau berijkt
Electroforese DNA bekijken,
scheiden of zuiveren
2
ff ff
, Agarose Hydro el niet ionisch Sterk gelerend
polysaccharide uit
zeewier die een
netwerk voor DNA
vormt
Visualisatie Ethidiumbromide + UV SYBRsafe
HOOFSTUK 2
Replicatie DNA kopiëren
Semi conservatieve Experimenten van Tijdens replicatie gaan Er wordt een streng
replicatie Watson en Crick met twee strengen uit doorgegeven en een
stikstof 15 en 14 elkaar en wordt er een streng nieuw
tweede aangemaakt
complementaire streng
aangemaakt
DNA polymerase Staat in voor DNA Op de 5’ van dNMP’s Nodig is een 3’OH en
synthese worden twee de richting gaat van 5’
fosfaatgroepen naar 3’. 5’ van dNTP
geplaatst door kinase, bindt met 3’OH van
hierdoor ontstaan DNA. Polymerisatie is
dNTP’s onomkeerbaar
Replicatie vork (2x) Startplaats voor DNA
replicatie
Helicase DNA strengen uit Door middel van ATP Een van de twee
elkaar halen hydrolyse strengen wordt door
de helices ring gehaald
Topoisomerase I Relaxeert de
superwinding door een
strengt te knippen
Topoisomerase II Superwinding Beide strengen worden ATP
introduceren verborken en de
tweede helix wordt
door de opening
gehaald
Camptothecin Inhibitor van Anti tumor reagens
topoisomerase I
Single strand binding Beschermt
protein SSBP enkelstrengs DNA
tegen afbraak
Primase 3’OH uiteinde maken Is een kort RNA Is een RNA
voor DNA pol fragmenet polymerase met een
3’OH uiteinde
DNA polymerase DNA maken in 5’-3’ DNA pol III bij E.coli
Sliding clamp houdt DNA pol op het Processief gebeuren
DNA van DNA pol
3
fi
