College aantekeningen
Day 2
Lecture notes from day 2
[Meer zien]Voorbeeld 2 van de 13 pagina's
Voorbeeld 2 van de 13 pagina's
In winkelwagengesponsord bericht van onze partner
Verkoper
Volgen
Voorbeeld van de inhoud
Lecture 2:Haplotypes:
- Many higher organisms are diploid, they carry 2 haplotypes. One from the mother and one
from the father. So the haplotype is the DNA that you get from one parent so from your
father or from your mother.
Haplotypes as a measure of diversity:
- The number of haplotypes is not a good diversity measure, because it depends on:
o Length
o Sample size
Only fraction of possible haplotypes (2S) is observed
S = length of the haplotypes in bp
o Recombination generates new haplotypes
But you don’t really get new variation
Genotype-phenotype relationship
- Simple mendelian traits are the exception, not the rule.
- Complex relationship, not 1:1
o Single traits influenced by many genes
Human height >1000
o Pleiotropy:
Single gene affects more than one trait
o Epistasis:
Interactions between genes
o Environmental influences
- So these relationships are complex.
1.3 the causes and maintenance of variability:
- we see a lot of genetic variation
Hardy-Weinberg equilibrium:
- What happens when no forces act on the population?
o No selection
o No mutation
o No migration
o No random events ( large population)
o Random mating of parents
- Hardy-Weinberg Law:
o Allele and genotype frequencies remain constant
, o Variability is maintained for ever
o Serves as a null-hypothesis / null-model.
When it kind of holds it can be used as starting material to work further from
there.
Is this population in Hardy-Weinberg equilibrium:
- One locus, 2 alleles A and B
- 100 individuals
o 36 AA
o 28 AB
o 36BB
- Is this population in Hardy-Weinberg equilibrium
The hardy-Weinberg Law:
- Consider a locus with 2 alleles: A and B
- Frequency of A = p
- Frequency of B = q
- P+q=1
- fAA = p2
- fAB = 2pq
- fBB = q2
- The genotype frequencies follow from the allele frequencies
- Beware: p2 + 2pq + q2 = 1 is always true, and has nothing to do with HWE
Genotypes frequencies are determined by the allele frequencies, and do not change over a
generation.
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper Anja98. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €2,99. Je zit daarna nergens aan vast.
Is Stuvia te vertrouwen?
4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)
Afgelopen 30 dagen zijn er 78600 samenvattingen verkocht
Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen