College aantekeningen
Hoofdstuk 3
- Vak
- Instelling
Dit zijn mijn college aantekeningen, heel handig om zelf een samenvatting van te maken!
[Meer zien]Voorbeeld 1 van de 9 pagina's
Voorbeeld 1 van de 9 pagina's
In winkelwagen
In winkelwagen
gesponsord bericht van onze partner
Verkoper
Volgen
lisaankersmit
Ontvangen beoordelingen
Voorbeeld van de inhoud
Les 3Strategie in forensisch DNA-onderzoek
Wat er onderzocht moet worden, of welk genoom geanalyseerd moet worden hangt af van de
doelstelling en de bijbehorende onderzoeksvraag:
De vraagstelling, denk aan verwantschapsonderzoek versus forensisch sporenonderzoek. Het
mtDNA is namelijk niet van toepassing bij het vaststellen van het vaderschap, maar speelt
wel een rol bij de vaststelling van het moederschap
De biologische sporen die geanalyseerd moeten worden, waarbij mtDNA een bijdrage kan
leveren in telogene haren
Referentiestalen, op basis van de biologische sporen
Welke genetische variaties onderzoek moeten worden, hangt ook af van de doelstelling:
Vraagstelling, want mutatiefrequenties spelen geen rol als we willen weten wie de donor is
van het spoor (want de referentiestaal en het sporen staal is dan identiek). Maar, dit kan wel
een rol spelen bij verwantschapsonderzoek (er kunnen mutaties optreden wanneer we van
generatie naar generatie gaan)
Selectie van het genoom: SNPs op het mtDNA of STRs en/of SNPs op het nucleair DNA
We willen zo weinig mogelijk testen doen om achter de donor te komen. De SNPs zijn dan
het minst informatief, omdat we veel meer SNPs moeten analyseren ten opzichte van het
aantal STRs
Forensische STR loci – Selectie
Wanneer we een gekende microsatelliet of STR sequentie hebben, kunnen we primers ontwikkelen
voor DNA-amplificatie. Men moet hierbij wel letten op de technische aspecten: Er moeten weinig
artefacten voorkomen (‘stutters’) tijdens de DNA-amplificatie en de allelen moeten tussen de 90 en
500 baseparen liggen, zodat we deze kunnen scheiden van elkaar (we moeten namelijk 3 tot 6
baseparen verschil kunnen scheiden!). Een lage mutatiesnelheid is van belang voor
verwantschapsonderzoek. Daarnaast willen we graag een hoog discriminatie vermogen: We willen,
als we alle studenten hier zouden typeren, dat we die allemaal kunnen onderscheiden van elkaar.
Dus, niemand heeft hetzelfde genotype als een andere student. Praktisch is dit niet haalbaar, als we
ons gaan baseren op één STR. Maar, als we verschillende STRs gebruikt, kunnen we zo mensen
identificeren. Het discriminatie vermogen van een STR is gerelateerd met de ‘random match’
waarschijnlijkheid: Wat is de waarschijnlijk als we twee personen nemen, at random, dat die
hetzelfde genoom hebben? Het resultaat is natuurlijk het minst bruikbaar wanneer deze
waarschijnlijk heel hoog is.
Discriminatie vermogen – Heterozygositeit
Hoe gaan we dit onderzoeken? We kunnen de genotype frequentie van homo- en heterozygoten
n n
2 2
berekenen door middel van pM =∑ ( qi )+ ∑ 2
( 2 q i q j ) , waarbij qi,j de allelfrequentie is van
i=1 i , j=1 met i> j
n
het allel i (of het allel j); ∑ ( qi ) 2 2
de genotype frequentie van de homozygoten is; en
i=1
n
∑ ( 2 qi q j )2 de genotype frequentie van de heterozygoten is. Wanneer de heterozygositeit
i , j=1 met i> j
boven de 80% is, betekent dit dat meer dan 80% van de populatie twee verschillende allelen heeft.
De kans op overeenkomst (pM) daalt naar mate dat de heterozygositeit stijgt. Dus, voor TPOX zien
we een verwachte heterozygositeit van 0.619. Dit betekent dat 62% van de populatie twee
verschillende allelen heeft. De kans op overeenkomst is 1/5 pM, ofwel 20%. Dus, 20% van de
personen die we onderzoeken hebben dezelfde heterozygositeit, die kunnen we dus niet
Pagina 1 van 9
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper lisaankersmit. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €9,83. Je zit daarna nergens aan vast.
Is Stuvia te vertrouwen?
4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)
Afgelopen 30 dagen zijn er 67096 samenvattingen verkocht
Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen