Samenvatting
Samenvatting Inleiding systeembiologie
Samenvatting van het vak Inleiding systeembiologie, gegeven tijdens het 3e jaar van Medische natuurwetenschappen.
[Meer zien]Voorbeeld 2 van de 13 pagina's
Voorbeeld 2 van de 13 pagina's
In winkelwagengesponsord bericht van onze partner
Voorbeeld van de inhoud
Balans opstellenK1+: deze reactie gaat naar rechts Massa actie kinetiek
K1-: deze reactie gaat naar links Snelheden
K2: deze reactie gaat maar 1 kant op, in dit geval naar rechts. Evenwicht & steady-state
Hoofdletters: naam
Kleine letters: concentratie
E: enzym
S: substraat Dit is een gesloten systeem, want
ES: gebonden enzym en substraat er wordt niks aan- of afgevoerd.
P: product
S: als een stof onderstreept is, dan betekent het dat het een constante
concentratie heeft. Er wordt dus steeds extra S toegevoegd om de
concentratie gelijk te houden. Voor deze stoffen hoef je nooit een balans
op te stellen!
1. Systeem definiëren
Parameter = constant
Variabele= niet constant
2. Balans opstellen
3. Kinetiek bepalen
V1 en V2 invullen
4. Stationaire punten bepalen
Stationaire toestand = wanneer de r.c. niet meer verandert
en dus geldt dx/dt = 0. Dit is op het snijpunt van V1 en V2.
Rate characteristic = een grafiek waarin te zien is hoe
processen afhangen van X.
Er zijn 2 soorten:
1. Massa actie kinetiek
2. Enzym kinetiek
Enzym kinetiek gebruik je als er enzym katalysatie bij betrokken is. Dit kan zijn: het vormen van een complex tussen 2
eiwitten / het binden van een ligand aan een receptor / spontane chemische reactie.
Belangrijk:
• De reactie gaat maar 1 kant op, dus gebruik je het
proces k1+.
• 2x moet je noteren als x2 in de balans.
• Je begint met 2 x en eindigt met 1 x, er gaat dus 1 x
af. Hierdoor schrijf je in de balans een - . Dit noem je
de storcheometrische coëfficiënt.
Summary Pagina 1
, Er zijn 2 soorten stationary states:
1. Steady-state
2. Equilibrium (evenwicht)
Voorbeelden:
S→X→P Heeft equilibrium. Uitleg: S, X en P zijn variabelen. Als je S toevoegt wordt dit omgezet in X. X wordt
omgezet in P. De reactie stopt wanneer alle stoffen in evenwicht zijn. De bijbehorende balansen zijn:
ds/dt= -v1. dx/dt=v1-v2. dp/dt=v2. Je kan het ook op een andere manier uitleggen; bij steady state geldt
er dat ds/dt=0. Dit betekent dat ds/dt = -v1 = 0. De snelheid van reactie 1 is dus 0. Als de snelheden 0 zijn,
is er sprake van evenwicht.
S→X→P Heeft equilibrium. Uitleg: stel je zet S op 1 dan wordt dit omgezet in X. X wordt omgezet in P. Er ontstaat
een evenwicht als alle stoffen een concentratie van 1 hebben. De bijbehorende balansen zijn: dx/dt = v1 -
v2. dp/dt = v2. Let op: je stelt dus geen balans op voor S.
S→X→P Heeft (meestal) een steady-state, maar dit is afhankelijk van de concentraties van S en P. Er is een
constante stroom door het systeem. Op het moment dat v1=v2 heb je een steady-state. Stel dat er geldt
v=0 op het moment van v1=v2, dan krijg je equilibrium. Dit is dus alleen bij specifieke/ unieke waarden
van S en P.
Heeft steady-state. Uitleg: er geldt V kinase = Vp, dus er is een steady state.
Volgorde van stappen tot systeembeschrijving?
1. Variabelen en parameters vaststellen
2. Balans opstellen
3. Kinetiek bepalen
4. Stationaire punten bepalen
Geef de balans van
dx/dt = v1 - v2
dy/dt = v2 - v3
dz/dt = v3 - v4
n.b. Z heeft ook invloed op X, maar dat hoef je niet te geven bij de balans. Als er gevraagd wordt om de
snelheden (rate equation), dan moet je wel rekening houden met Z.
Geef de balans van:
dx/dt = v1 - v2
dy/dt = v3 - v4
n.b. L heeft geen streep eronder dus je zou hier ook een balans voor kunnen opstellen, maar er zijn
verder geen stoffen die hem beïnvloeden. De stippellijn betekent regulatoire interactie, het heeft dus
invloed op een snelheid.
Summary Pagina 2
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper boekentijger. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €3,89. Je zit daarna nergens aan vast.
Is Stuvia te vertrouwen?
4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)
Afgelopen 30 dagen zijn er 52510 samenvattingen verkocht
Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen