Samenvatting
Summary Chapter 2 DNA structure and stability mutations versus repair
This is a summary of chapter 2 DNA structure and stability mutations versus repair. With all of my summaries for this course I passed it with an 8!
[Meer zien]Voorbeeld 0 van de 0 pagina's
Voorbeeld 0 van de 0 pagina's
In winkelwagengesponsord bericht van onze partner
Gekoppeld boek
Titel boek:
Auteur(s):
- Uitgave:
- ISBN:
- Druk:
3 beoordelingen
Door: albus00 • 2 jaar geleden
Door: nvanstee • 3 jaar geleden
Door: nboujeddaine • 3 jaar geleden
Voorbeeld van de inhoud
Oncology – Chapter 2 DNA structure and stability: mutationsversus repair
PART 1
DNA and cancer
DNA
4 bases;
• Purines
o Adenine (2 hydrogenbond)
o Guanine (3 hydrogenbond)
• Pyrimidines
o Cytosine (3 hydrogenbond)
o Thymine (2 hydrogenbond)
o Uracil (only in RNA)
Base = base (Adenine)
Base + sugar = nucleoside (Adenosine, cytidine, guanosine, thymidine)
Base + sugar + phosphate = nucleotide (AMP, ADP, ATP)
1’ base
2’ H
3’ OH (hydroxyl group)
4’ H
5’ phosphate group
5’ end = phosphate (phosphate group)
3’ end = sugar (hydroxyl group)
From 5’ → 3’
The double helix
2 chains running in opposite direction.
A-T and G-C base pairs is complementary.
This complementary base pairing makes DNA a suitable
molecule for carrying our genetic information. One template
that copied the DNA readily and passes on to the next
generation.
RNA
RNA has U instead of T
RNA has at 2’ OH instead of H
RNA is mostly a single-stranded molecule.
From DNA to proteins
Transcription; DNA → RNA – takes place in nucleus
Between this splicing take place; remove introns
Translation; RNA → proteins – takes place on ribosomes in
the cytoplasm
, 2 parts in a gene
1. Promotor region; located at 5’ end; involved in regulating the
expression. Response element (RE) lies within the promotor
region and contributes to the regulation.
TATA box is located near the start of the transcription. Binding of
the TAT box binding protein (TBP) to TAT box is crucial for initiation of transcription
2. Coding region
Enhancer elements are additional regulatory DNA sequences that are positioned and
orientated independent relative to a promotor.
Super-enhancers are clusters of enhancer elements.
Genetic stability/instability
Genetic stability:
DNA damage → intact DNA by repairing
Genetic instability:
Intact DNA → DNA damage → DNA mutations → change of cell
function (cancer)
Mutations
• In exon region: result in mutated proteins
• In exon-intron boundaries: result in altered splicing
• In deep-intronic: also have consequences for the splicing
process
• In promotor region: functional consequences like increased
or reduced expression of genes
• Mutation far from the transcriptional start: may also have functional
consequences
Drivers for oncogenesis:
- Cancer genes:
1. Stability genes: function in DNA repair pathways – inactivation of DNA repair
result in more DNA mutations
2. Oncogenes: activation can aid tumorigenesis – activation can be achieved by
mutation of the protein or enhanced expression
3. Tumor suppressor genes: inactivation can aid tumorigenesis – inactivation can
be achieved by mutation of the protein or reduced expression
- Epigenetic mutations
- Viral infections; viral proteins interact with cellular cancer proteins such as
TP53 or RB1
Changes in DNA
• Small DNA changes
o Base pair substitutions: transition (substitution of one
purine for another purine) + transversion (substitution
of a purine for a pyrimidine or vice versa)
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper biomedicalsciencesvu. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €2,99. Je zit daarna nergens aan vast.
Is Stuvia te vertrouwen?
4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)
Afgelopen 30 dagen zijn er 56326 samenvattingen verkocht
Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen