College aantekeningen
College aantekeningen Genetica En Evolutie
- Instelling
- Universiteit Van Amsterdam (UvA)
Aantekeningen van de colleges van Genetica en Evolutie voor het tweede deeltentamen
[Meer zien]Voorbeeld 2 van de 15 pagina's
Voorbeeld 2 van de 15 pagina's
In winkelwagengesponsord bericht van onze partner
Verkoper
Volgen
Voorbeeld van de inhoud
Genetica en evolutie DT225-11-2019
H10 Gen-isolatie en genetische manipulatie
Genetisch engineering = het proces van het produceren van gemodificeerd DNA en
het opnieuw introduceren van dit DNA in gastheerorganismen.
Amplificeren kan in virto en in vivo
Vitro = in een reageerbuis. Dit heet de polymerase chain reaction (PCR). Een
specifiek gen of DNA gebied wordt geïsoleerd en versterkt door polymerase
(uit een bacterie). PCR vindt het target DNA door de complementaire binding
van primers -> replicatie wordt ingezet.
Vivo = in levende bacterie cellen
Hebben familieleden van een patiënt met een erfelijke aandoening de zelfde
genotypische predispositie?
We zoeken dus een bekende mutatie in een gen (mutatie in patiënt is bekend)
waar we de sequentie van kennen.
1. DNA extractie van de familieleden en DNA isolatie = componenten van de cel
verwijderen en DNA overhouden.
2. Gebruik PCR om de mutatie te detecteren.
Denaturatie = Temp verhoogt tot 95 graden -> waterstofbruggen breken
-> twee aparte strengen
Hybridisatie = lagere temp 50 graden -> bindt primer.
Elongatie = 72 graden -> DNA polymerase bindt (TAQ) -> DNA
replicatie
Target sequence -> gedeelte van primer 1 naar primer 2
Proces begint opnieuw en herhaalt onwijs vaak
Is de mutatie groot -> zet je PCR product op gel
Mutatie klein -> ontwikkel een selectie primer voor de deletie/snp ->
wildtype zal geen PCR product hebben en mutant wel -> zet PCR
fragmenten op gel
Wetenschappers isoleren DNA voor:
- Genetisch testen
- Lichaam identificatie
- Analyse van forensisch onderzoek
Oxydroinen gen maken
Restrictie-enzymen = eiwitten die DNA kunnen knippen
Moleculaire scharen met een specifieke ‘knip’
Structuur van de geknipte producten:
- Met overhang
- Blunt ends
Transfectie = DNA in andere cellen brengen
, Welke genen komen tot expressie tijdens het vormen van langetermijngeheugen?
Als je eiwitsynthese blokkeert in bv fruitvliegjes, kunnen ze nog wel leren, maar slaat
het niet op in het langetermijngeheugen.
We willen onderzoeken welke genen meer en minder worden afgeschreven
tijdens de vorming van LTM (longterm memory)
1. mRNA extractie
2. cDNA synthese wanneer we al het mRNA willen onderzoeken (reverse
transcriptie). 2 soorten primers
poly T primer = op de poly A staart. Hiermee gebruik je het hele mRNA
specifieke primer = als je een specifiek deel van het mRNA wilt
3. Productie gelabeld cDNA -> tijdens PCR worden er gelabelde dNTP’s
gebruikt. dNTPS’s = de losse basen nodig tijdens PCR. Bv geen LTM is groen
en wel LTM is rood.
4. Micro array = hiermee kan het verschil in genexpressie tussen behandelingen
worden vergeleken.
Hoe kunnen we een mogelijke nieuwe mutatie opsporen?
1. Zoek het gen waar de mutatie zich zou kunnen bevinden op in het humane
genoom
2. Amplificeer het gen
Ontwerp primers om het gen te amplificeren met PCR
Of kloneer het gen in een bacterie
3. Bepaal de basenvolgorde van het gen (sequencing)
Sanger sequencing = techniek die relatief lange “reads” van goede kwaliteit
geeft
CRISPR-CAS9
Gericht mutaties aanbrengen.
Belangrijkste toepassingen
- Gene knock-out maken
- Site directed mutagenese -> puntmutaties, grotere mutaties
- Regulatie genexpressie -> activatie, repressie
- Epigenetische modificaties
- Genome labeling
- RNA silencing
26-11-2019
H14 genomen en genomics
Frederick Sanger -> uitvinder van radioactief Sanger
sequencing
Ddntp’s = nucleotiden die dideoxyribose bevatten (H in
plaats van OH op c3). Na inbouwen van het ddntp kan
de DNA keten niet langer verlengt worden, omdat er
geen andere nucleotide aan kan binden aan c3.
Sequencing reactie is een PCR reactie. De PCR stopt
na het inbouwen van een ddntp. Zo kan de volgorde van
de basenparen bepaald worden.
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper amber-cn. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €4,49. Je zit daarna nergens aan vast.
Is Stuvia te vertrouwen?
4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)
Afgelopen 30 dagen zijn er 66579 samenvattingen verkocht
Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen