Inleiding
Prokaryoot Eukaryoot
- Geen celkern - Celkern
- Circulair DNA - Lineair DNA
- Geen organellen - Organellen
- Klein - Groot
- Celwand - Celwand alleen bij planten
Genoom: Hele set van genetisch materiaal in een cel.
Gen: Stuk van het DNA dat codeert voor een eiwit of functioneel RNA
A tegenover T -> 2 waterstofbruggen
C tegenover G -> 3 waterstofbruggen
Eigenschappen DNA-polymerase
DNA-replicatie door DNA-polymerase
- Semiconservatief (1 streng blijft bestaan)
- Trifosfaat nucleotide als substraat (koppelt aan 3’-OH einde wanneer baseparing plaatsvindt)
- Één fosfaatgroep wordt ingebouwd, pyrofosfaat + energie komen vrij
1
,Tot 1000 nucleotiden/sec in prokaryoten
Tot 50 nucleotiden/sec in eukaryoten
DNA is antiparallel -> replicatievork is asymmetrisch
Okazaki fragmenten: ‘lagging’ strand bij DNA-synthese
Eigenschappen DNA-polymerase
1. Alle DNA-polymerasen hebben een primer nodig
2. Alle DNA-polymerasen syntetiseren van 5’ naar 3’
3. De meeste DNA-polymerasen hebben een template nodig
4. Sommige DNA-polymerasen hebben exonuclease activiteit
- van 3’ -> 5’ proofreading
- van 5’-> 3’ weghalen primer
Tautomeren
- G en T bestaan in keto en enol vormen
- A en C bestaan in amino en imino vormen
1. Tijdelijk andere tautomeer
2. Verkeerde baseparing
3. Mismatch
4. Wordt hersteld door exonuclease activiteit
Mut-complex (wanneer niet hersteld)
1. MutS herkent mismatch
2. MutL herkent ‘nicks’ (ligase is nog niet
langs geweest)
Bij prokaryoot: MutH maakt zelf ‘nick’
Initiatiefase DNA-replicatie
Replication Bubble
- Replicatie is (meestal) bidirectioneel
- Replicatie begint bij specifieke DNA sequentie: ORI (iniator proteins
binden hieraan)
Prokaryote chromosomen bevatten 1 ORI -> alleen activatie als er voldoende
voedingstoffen aanwezig zijn voor celdeling
2
, Eiwitbinding prokaryote ORI
- DNA-A: initiator eiwit
1. Bindt aan specifieke frequentie
2. Torsiale stress
3. DNA breekt open op A=T rijke frequentie
- DNA-B: helicase
Bindt aan DNA-A mbv DNA-C
- DNA-C: helicase loading protein
Blokkeert helicase tot correcte plaatsing op ORI
- DNA-G: primase
Plaatst primer op enkelstrengs DNA
Eukaryote ORI: Autonomously Replicating Sequence (ARS)
(wanneer deze aanwezig is kan DNA repliceren)
ARS bevat:
1. Bindingplaats voor Origin Recognition Complex (ORC)
2. Sequentie rijk aan A=T
3. Bindingplaats eiwitten die helpen ORC aantrekken
Activatie eukaryote ORI:
1. ORC zit de gehele celcyclus gebonden aan een ORI
2. Alleen ongefosforyleerd ORC kan prereplicatie complex vormen
3. Na activatie ORI wordt ORC gefosforyleerd
4. Defosforylering ORC eind mitose
Helicase:
- Verbreekt H-bruggen basen
- DNA wordt enkelstrengs -> beschikbaar DNA-polymerase
- Verbruikt energie (ATP)
- Tot 1000 bp per sec
- Tijdens replicatie ‘loopt’ helicase over 5’->3’ streng
Elongatiefase van DNA-replicatie
Primers
- DNA-polymerasen hebben een primer nodig -> vrije 3’-OH voor koppeling
3
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper MiAnne. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €6,99. Je zit daarna nergens aan vast.