Samenvatting
Samenvatting Bouwstenen van het Leven
- Instelling
- Vrije Universiteit Amsterdam (VU)
Dit is een volledige samenvatting van 115 pagina's van alle stof die hoort bij het vak bouwstenen van het leven
[Meer zien]Voorbeeld 4 van de 115 pagina's
Voorbeeld 4 van de 115 pagina's
In winkelwagengesponsord bericht van onze partner
2 beoordelingen
Door: juliauser1234 • 1 jaar geleden
Door: isabellehofman • 2 jaar geleden
Voorbeeld van de inhoud
SAMENVATTINGBOUWSTENEN VAN HET LEVEN
Door: Claire Snel
12 OKTOBER 2020
,Inhoudsopgave
1 Elements & Energies ...................................................................................................................................... 3
1.1 Some Relevant Elements ...................................................................................................................... 3
1.2 Energy ........................................................................................................................................................... 6
1.2.1 Internal energy (inwendige energie) .................................................................................................... 6
1.2.2 Enthalpy ................................................................................................................................................ 6
1.2.3 Entrophy ............................................................................................................................................... 7
1.2.4 Gibs free energie .................................................................................................................................. 8
1.3 Interactions................................................................................................................................................... 9
2 Protein Structure & Dynamics ..................................................................................................................... 10
2.1 AminoAcids ................................................................................................................................................. 10
2.2 Protein structure ......................................................................................................................................... 13
2.2.1 Primaire structuur .............................................................................................................................. 13
2.2.2. Secundaire structuur ......................................................................................................................... 14
2.2.3 Tertiaire structuur .............................................................................................................................. 17
2.2.4 Quartaire structuur ............................................................................................................................. 18
2.3 Protein Dynamics ........................................................................................................................................ 19
2.3.1 Eiwit vouwing ..................................................................................................................................... 19
3.3.2 Eiwitstabiliteit ..................................................................................................................................... 22
2.3.3 Eiwitbeweging .................................................................................................................................... 23
3 Protein function .......................................................................................................................................... 24
3.1 Fluorescent Proteins ................................................................................................................................... 24
3.2 Shuttle Proteins: Globins ............................................................................................................................ 28
3.2.1 Myoglobin ........................................................................................................................................... 28
3.2.2 Hemoglobine ...................................................................................................................................... 29
3.3 Structural Proteins ...................................................................................................................................... 33
3.1 Collagen ................................................................................................................................................. 34
3.2 Elastin .................................................................................................................................................... 36
4 Enzymes ...................................................................................................................................................... 39
4.1 Enzyme Catalysis ........................................................................................................................................ 39
4.1.1 Specifity .............................................................................................................................................. 39
4.1.2 Activation Energy ................................................................................................................................ 41
4.1.3 Acceleration ........................................................................................................................................ 42
4.1.4 Mechanism: How Enzymes Do It ........................................................................................................ 43
4.1.5. Michaelis & Menten: How Fast Enzymes Do It .................................................................................. 47
4.1.6 Cofactors: Mother’s Little Helpers ...................................................................................................... 50
4.2 Enzyme Regulatie ....................................................................................................................................... 52
4.2.1 Irreversible Regulation by Covalent Modification .............................................................................. 52
4.2.2 Reversible Regulation by Covalent Modification ................................................................................ 53
4.2.3 Reversible, Non-covalent Inhibition ................................................................................................... 55
4.2.4 Cooperativity and Allostery ................................................................................................................ 58
5 Biological Membranes ................................................................................................................................. 60
5.1 Lipids ........................................................................................................................................................... 60
5.2 Bilayer ......................................................................................................................................................... 62
5.2.1 Building Membranes........................................................................................................................... 62
1
, 5.2.2 Membrane Function and Dynamics .................................................................................................... 63
5.3 Membrane Proteins .................................................................................................................................... 68
5.4 Membrane Transport ................................................................................................................................. 70
5.4.1 Fundamentals of Membrane Transport ............................................................................................. 70
5.4.2 Membrane-active Antibiotics ............................................................................................................. 72
5.4.3 Transport of Small Molecules ............................................................................................................. 75
6 Cellular Metabolism .................................................................................................................................... 86
6.1 Fundamentals ............................................................................................................................................. 86
6.2 Metabolic Routes........................................................................................................................................ 92
6.2.1 Glycolysis ............................................................................................................................................ 92
6.2.2 Pyruvate Decarboxylation .................................................................................................................. 96
6.2.3 Fermentation ...................................................................................................................................... 97
6.2.4 TCA-cyclus ........................................................................................................................................... 98
6.3 Electron Transport Chain ............................................................................................................................ 99
6.3.1 Mitchell’s Postulates: Membranes: de stuwdam ............................................................................... 99
6.3.2 Mitchell’s Postulates: Electron Transfer Chain (ETC) .......................................................................... 99
6.3.3 Mitchell’s Postulates: Proton Pumping ............................................................................................ 105
6.3.4 ROS production ................................................................................................................................. 107
6.3.5 Bacterial Respiration......................................................................................................................... 108
6.3.6 Heat production................................................................................................................................ 109
6.4 ATP synthesis ............................................................................................................................................ 110
6.4.1 The Coupling Factor .......................................................................................................................... 110
6.4.2 F1 ....................................................................................................................................................... 111
6.4.3 Rotations........................................................................................................................................... 111
6.4.4 F0: en dit is de aandrijf ...................................................................................................................... 113
2
, 1 Elements & Energies
1.1 Some Relevant Elements
Atomen:
- kern + elektronen daaromheen
- hebben verschillend aantal protonen en elektronen
- atoomnummer = aantal protonen (en elektronen) in de kern
- atoommassa = protonen + neutronen
De buitenste schil van sommige atomen is niet vol, we noemen deze elementen dan reactief
In moleculen zijn atomen verbonden met covalente bindingen
> covalente bindingen:
Een paar elektronen worden gedeeld door twee atomen
Carbon (C)
- heeft 4 elektronen in de buitenste schil --> 4 opnemen of 4
afstaan om de buitenste schil te verzadigen
- heeft een bijzondere rol in cellen: kan sterke covalente
bindingen vormen met andere carbon-atomen
>> met 1 covalente binding kunnen de groepen vrij rond bewegen rond elkaar
>> met meerdere covalente bindingen kan dit niet, liggen ineen vlak
>> carboxyl(zuur)-groepen kunnen proton >> veel CN-bindingen in proteines/ eiwittten
afstaan en negatief geladen worden >> amine = NH2
>> amide = CONH
Fosfaatgroepen:
- Hydroxyy groep (alcohol) + fosfaatgroep → fosfaatester
>> bij hydrolyse wordt de binding verbroken waardoor energie vrijkomt
3
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper clairesnel2. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €15,99. Je zit daarna nergens aan vast.
Is Stuvia te vertrouwen?
4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)
Afgelopen 30 dagen zijn er 48298 samenvattingen verkocht
Opgericht in 2010, al 15 jaar dé plek om samenvattingen te kopen