Samenvatting
Samenvatting Ecological Methods I
- Instelling
- Wageningen University (WUR)
Samenvatting van de colleges & practica per onderwerp
[Meer zien]Voorbeeld 4 van de 39 pagina's
Voorbeeld 4 van de 39 pagina's
In winkelwagengesponsord bericht van onze partner
1 beoordeling
Door: casperbraams • 2 maanden geleden
Voorbeeld van de inhoud
Univariate analysis (exam 1)Group differences
Introduction
Ecological problems
Lot of sites/plots
Many variables
Lot of natural variation (noise)
solution: statistics
Sample size (N)
Larger N better estimate mean & s, value stabilizes
Larger N smaller CI
Don’t learn standard deviation (SD or s) formula
Standard deviation = s = σ
Variation = s2
SPSS: levels of measurements
Nominal => categories
- Habitat, sex, colour
- Prey species killed
Ordinal => order
- Abundant, frequent, rare
- Droppings
Scale => ratio scale
- Absolute 0 (weight, length, intake)
- Subtract, add, multiplication
- Fish size & body mass
Distribution type
Normal => symmetric & continuous
Lognormal => skewed & continuous
- Exponential growth (biomass)
Poisson & negative binomial => skewed, non continuous (discrete)
- Counts (quadrants)
Binomial => 2 outcomes
- Dead/alive, present/absent
,T-tests
Independent samples (df = N – 2)
1. Unequal variances
2. Equal variances
Dependent samples (df = N – 1)
3. Paired sample
Hypothesis => testable explanation of observation
Clear direction: larger/smaller, increase/decrease
Based on observations + what you already know to be true
If … then …
Independent variable (x) = cause
Dependent var (y) = effect
Example:
- Ho => no difference
- H1 => mean body weight larger in area B than area A
Standard error of the mean (SE) = standard deviation of X̄ = s/√ N
T-test unequal variances (1)
Difference between 2 means/SE of that difference
- If X̄ 1- X̄ 2 = 0 t = 0
- If X X̄ 1- X̄ 2 = large or S2/N decreases t increases
Threshold: p = 0.05!!
- p ≤ 0.05 reject Ho
- p ≥ 0.05 do not reject Ho
T-test for equal variances (2)
Difference between 2 means/SE of that difference
Levene’s test
- Ho: equal variances (p ≥ 0.05)
,Degrees of freedom (df)
Df < N
- Depends on test & data
Significant outcome if: calculated t > critical t from table
Reporting statistics
1. Used test
2. Statistical parameter value (e.g. t-value)
3. Df/N
4. P-value
One-sided vs two-sided
One-tailed test sooner significant
- But: only use if you know that 1 group has higher mean (e.g. more mortality in polluted
area)
Ecology: lot of noise & uncertainty often two-tailed
- Doubt always use two-tailed
- Sometimes one-tailed (F-test)
Type 1 & type 2 error
Type 1 => reject Ho while true
4. Conclude someone is pregnant who is not
Type 2 => do not reject Ho while false
T-test for paired data (3)
Example:
- Same animal measured 2x (at two moments in
time)
z̄ = average value of difference
Power & sample size
Power => likelihood of test reaching correct conclusion
- Smaller type II error larger power than visually inspected
Larger power implications for:
- Experimental design
- Sample size
- Test results
Minimum sample size calculation
, Non-parametric & transformation
Parametric test: assumes data distribution is characterized by mean, SD
- Only use (transformed) normally distributed data (black line)
- Higher power than non-parametric test
Not normally distributed (red line) transform data OR use non-parametric test
- Preferably transform, only use non-parametric test as last option
Test for normality
- Histogram
- Statistical test Shapiro Wilk test
Data transformation
Check:
- Variance (s2), mean (X̄ ) & histogram
Rules of thumb (no hard guidelines)
- S2 > X̄ log(variable) or ln(var) e.g. growth, biomass
- S2 X̄ √ var e.g. area, size
- Highly skewed √ √ var
- Binomial ln(p/(1-p)) e.g. presence/absence (binomial data)
0 values
- Use log(x+1) or ln(x+1)
- √ var + 0.5
Transform whole var check again!
- Still not normal: use non-parametric test (can also be used for normal data)
- Parametric test has higher power
Non-parametric tests
Mann Whitney U test
Wilcoxon matched pairs test
Kruskal Wallis test
Mann Whitney U test (1)
Not normal & unmatched pairs
Ho: 2 medians are equal
U value for 2 groups
- Compare smallest U value with table
- U < critical value reject Ho
- Tied data? (same value & rank) use asymptote p
Wilcoxon matched pairs test (2)
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper michouweimar. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €3,49. Je zit daarna nergens aan vast.
Is Stuvia te vertrouwen?
4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)
Afgelopen 30 dagen zijn er 67096 samenvattingen verkocht
Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen