We study the seam cells of C.
elegans because they divide just
like stem cells in humans
- C. elegans is cheap
- C. elegans grow fast
We are going to mainly study to cell division in V1-V4
- First there is an asymmetrical division – L1
- Then the posterior daughter has a symmetrical
division and after that an asymmetrical division – L2
- That is followed by an asymmetrical division – L3
- And lastly there is another asymmetrical division
– L4
- After the L4 stage, all the seam cells have differentiated
Research Question: What other genes are involved in the regulation of the balance
between seam cell proliferation and differentiation?
For this research we use a C. elegans Wildtype (JR667) and a C. elegans tumour-like
phenotype, which leaks Unc-62 (AW673)
- Unc-62 is a transcription factor which regulates the transcription (DNA to RNA) in the
nucleus
- General factors bind to the promotor region, the TATA-box (GTF)
Transcription factors could be either:
- An activator
- An inhibitor/repressor
Activators
- Up-regulation of expression
- By mediating complex formation
Enhancer sequence
- 50 – 1500 bp in size
- 10 – 1000 kb distant from gene
, Unc-62 --- gene 16 seam cells
Unc-62 --- gene hyperplasia of seam cells
When your gene is not a regulator, it will not play
a part in the lab
- Binding to the DNA is a requirement for a
transcription factor
ChIP – Chromatin ImmunoPrecipitation assay
- Lysis of the cell
- Antibodies against Unc-62
- Every sequence to which it was bound, is known Wormbase
modENCODE for Unc-62 – Model Organism
Encyclopeadia of DNA elements
- Pulls out 31029 binding sites, but there are some repeats of the same genes
- Filter for 2.5 kb up- and downstream and within a gene for binding sites
- Then manually look and select those which might be of interest
Final list of 7358 genes
Slowly working through them
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper annebraam811. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €5,49. Je zit daarna nergens aan vast.
