Samenvatting
Samenvatting De Cel- 5052CELX6Y
- Instelling
- Universiteit Van Amsterdam (UvA)
Uitgebreide collegeaantekeningen van alle colleges die tijdens het vak "De Cel" zijn gegeven. Bijbehorend theorieboek ook te koop
[Meer zien]Voorbeeld 3 van de 17 pagina's
Voorbeeld 3 van de 17 pagina's
In winkelwagengesponsord bericht van onze partner
Voorbeeld van de inhoud
Dag 2-1:Small organic building blocks Larger organic molecules
Sugars -> Polysaccharides, glycogen, starch
Fatty acids -> Fats and Membrane lipids
Amino acids -> Proteins
Nucleotides -> Nucleic acids
Basic side chain aminozuren: LAH
Lysine
Arginine
Histidine
Acidic side chain aminozuren: AG
Aspartic acid
Glutamic acid
Uncharged polar side chain aminozuren: AGSTT
Asparagine
Glutamine
Serine
Threonine
Tyrosine
C,T,U -> pyrimidines (1 ring)
G,A -> purines (2 ringen)
Dag 2-2 :
Cellen reproduceren door het dupliceren van hun onderdelen en te delen in twee
dochtercellen -> celcyclus
4 fasen:
M-fase: 2 hoofdgebeurtenissen: mitose (kerndeling) & cytokinese (splitsing)
Tussen de ene M-fase en de andere zit de interfase:
G1-fase: groei van de cel & monintoren intra- en extracellulaire omgeving (zorgen dat
omstandigheden goed zijn voor S-fase)
S-fase: de cel repliceert z’n DNA
G2: fase: groei van de cel & monitoren intra- en extracellulaire omgeving (zorgen dat
omstandigheden goed zijn voor M-fase)
Cell cycle control system:
Van G1 naar S (nutriënten) -> G0 (resting state)
Van G2 naar M (onbeschadigd DNA)
Tijdens M (chromosomen aan cytoskelet)
Wordt geactiveerd wanneer cyclins binden aan Cdks (er zijn verschillende types die
verschillende stappen in de cell-cycle reguleren)
,Centrosome cycle: Figuur 18-21
G1: begin
S/G2: duplicatie centrosoom
M: scheiding centrosomen, uit elkaar & vorming mitotic spindle
Mitose:
1 Prophase: zuster chromatiden condenseren, centrosomen uit elkaar
2 Prometaphase: afbraak nuclear envelope
3 Metaphase: chromosome op 1 lijn tussen de polen
4 Anaphase: zuster chromatiden gescheiden en getrokken naar de pole
5 Telophase: nieuwe nuclear envelopes, vorming contractile ring
Cytokinese: Cytoplasma gescheiden door contractile ring (actine en myosine filamenten)
De grootte van bijvoorbeeld organen worden geregeld door celgroei, celdeling & celdood
(geprogrammeerd -> apoptose). Celdeling en celdood houden elkaar in balans, bijvoorbeeld
in de lever.
DNA-schade:
Depurinatie -> purinebasen worden weggehaald
Deaminatie -> aminogroep af van cytosine waardoor uracil wordt gevormd
Opgelost door DNA repair:
Schade herkend en verwijderd, bijv door nucleases
Repair DNA-polymerase
Gaten opgevuld door DNA-ligase
Mutaties in germ-line cells doorgegeven aan andere cellen. Als deze schadelijke
consequenties hebben worden ze geëlimineerd door natuurlijke selectie.
Dag 2-3:
Central dogma: DNA -> RNA -> protein
Cellen kunnen de genexpressie (proces waarbij cellen de instructies in hun genen uitlezen)
reguleren, waardoor de hoeveelheid van een gemaakt eiwit bepaald kan worden.
Transcriptie: DNA -> RNA
RNA bevat ribonucleotiden ipv nucleotide (dus ribose ipv deoxyribose)
RNA bevat Uracil (U) i.p.v. Thymine (T)
RNA bevat een enkele streng, waardoor het kan vouwen
RNA-polymerase maakt de ribonucleotiden aan elkaar vast via complementary base-pairing
van 5’ naar 3’. Nadat een deel van de DNA-streng is getranscribeerd laat de
gesynthetiseerde RNA streng meteen los en hervormt de DNA-helix zich weer. Het RNA-
molecuul is een deel van de DNA-streng, dus is het veel kleiner.
RNA-polymerase kan transcriptie beginnen zonder primer, dus geen proofread. Dit zorgt
voor meer fouten, maar deze hebben geen consequenties.
, mRNA: codeert voor proteins
rRNA: vormt de structuur van de ribosomen en katalyseert eiwitsynthese
miRNA: reguleert genexpressie
tRNA: adapters tussen mRNA en aminozuren tijdens eiwitsynthese
noncoding RNA: gebruikt in RNA splicing, genregulatie, en andere processen
Transcriptie:
1 herkenning transcription start site
2 RNA-polymerase bindt zwak aan dubbele helix
3 RNA-polymerase herkent promoter
4 RNA-polymerase bindt sterk aan dubbele helix
5 transcriptie begint langs template strand
6 RNA-polymerase komt terminator tegen (wordt wel getranscribeerd)
7 transcriptie stopt
8 RNA-polymerase laat DNA-template en RNA-transcript los
Bij bacteriën is de sigma factor verantwoordelijk voor het herkennen van de promoter.
De template strand is de strand waarvan de promoter in de 3’ – 5’ richting ligt (zodat
getranscribeerd kan worden van 5’ naar 3’.
Initiatie transcriptie eukaryoten vs bacteriën:
1 Bacteriën gebruiken 1 type RNA-polymerase, terwijl eukaryoten er 3 gebruiken.
RNA-polymerase 2 transcribeert de genen coderend voor eiwitten
2 bij bacteriën kan RNA-polymerase uit zichzelf transcriptie beginnen, terwijl bij
eukaryoten general transcription factors nodig zijn.
3 de mechanismes die de initiatie van transcriptie controleren in eukaryoten zijn veel
complexer dan die in bacteriën
4 eukaryotische transcriptie heeft te maken met de vouwing van DNA in
nucleosomen, dit is niet zo bij bacteriën
General transcription factors binden aan de promoter waar ze RNA-polymerase
positioneren en de dubbele helix uit elkaar trekken. (Vergelijkbare rol met sigma factor)
1 general transcription factor bindt aan TATA box
2 er kunnen andere eiwitten aan de promoter binden
3 RNA-polymerase 2 bindt met andere eiwitten aan zich aan de promoter zodat een
transcription initiation complex wordt gevormd
4 wanneer een fosfaatgroep aan de staart van RNA-polymerase bindt kan het
loslaten van het complex
5 wanneer de transcriptie klaar is laten de fosfaatgroepen los en is RNA-polymerase
klaar om een nieuwe promoter te vinden
In de weg van DNA tot eiwit kan een hoop gereguleerd worden:
1 transcriptional control: hoe vaak en wanneer transcriptie plaatsvindt
2 RNA-processing control: hoe een transcript wordt gespliced
3 mRNA transport and localization control: welk mRNA wordt geëxporteerd naar
cytosol
4 mRNA degradation control: hoe snel mRNA wordt uitgescheiden
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper quintendrupsteen. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €5,39. Je zit daarna nergens aan vast.
Is Stuvia te vertrouwen?
4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)
Afgelopen 30 dagen zijn er 62890 samenvattingen verkocht
Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen