100% tevredenheidsgarantie Direct beschikbaar na je betaling Lees online óf als PDF Geen vaste maandelijkse kosten
logo-home
Eerder door jou gezocht
Eerder door jou gezocht
logo
Summary Cell Biology Proteomics Mass Spectrometry €4,49
In winkelwagen
Snel navigeren naar
Voorbeeld
  2.  
  3. Vrije Universiteit Amsterdam (VU)
  4.  
  5. Experimental Cell Biology 2

Samenvatting

Summary Cell Biology Proteomics Mass Spectrometry
 0 keer verkocht

This document provides a summary of proteomic techniques, such as mass spectrometry. The focus lies on tandem MS, peptide fragmentation, MS/MS, Maldi and electrospray, Time-of-flight, orbitrap and the pathology of Alzheimer’s disease and how the MS contributes to the research. There is also a bri...

[Meer zien]

Voorbeeld 1 van de 3  pagina's

Document informatie

  • 22 oktober 2022
  • 3
  • 2022/2023
  • Samenvatting

Onderwerpen

Geschreven voor

Alle documenten voor dit vak (8)

Verkoper

avatar-seller
Jylan13

Ontvangen beoordelingen

Voorbeeld van de inhoud

Experimental Cell Biology II: proteomics/mass spec
Proteomics Tandem mass spectrometer
Proteomics relies on the use of mass A tandem MS is a device that uses two mass
spectrometry. A mass spectrometer is a device spectrometers. First, the protein is digested and the
that measures the mass of analytes such as peptides are injected into the mass spectrometer.
proteins, and peptides, but also carbohydrates, Then the peptides go through the first MS to measure
fats, small molecules and chemicals. When a the mass and charge of the peptides. After this is
molecule gets injected into the MS, a detector done, you can select a peptide from the mass
gives a peak that stands for the mass and spectrum that goes through the second MS. The
peptide is ionized and fragmented by energy in the
intensity of the molecule. This peak intensity
fragmentation chamber. This results in random
correlates to the peptide concentration,
fragments of the peptide. The MS then measures the
therefore you can quantify the number of mass and charge of these fragments and can be sued
peptides in your sample. to deduce the amino acid sequence.




A protein consists of amino acids and each Peptide fragmentation
amino acid consists of peptides that each have Each amino acid mass is already known, so by
a specific mass. subtracting the masses of the fragmented ion
peptides the sequence of the peptide can be revealed.
• MS measurement of peptides is excellent
Sometimes some of the fragments go missing during
• MS measurement of proteins is possible, but
fragmentation, which leads to difficulty in finding the
with low resolution and poor mass accuracy. amino acid sequence. Once the fragmentation
spectrum is revealed the amino acid sequence is
Before the analysis, a protein has to be calculated using a database according to their
digested into peptides using an enzyme called corresponding masses.
trypsin, since this is more accurate and gives a
higher resolution. The enzyme cleaves specific
peptide bonds between the carboxyl group of
arginine or the carboxyl group of lysine and
the amino group of the neighbouring amino
acid. The peptides are derived from the protein
and the peptides can be identified.
Nowadays a sample could consist of more than 3000
proteins that generate about 30 peptides, which in
this case is about 90.000 peptides. This can not be
injected into the MS right away, but the complexity
Though, there are peptides that have the same
has to be reduced by high-pressure liquid
mass. Therefore, they need to determine the chromatography (HPLC) or SDS-PAGE where they
amino acid sequence for the high specificity of can cut the gel into several pieces and isolate the
peptide or protein identification. proteins.

Dit zijn jouw voordelen als je samenvattingen koopt bij Stuvia:

Bewezen kwaliteit door reviews

Bewezen kwaliteit door reviews

Studenten hebben al meer dan 850.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet jij zeker dat je de beste keuze maakt!

In een paar klikken geregeld

In een paar klikken geregeld

Geen gedoe — betaal gewoon eenmalig met iDeal, creditcard of je Stuvia-tegoed en je bent klaar. Geen abonnement nodig.

Direct to-the-point

Direct to-the-point

Studenten maken samenvattingen voor studenten. Dat betekent: actuele inhoud waar jij écht wat aan hebt. Geen overbodige details!

Veelgestelde vragen

Wat krijg ik als ik dit document koop?

Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.

Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?

Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.

Van wie koop ik deze samenvatting?

Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper Jylan13. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.

Zit ik meteen vast aan een abonnement?

Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €4,49. Je zit daarna nergens aan vast.

Is Stuvia te vertrouwen?

4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)

Afgelopen 30 dagen zijn er 68175 samenvattingen verkocht

Opgericht in 2010, al 15 jaar dé plek om samenvattingen te kopen

Begin nu gratis
€4,49
  • (0)
In winkelwagen
Toegevoegd