Samenvatting
Samenvatting Tentamen 2 Genomics van ziekten
Samenvatting tentamen 2 oefentoets
[Meer zien]Voorbeeld 1 van de 5 pagina's
Voorbeeld 1 van de 5 pagina's
In winkelwagengesponsord bericht van onze partner
Gekoppeld boek
Titel boek:
Auteur(s):
- Uitgave:
- ISBN:
- Druk:
Voorbeeld van de inhoud
Samenvatting SyllabusHoofdstuk 6
Pre-processing van LC-MS data
Metaboliet profiling: Nuclear Magnetic Resonance (NMR), Liquid chromatography
(LC), gas chromatography (GC) en mass spectometry (MS).
LC/MS: individuele chemische componenten in aparte pieken, niet-gasvormende
stoffen worden ook gevonden.
Pre-processing -> peak tables met pieken per specifiek metaboliet en zijn
isotopen.
Piek hoogte en oppervlak: informatie over de relatieve concentratie
LC-MS data figuur: x-as: tijd. Y-as: intensiteit. Z-as: m/z waarden.
Total Ion Current (TIC): som van alle intensiteiten van alle m/z waarden (alle
massa’s laat hij zien, overall chromatography duidelijk)
Extracted Ion Chromatograms (EIC of XIC): som van intensiteiten van één of
meerdere m/z waarden (schone chromatogrammen, duidelijk te zien pieken,
potentiele isomeren duidelijk)
Identificatie van pieken:
Je verkrijgt dan piek positie, hoogte, oppervlakte en integratie grenzen -> peak
table
Aanpak: 1. Two directions: identificatie van pieken op de m/z as en de retentie
tijd 2. XIC/EIC slices: m/z as in kleine slices -> voor elke m/z slice een nieuwe
chromatogram (=EIC) 3. Model fitting: 2D gaussian curve op de data leggen.
We bespreken alleen optie 2.
EIC per bin -> peak detection op elke EIC.
Binning= m/z as in even grote stukjes hakken -> in elke tijd-punt op de slice
neemt men de maximale intensiteit.
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper elisjong. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €3,49. Je zit daarna nergens aan vast.
Is Stuvia te vertrouwen?
4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)
Afgelopen 30 dagen zijn er 49497 samenvattingen verkocht
Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen