Biochemie
1 Biomoleculen
1.1 Aminozuren
De persoonlijkheid van biomoleculen = functionele groepen
o D en L-vorm (mensen, zoogdieren)
o Hydrofiel/hydrofoob
o Naamgeving: 3 letter code/1 letter code
o Pkr waarden = lading van AZ afhankelijk van Ph
1.2 Indeling der aminozuren volgens eigenschappen zijketens
Nonpolair, alifatische zijketens
- Niet asymmetrisch
- Grote conformationele
flexibiliteit
(kunnen roteren rond de -C-
binding
- Inert en alifatisch
- Nonpolair, hydrofoob
- Geen functionele groepen
- Zijketens clusteren samen
In vitro mutagenesis (alanine)
: Het bepalen van belangrijke AZ -
zijketens bij een bepaalde binding
➔ Alle eiwitten (leucine) in een
plasmide (drager)
DNA + codons -> codon vervangen ->
RNA -> nieuw eiwit (alanine)
= ‘afknippen van zijketens’
5
, AZ met aromatische R-groepen
- Zeer hydrofoob
- Apolair
- Weinig reactief
- OH-groep
- Intermediair polair
Deelname aan H-bruggen
- Functionele groep in enzymen
= fosforylatieplaats
➔ Fosfaat inplanten op eiwit
Lichttechniek: meten van hoeveelheid eiwitten in
bijvoorbeeld medicatie
- Licht door een monochromator
- Licht met een bepaalde intensiteit uitgezonden,
door cuvette met vloeistof (eiwitten)
- Hoeveelheid opgenomen/uitgezonden licht
gemeten (absorbantie) = hoeveelheid eiwitten
6
,AZ met polaire, ongeladen R-groepen
- SH-groep
- Polair
- pKa: 8
- OXIDATIE: cystine vorming
- Disulfidebrug eiwit = 3D vorm
Belangrijke groep ih katalytisch
centrum enzyme:
: S aanval op enzym -> CoA los
- OH groep
- Polair
- Kunnen worden
gefosforyleerd
- Nemen deel aan H-bruggen
- Amiden
- Polair
- H-brugvorming
- Geen deelname aan H-
bruggen
- Cyclisch
- Gematigd polair
- Rigide vanwege ringvorm
Knikvorming ter hoogte van prolines
in peptideketen
➔ Bochtvorming binnen
eiwitketens (2 AZ verbonden
door peptide binding)
➔ TRANS configuratie is
gunstigst bij alle AZ
! Proline heeft CIS configuratie
= knikvorming ipv zigzagvorm
Histidine
- Dubbele binding: Imidazol
groep (R-groep)
- pKa= 7
- ‘multitool’ -> populair bij
katalitisch centra
- Zowel aanval nucleofiel als
elektrofiel
- 50/50 geladen/ongeladen
AZ met negatief geladen R-groep
- Zeer polair
- pKa 3,65 (D)
- pKa 4 (E)
- Volledig geïoniseerd op pH 7
- Metalen en kationen cheleren
= Ca2+ kan binden op –
plaats (bv. bij
spiercontractie)
8
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper merelBMW. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €12,49. Je zit daarna nergens aan vast.