Examples of viruses
➢ Smallpox
○ very old virus
○ Eradicated by vaccination (1967-1980 campaign)
➢ Poliomyelitis
○ very old virus
○ Caused by poliovirus, belonging to the family Picornaviridae
○ course of infection
■ infection via mouth
■ replication in the small intestine
■ Lymphnodes and bloodstream
■ Nerve infection: replication, intraneuronal spread
■ Excretion of virus in feces
○ paralysis, death, iron lungs
➢ Rinderpest
○ 90% of cattle died
➢ Measles
➢ Herpes virus infections
○ Chickenpox
○ shingles (girdle herpes)
○ fever blisters
➢ Human papillomavirus
○ HPV (genital) wart virus
○ Sexually transmitted
○ Some variants however cause (cervical) cancer
➢ HIV
○ It can lead to AIDS
○ Acquired Immuno Deficiency Syndrome: The virus targets the immune
system
General information viruses
➢ Virus = Smallest genetic entitiy
➢ All organisms have viruses
➢ Most viruses are found in surface water
➢ Adolf Mayer → found the first virus → tobacco mosaic disease
➢ very big variance in the genome sizes
inert
= inactive / non-moving
,The minimal virus
● DNA‐ or RNA‐polymerase → multiplication of RNA or DNA genome
● Coat or capsid protein → protection or host interactions
Shapes
Viral envelope
= A lipid bilayer/membrane with transmembrane proteins (spikes) pointing
outwards
, Lecture 1 part 2
Methods used in virology
Methods for generation and quantification of viruses
➢ Cultivation in host
○ whole organism
○ embryonated eggs
○ cell culture
→ Types of cell culture: primary culture and
immortalize line
➢ Isolation
○ Plaque purification (also used for quantification)
○ Centrifugation → Differential (low/high speed) or
density gradient (sucrose)
➢ Quantification
○ Real-time PCR
○ EPDA (End Point Dilution assay): TCID50 assay
Methods for structural investigation
➢ Localization and accumulation
○ Light microscopy → stain
○ Fluorescence microscopy → GFP fused protein
➢ Structure (3D)
○ Electron microscopy (scanning and transmission)
○ X-ray crystallography
○ NMR (nuclear magnetic resonance)
○ AFM (atomic force microscopy)
Methods for detection
➢ CPE
= cytopathic effect
= structural changes in host cells that are caused by viral invasion
➢ Microscopy-immunodetection
○ Immunostaining, immunofluorescence
○ ELISA
○ Western blot analysis
➢ Antigens-antibodies
○ Hemagglutination assay
= surface projections of viruses leads to
crosslinking of red blood cells. can be quantified
by making serial dilutions of the virus sample
➢ NATs = nucleic acid tests
NA is first extracted and purified, then detected using
PCR
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper célinebrouwerswur. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €5,98. Je zit daarna nergens aan vast.