Samenvatting
Samenvatting Cellen en Weefsels Hoofdstuk 7 Controle van genexpressie
- Instelling
- Universiteit Utrecht (UU)
Cellen en Weefsels Hoofdstuk 7 Controle van genexpressie
[Meer zien]Voorbeeld 2 van de 9 pagina's
Voorbeeld 2 van de 9 pagina's
In winkelwagengesponsord bericht van onze partner
Gekoppeld boek
Titel boek:
Auteur(s):
- Uitgave:
- ISBN:
- Druk:
Verkoper
VolgenVoorbeeld van de inhoud
- Chaperone: gekatalyseerde eiwitvouwing> zorgt dat molten globule beter gevouwd wordt
> herkennen hydrofobe sequenties aan oppervlak (slecht functioneren, aggregaten =
toxisch). Chaperone (hsp70) zorgt voor conformatieverandering (ATP)
> hsp60: kamertje waarin eiwit wordt opgenomen
- Cotranslational folding: tijdens translatie al
Monitoren van eiwitvouwing
- aggregatie voorkomen!
- slechte eiwitten afgebroken in proteasoom
> cilindervormige eiwitstructuur met proteases aan binnenkant
> herkent geubiquitineerde eiwitten -> afgeknipt -> opgezogen -> in ontvouwen vorm
in proteasoom afgebroken
Afbraak ook voor protein lifetime
- ubiquitinatie ligases -> zorgen voor afbraak
- afbraaksignalen activeren (fosforylatie/unmasking/onstabiele N kant)
Kennisclip I- Transcriptie regulatie
RNA seq: RNA isoleren uit weefsel -> cDNA van maken -> transcripten gesequenced -> weten wat tot
expressie komt
In situ hybridisatie: fluorescente RNA probe -> welke delen van hersenen een gen tot expressie
brengen
Transcriptie regulators: binden (in buurt) van promoter
CHIP: transcriptieregulatoren gecrosslinkt aan DNA -> cellen gelyseerd -> immunoprecipitatie
(antilichaam tegen TcF) -> DNA met factor gaat uit mengsel -> crosslinks verwijderd -> DNA
amplificeren -> ontdekken op welk DNA transcriptieregulatoren binden
Reporter genen: DNA uitknippen en daarachter reporter gen plaatsen (LacZ/GFP) -> testen -> in
welke weefsel expressie plaatsvindt
Hoe binden transcriptiefactoren aan sequenties?
- binden aan buitenkant, interactie met baseparen major groove
- homeodomein maakt verbindingen (zoals waterstofbrug) met basenparen
Leucine zipper: hydrofobe interacties tussen 2 a helixen -> aan einde a helix in grote groeve DNA
(heeft dus 2 binding sites omdat het dimeer is)
* dimerisatie maakt binding site langer + hogere specificiteit
Coöperativiteit: dimeriseren eiwit
Bij lage conc geen binding, bij bepaalde conc een transitie, bij hoge conc sterke binding
Coactivatoren/repressoren: binden aan complexen en helpen met aan/uitzetten
, Transcriptie activatoren
1. Binding andere regulatoren
2. Lokken RNA pol naar promoter
3. Vrijlaten RNA pol voor transcriptie
4. Vrijlaten RNA pol van plaats / pauzeren voorkomen -> verloopt beter
Chromatine remodeling complex -> histon chaperones -> DNA toegankelijk maken
Chromatine modificatie voorbeeld
1. Transcriptie activator bindt
2. Histon acetyltransferase -> H3K9 acetylatie
3. Histon kinase aangetrokken -> fosforylatie H3S10
4. Chromatine remodeling complex aangetrokken -> nucleosomen opschuiven
5. TFIID bindt TATA box + interactie gefosforyleerde staart H3
6. Assemblage -> RNA pol -> transcriptie
Repressie genexpressie
- Over algemeen remt chromatine genexpressie, remodeling of door methylatie of deacetylatie
Hoe spreid activatie/inactivatie? -> insulators + barrier sequences
Insulator: DNA element sluit chromatine loops -> 1 lus gereguleerd als 1 systeem (cis)
Kennisclip II
> Activatie van transcriptiefactoren
1. Productie eiwitten
2. Binding ligand
3. Covalente modificatie
4. Tweede subunit toevoegen
5. Inhibitor weghalen
6. Stimuleren van entry in kern
7. Vrijlating van membraan (door bijv. protease)
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper mirthewesterlaken. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €4,29. Je zit daarna nergens aan vast.
Is Stuvia te vertrouwen?
4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)
Afgelopen 30 dagen zijn er 67474 samenvattingen verkocht
Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen