Samenvatting
Samenvatting alle leerdoelen week 8 uitgewerkt
- Instelling
- Universiteit Utrecht (UU)
Top voor het leren voor het tentamen! Alle leerdoelen van week 8 (deel micro-organismen) uitgewerkt.
[Meer zien]Voorbeeld 2 van de 6 pagina's
Voorbeeld 2 van de 6 pagina's
In winkelwagengesponsord bericht van onze partner
Verkoper
Volgen
Voorbeeld van de inhoud
Na het bestuderen van de leerstof van deze week moet je het volgendekunnen:
Uitleggen hoe het genetisch materiaal van een prokaryoot en eukaryoot van elkaar
verschillen qua structuur en verhouding coding versus non-coding
o Prokaryoot: heeft circulair DNA.
Vaak haploid.
Hebben plasmiden die onafhankelijk kunnen repliceren
Hebben een operon
o Eukaryoot: lineair DNA.
Replicatie en translatie zijn gescheiden.
Hebben intronen en exonen
Aangeven wat plasmiden zijn en voorbeelden noemen van eigenschappen die door
plasmiden worden gecodeerd
o Is circulair DNA wat onafhankelijk kan repliceren.
o Dragen eigenschappen die niet essentieel zijn voor de overleving van de bacterie
Antibiotica resistentie
Virulente genen
Symbiose
Metabolische routes pathways
Uitleggen wat de correlatie is tussen genoom grootte en het leven in verschillende niches
o Als het genoom van een bacterie groter is kan hij in meer niches overleven
Uitleggen wat we bedoelen met stam en serotype en hoe we bepalen of een bacteriestam
tot een bepaalde soort behoort
o Soort bepalen
Combineren van eigenschappen
Als de 16S rRNA genen identiek zijn of meer dan 95% gelijk
Als de huishoudengenen identiek zijn of meer dan 95% gelijk
o Hierdoor krijg je ook verschillende stammen
Door vergelijken van genoom
En combineren van eigenschappen
o Je kan ook verschillende serotypen krijgen
Gaat over antigenen die op het micro-organismen aanwezig zijn
Uitleggen hoe we coli-forme bacteriën identificeren met MacConkey medium
o Op het MacConckey agar zitten galzouten waat gram positieve niet op kunnen
groeien
o Vervolgens kijken naar de vergisting van lactose: alleen coliforme bacterien kunnen
dat.
Aangeven wat frameshift, nonsense, missense, silent mutaties zijn en voorbeelden noemen
van andere DNA-veranderingen
o Frameshift: het hele leesraam veranderd door een deletie of insertie
o Nonsene: zorgt voor een vroegtijdig stopcodon door een puntmutatie
o Missense: een verkeerd aminozuur
o Silent mutaties: codeerd voor zelfde aminozuur heeft geen gevolg.
Aangeven hoe we horizontale genoverdracht in een genoom sequentie kunt herkennen
o Het gen kan sterk overeenkomen met een soort die ver weg ligt in de fylogenie
o Als het gen een ander G/C gehalte of codon gebruikt dan in de rest van het genoom
o Als ze sterk lijken op restanen van mobiele elementen
o Genomic islands: groot stuk van het chromosoom is waarschijnlijk verkregen door
HGZ
, Uitleggen wat een pan genoom en een core genoom is
o Pan genoom: alle genen die in een soort voorkomt. Neemt toe naarmate je
sequenst.
o Core genoom: alle genen die in iedere stam aanwezig zijn. Hoe meer je sequenct hoe
kleiner het genoom
Uitleggen wat we verstaan onder genoomplasticiteit en de mechanismen die daarbij een rol
spelen
o Het genoom kan veranderen van grootte en van inhoud. Het is een optimalisatie van
het genoom aan de hand van mutaties, recombinaties en duplicatie
o Mechanismen
Genoom reductie: er vindt een deletie plaats (genoom wordt kleiner)
Horizontale genoverdracht
Conjugatie (cel-cel contact via pili)
Transductie (DNA-overdracht via fagen)
Transformatie (opname van los DNA)
De verschillende niveaus van regulatie kunnen aangeven en uitleggen de verschillen tussen
prokaryoten en eukaryoten
o Prokaryoot: heeft 1 compartiment dus de transcriptie en translatie kan tegelijk
gebeuren en is 1 proces.
Ze hebben een promotor, operon en repressor
Meerdere genen achter 1 promotor
o Eukaryoot: heeft verschillende compartimenten dus transcriptie en translatie is
apart.
Processing mRNA: capping, splicing.
Intronen en exonen
De stappen van de levenscyclus van Myxobacterium xanthus beschrijven
o Gram negatieve bacterie heeft een groot genoom en is een predator.
o Vegatieve groei. Ze jagen samen.
o Nutriententekort
Aggregaten
Differentiatie
Endosporen (cellen komen in een rustfase en kunnen overleven)
Aangeven welke vormen van beweging er zijn en welke organellen daarbij een rol spelen
o Ze bewegen met type 4 pili en ze hebben een soort slijm waardoor ze makkelijker
glijden.
o Ze bewegen voor- en achteruit.
Uitleggen hoe we processen bestuderen door middel van (random) mutanten
o Door random genen uit te schakelen kun je vervolgens zien welk gen er invloed op
heeft.
De drie manieren van horizontale DNA-overdracht noemen, vergelijken en herkennen
o Transformatie: de opname van DNA uit de omgeving
Als er een cel dood is gegaan kan de inhoud nog in de omgeving zijn.
Ontvangende cel kan dat fragment opnemen.
Het kan verloren gaan of het kan gaan repliceren of recombineren (stukje
wordt opgenomen in DNA van de ontvangende cel)
o Conjugatie: cel-cel contact
Gaat vaak over plasmiden
De cel met de plasmiden is de F+ cel en de ontvangende cel is de F- cel. F is
de factor.
Er wordt een brug van pili gemaakt door de donorcel. Tra genen.
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper linarundberg. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €5,30. Je zit daarna nergens aan vast.
Is Stuvia te vertrouwen?
4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)
Afgelopen 30 dagen zijn er 47561 samenvattingen verkocht
Opgericht in 2010, al 15 jaar dé plek om samenvattingen te kopen