Samenvatting
Samenvatting Onderzoeksmethoden Thema 1 Chemicaliën lijst
- Instelling
- Universiteit Utrecht (UU)
Alle chemicaliën die je moet weten voor het tentamen staan in deze lijst/tabel overzichtelijk weergegeven.
[Meer zien]Voorbeeld 2 van de 6 pagina's
Voorbeeld 2 van de 6 pagina's
In winkelwagengesponsord bericht van onze partner
Voorbeeld van de inhoud
Chemicaliën lijstVIRULENTIE
KAPSELDETECTIE
Oost-Indische inkt Kleurt de omgeving van de cellen.
Methanol Methanol vangt watermoleculen weg, waardoor
eiwitten denatureren. Hierdoor wordt het
preparaat gefixeerd, want er vinden geen
biologische processen meer plaats.
Kristalviolet Kleurt de cellen.
KATALASE ASSAY
(3%) Waterstofperoxide (H2O2) Doodt bacteriën en andere pathogenen. Het is
een schadelijke stof die kan worden omgezet naar
water en zuurstof door het enzym katalase. Deze
stof is nodig bij de katalase-assay om te kijken of
de bacteriën katalase kunnen uitscheiden.
IDENTIFICATIE VAN MO
GRAM-KLEURING
Kristalviolet Kleurstof die wordt opgenomen door bacteriën.
Kleurt de peptidoglycaanlaag in de bacteriële ce
lwand.
Jodiumoplossing Vormt een complex met kristalviolet door middel
van elektrostatische interactie, hierdoor wordt
het kristalviolet gefixeerd in de celwand.
Ontkleuringsvloeistof (70% ethanol) Spoelt de kristalvioletkleuring weg bij de
gramnegatieve bacteriën. De dikkere
peptidoglycaanlaag bij grampositieve bacteriën is
moeilijker te doordringen voor ethanol. En
verhindert daarmee de ontkleuring. Daardoor
hebben deze bacteriën een blauw/paarse kleur
onder de microscoop.
Oplossing van fuchsine in water Kleurstof die de ontkleurde gramnegatieve
bacteriën een roze/rode kleur geeft, waardoor ze
zichtbaar zijn onder de microscoop.
DNA-PLASMIDE ISOLATIE
Oplossing I 0.9% glucose Glucose buffert bij pH net boven de 12. Verder
zorgt glucose voor een isotone oplossing,
waardoor de cellen niet te vroeg lyseren.
23 mM Tris/HCl pH 8.0 Tris/HCl buffert bij een pH van 8, optimale
zuurgraad omgeving bacteriën.
10 mM EDTA Is een gelator: vangt covalente kationen weg. In
dit geval wordt Mg2+ (cofactor DNAase)
weggevangen. EDTA maakt DNAse onschadelijk.
Oplossing II 0.12 M NaOH Accepteert protonen uit de celwand waardoor de
celwand toegankelijker wordt. Hierdoor kan SDS
makkelijker bij het celmembraan. Hierdoor vindt
lysatie beter plaats.
1% SDS Een zeep die de eiwitten denatureert door het
verbreken van niet-covalente verbindingen.
, Oplossing III 3 M KAc Kaliumacetaat bindt aan de DS- die zich op de
eiwitbackbone bevinden. Hierdoor worden de
eiwitten onoplosbaar en slaan ze neer. Acetaat
buffert rond pH 4.75 waardoor het DNA niet
beschadigd en de pH niet te laag wordt.
11.5% azijnzuur Verzuurt de oplossing waardoor het DNA
hybridiseert (enkele strengen binden).
Oplossing IV Fenol Denatureert eiwitten doordat het zeer apolair is.
De binnenzijde van de meeste eiwitten is apolair
en apolair lost op in apolair. Wanneer fenol wordt
toegevoegd keren de eiwitten binnenste buiten
zodat de apolaire binnenkant kan oplossen in de
apolaire fenol. Fenol lost ook eventuele
hydrofobe lipiden op.
Chlorofoom Fenol met de gedenatureerde eiwitten lost hierin
op. Chlorofoom heeft een hogere dichtheid dan
water, waardoor na vortexen een organische fase
(beneden) en waterige fase (boven) ontstaat.
Oplossing V 10 mM Tris/HCl pH 8.0 Tris/HCl buffert bij een pH van 8, optimale
zuurgraad omgeving bacteriën. Voorkomt het
kapotgaan van DNA door te veel protonen/OH.
0.1 mM EDTA EDTA voorkomt weer de afbraak van DNA door
het wegvangen van de co-factor.
20 µg/ml RNAase Breekt verontreinigd RNA af.
96% ethanol Hiermee wordt fenol/chloroform uit de oplossing
gewassen. Door de toevoeging van ethanol slaat
het DNA neer waarbij de strengen intact blijven.
Fenol/chloroform lost op in ethanol samen met
eventuele andere apolaire stoffen.
70% ethanol Hierin lost de pellet niet in, maar eventuele
zouten wel. Zo worden zouten dus uit het
monster gehaald.
Agarose Polysacharide waarvan gel wordt gemaakt voor
het runnen van een gelelektroforese.
TBE Tris/Boraat/EDTA functioneert als buffer in de
agarose gelelektroforese. Tris is een base en
boraat is een zuur. Samen zorgen ze voor het
behouden van de pH tussen 8.0 en 8.5. EDTA
vangt magnesium weg, de cofactor van DNAase,
zodat DNA niet wordt afgebroken.
Ethidiumbromide Een fenantridide kleurstof die wordt gebruikt om
DNA/RNA aan te tonen. Ethidiumbromide heeft
een vlakker structuur en kan daardoor tussen de
basen van het DNA/RNA gaan liggen. Bij
gelelektroforese wordt het onder een UV-lamp
zichtbaar.
Orange-G loading dye Bevat orange G, glycerol, TRIS-HCl en EDTA. Deze
stof loopt net zoals DNA door de gel heen
waardoor dit een indicator is van of het proces al
afgelopen is. Daarnaast verhoogd glycerol de
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper fleurheling. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €4,49. Je zit daarna nergens aan vast.
Is Stuvia te vertrouwen?
4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)
Afgelopen 30 dagen zijn er 53022 samenvattingen verkocht
Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen