Samenvatting
Samenvatting H9 "Bioinformatic and Functional Genomics"
- Instelling
- Hanzehogeschool Groningen (Hanze)
Samenvatting H9 "Bioinformatic and Functional Genomics", dit hoofdstuk gaat over next generation sequencing.
[Meer zien]Voorbeeld 2 van de 6 pagina's
Voorbeeld 2 van de 6 pagina's
In winkelwagengesponsord bericht van onze partner
Gekoppeld boek
Titel boek:
Auteur(s):
- Uitgave:
- ISBN:
- Druk:
Voorbeeld van de inhoud
Hoofdstuk 9: NGS➢ Sanger sequencing: what we had before NGS
♥ Introduced in 1977
♥ A template is denatured to form single strands, and extended with a polymerase in the presence of dideoxynucleotides
(ddNTPs) that cause chain termination.
♥ Typical read lengths are up to 800 base pairs. For the sequencing of Craig Venter’s genome (2007; first whole genome
of an individual), Sanger sequencing was employed because of its relatively long read lengths.
♥ DNA sequencing by the Sanger method
♪ Dideoxynucleotides (ddNTPs)( -OH of dNTP is replaced by -H of ddNTP at the 2’ ribose position)
❖
♪ Primer elongation, chain termination upon incorporation of ddNTP, separation, detection
❖
♪ View genomic DNA (here from the beta globin locus) from the Trace Archive at NCBI: FASTA format
❖
• Each DNA base in the Trace Archive has an associated base quality score (best scores highlighted in yellow)
, ➢ Next-generation sequencing
♥ Technologies:
♪
♪ Illumina
❖ Disadvantage:
• Short read length (~150 bases)
❖ Advantages:
• Very fast
• Low cost per base
• Large throughput; up to 1 gigabase/experiment
• Short read length makes it appropriate for resequencing
• No need for gel electrophoresis
• High accuracy
• All four bases are present at each cycle, with sequential addition of dNTPs.
This allows homopolymers to be accurately read.
❖ Sequencing by Illumina technology
•
Dit zijn jouw voordelen als je samenvattingen koopt bij Stuvia:
Bewezen kwaliteit door reviews
Studenten hebben al meer dan 850.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet jij zeker dat je de beste keuze maakt!
In een paar klikken geregeld
Geen gedoe — betaal gewoon eenmalig met iDeal, creditcard of je Stuvia-tegoed en je bent klaar. Geen abonnement nodig.
Direct to-the-point
Studenten maken samenvattingen voor studenten. Dat betekent: actuele inhoud waar jij écht wat aan hebt. Geen overbodige details!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper wendyvandermeulen. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €6,49. Je zit daarna nergens aan vast.
Is Stuvia te vertrouwen?
4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)
Afgelopen 30 dagen zijn er 69052 samenvattingen verkocht
Opgericht in 2010, al 15 jaar dé plek om samenvattingen te kopen