Samenvatting
Samenvatting H1 "Bioinformatic and Functional Genomics"
- Instelling
- Hanzehogeschool Groningen (Hanze)
Samenvatting H1 "Bioinformatic and Functional Genomics", dit is een moleculaire opfrisser.
[Meer zien]Voorbeeld 2 van de 6 pagina's
Voorbeeld 2 van de 6 pagina's
In winkelwagengesponsord bericht van onze partner
Gekoppeld boek
Titel boek:
Auteur(s):
- Uitgave:
- ISBN:
- Druk:
Voorbeeld van de inhoud
Hoofdstuk 1: moleculaire opfrisser➢ What is ‘modern’ biotechnology?
♥ In vitro propagation, cell & tissue culture
♪ disease-free, clean, well-defined material
♥ Molecular markers
♪ improved selection; diagnostics
♥ Genetic engineering
♪ recombinant DNA, transgenics; diagnostics
♥ Omics technologies
♪ High throughput data collection; technologies
♪ DNA, RNA, protein, metabolites
♪ Bioinformatics, computational biology
➢ Hierarchy of biological organization
♥
➢ Prokaryotes <-> Eukaryotes
♥ (almost) all organisms contain DNA, RNA and protein
♥ different ways of storing DNA
♪ Nucleus in eukaryotes
♥ complexity versus efficiency ?
♪ prokaryotes (Escherichia coli):
❖ small, unicellular, efficient
♪ eukaryotes (plant, human):
❖ large, multicellular, subcellular, complex
♥ Genes of eukaryotes are split
♪ DNA not co-linear with mature RNA, but longer
❖ primary transcript is ~ as long as the DNA
♪ RNA undergoes further modification
❖ in which parts of the RNA are removed
❖ modification is called: splicing
• the removed parts are called ‘introns’ or ‘intervening sequences’
• introns may have a function
• intron splice sites are conserved
• various mechanisms exist for splicing
➢ Differentiation: a conceptual issue
♥ all cells of an organism contain the same DNA, (yet, not all that DNA is identical),
yet, not all cells use the same DNA, therefore, not all cells look the same.
♪ differential use of the same genetic information gives different results
♪ how is the differential usage organized?
♥ disease is often caused by errors in or misuse of the genetic material
➢ Biological information transfer (central dogma)
, ♥
♥ Much more complex!
♪
♥ DNA (makes DNA) makes RNA makes protein (makes metabolites makes action makes phenotype)
♪ DNA makes DNA: replication
❖ by DNA polymerase
❖ in 5’ -> 3’ direction only
❖ in nucleus
❖ requires beginning (= primer)
❖ involves numerous other factors and proteins
• e.g. DNA ligase
❖ Applications:
• PCR
exponential amplification of DNA
uses DNA polymerase and two opposing primers
rounds of DNA denaturation and DNA synthesis
○ smart tric: DNA polymerase from thermophilic organism (e.g. Thermus aquaticus -> Taq polymerase)
many, many applications
○ detection; mapping; mutagenesis; gene isolation; sequencing; cloning
Read length and pairing
○ Short reads are problematic, because short sequences do not map uniquely to the genome.
○ Solution #1: Get longer reads.
○ Solution #2: Get paired reads.
• DNA sequencing
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper wendyvandermeulen. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €6,49. Je zit daarna nergens aan vast.
Is Stuvia te vertrouwen?
4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)
Afgelopen 30 dagen zijn er 53340 samenvattingen verkocht
Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen