Contents
7. Data-analyse en Databanken..............................................................................................................2
7.1. Literatuur.....................................................................................................................................2
7.1.2. Data repositoria....................................................................................................................2
7.1.3. Data platformen....................................................................................................................2
7.2. Data-analyse................................................................................................................................3
7.2.1. Annotatie van genlijsten.......................................................................................................3
7.2.2. Interactienetwerken (3.4.4.2.)..............................................................................................4
7.2.3. Structuuranalyse van biomoleculen (3.4.4.3.)......................................................................4
, 7. Data-analyse en Databanken
Vroeger bottle neck om data te generenen Nu bottle neck om date te verwerken.
7.1. Literatuur
Pubmed & web of science: Peer reviewed artikels (onderzoek artikels en literatuuroverzichten
(reviews))
Sci-hub: Gratis toegang tot gepubliceerde artikels normaal betalend in tijdscrhiften.
erg controversieel!
Google scholar: peer reviewed artikels & zeer recente artikels
Preprint servers: Artikelen die vaak nog geen peer review ondergaan hebben kwaliteit zeer
variabel! Meest recente onderzoeksresultaten gratis delen.
JoVE (Journal of Visualized Experiments): Peer reviewed video’s van methoden en protocollen,
slechts beperkt gratis.
Patenten (= octrooien):
- Een exclusief recht op het commercieel exploiteren van een uitvinding
- Omvat ook een publicatie van de uitvinding
- Te bekijken in specifieke databanken (bv. Espacenet, The lens, etc.)
7.1.2. Data repositoria
- Data portalen van waarop ‘ruwe’ (= nog niet geanalyseerde) data kunnen worden
gedownload
- Zoeken via ‘accesion number’ uit publicatie of via zoektermen
- Laat toe om dure -omics datasets te hergebruiken voor nieuwe onderzoeksvragen
PRIDE database: Maasa spectrometrie proteomics datasets
PDB (Protein Data Bank): 3D structuurinformatie van eiwitten
7.1.3. Data platformen
- Data portalen van waarop data kunnen geraadpleegd worden, vaak op een visueel
attractieve manier
- Laat toe om zaken gemakkelijker op te zoeken
7.1.3.1. DNA
Genome browsers:
- Ensembl, UCSC
- Genomische locatie, gensequentie, alternatieve transcripten, etc. van een gen opzoeken
- Data ENCODE (ENcyClopedia Of DNA Elements) raadplegen
Genecards: overzicht van informatie over een gen, met links naar meer gerichte data platformen
Ziektegenen:
- OMIM (Online Mendelian Inheritance in Man):
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper lukanys11. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €2,99. Je zit daarna nergens aan vast.
