Samenvatting
Samenvatting Farmaceutische Microbiologie
- Instelling
- Rijksuniversiteit Groningen (RuG)
Volledige samenvatting Farmaceutische Microbiologie met alle colleges. Geschikt voor de voorbereiding van het tentamen.
[Meer zien]Voorbeeld 4 van de 69 pagina's
Voorbeeld 4 van de 69 pagina's
In winkelwagengesponsord bericht van onze partner
Gekoppeld boek
Titel boek:
Auteur(s):
- Uitgave:
- ISBN:
- Druk:
1 beoordeling
Door: marjavanderwerf • 6 jaar geleden
Voorbeeld van de inhoud
Farmaceutische microbiologieCollege 1: Microbiële diversiteit – algemene microbiologie
Microbiële diversiteit = de diversiteit die je in verschillende micro-organismen hebt. Deze is groot,
omdat overal waar je bent je micro-organismen hebt die zich aanpassen aan de omstandigheden
waarin ze leven. De diversiteit in omgevingen komt tot uitdrukking in de diversiteit van micro-
organismen. Er is ook een diversiteit in voedingsstoffen aanwezig en op basis daarvan wordt ook hun
metabolisme aangepast. Dit zorgt voor een diversiteit in metabolisme.
• De meeste micro-organismen maken gebruik van prokaryote cellen.
Micro-organismen zijn kleine organismen. Ze zijn niet zichtbaar met het blote oog (< 100 μm). Ze zijn
tussen de 1 – 10 μm en door middel van een microscoop kunnen ze zichtbaar worden gemaakt.
• Doordat ze niet goed zichtbaar zijn, is het lang onbekend geweest dat deze micro-
organismen bestonden.
Anthonie van Leeuwenhoek heeft als eerste een microscoop gemaakt en ontdekt dat micro-
organismen aanwezig zijn.
• Door de lens worden dingen vergroot die erachter liggen.
De micro-biologie is de bestudering van microscopische kleine organismen zoals bacteriën, archaea,
schimmels en gisten, algen, protozoën en virussen. Dit zijn vaak eencelligen. Tijdens de colleges
wordt gekeken naar prokaryote micro-organismen, de bacteriën en archea.
• De eencellige micro-organismen overleven vaak onafhankelijk van elkaar.
• Het zijn organismen en daardoor zijn het levende wezens. Ze kunnen zichzelf daardoor
voortplanten.
o Micro-organismen zijn de kleinste vormen van levende organismen.
o De kleinste vormen zijn één cel en daardoor ook wel eencellige genoemd.
o Hierin is alles aanwezig voor leven en reproductie.
• Virussen zijn NIET cellulair.
o Ze hebben een host-cel nodig voor reproductie, dus hier gaat de “definitie” fout.
Toch zijn het wel micro-organismen, alleen niet cellulair.
• Er is een grote metabolische diversiteit.
o Met een bestaan van 3,8 miljard jaar (evolutie).
Macro-organismen zijn vaak meercellig en worden ook wel de hogere organismen genoemd.
Deze zijn wel zichtbaar voor onze ogen. Het organisme als geheel, met een verzameling van cellen
die niet gelijk hoeven te zijn, plant zich voort als samenstelling van de cellen dat het organisme
vormt.
• Er zijn verschillende cellen met verschillende functies aanwezig.
Wanneer er in het laboratorium één cel uit een hoger organisme eruit wordt gehaald en apart wordt
gekweekt in de juiste omstandigheden, noemen we dit een cellijn.
De hogere organismen zijn ontstaan uit micro-organismen tijdens de evolutie. Dit is nog steeds
zichtbaar, omdat veel metabole processen in micro-organismen ook in de hogere organismen
aanwezig zijn. De afbraak van glucose in een bacterie wordt afgebroken in de glycolyse, net zoals in
de mens.
• Dit principe, dat de chemische processen die zich afspelen in ons lichaam, terug worden
gevonden in micro-organismen is de eenheid van de biochemie.
• Veel kennis over levende cellen is ontleend aan bestudering van micro-organismen (“eenheid
van de biochemie”). Daarmee werd veel geleerd over het functioneren van de cellen van ons
eigen lichaam.
• Vaak wordt gebruik gemaakt van makkelijk kweekbare organismen.
o Deze vermeerderen zich snel en kunnen dus sneller worden bestudeerd dan hogere
mechanismen en kunnen ook weer worden “weggegooid”.
,Farmaceutische microbiologie
o Wel blijven het eenvoudige organismen, dus voor bestudering van moeilijkere
functies niet mogelijk.
Micro-organismen en hun omgeving
Micro-organismen zijn overal aanwezig. Door middel van een fluorescentie probe kan onderscheid
worden gemaakt tussen micro-organismen. De verschillende micro-organismen zijn bij elkaar
aanwezig, als “klontjes” bij elkaar van dezelfde soort.
• Eén groep micro-organismen is een populatie en is ontstaan uit één cel door herhaaldelijke
deling. Daardoor ontstaat een groepje van dezelfde bacterie, omdat ze zijn ontstaan uit één
delende bacterie.
• Meer populaties van micro-organismen vormen samen een microbiële gemeenschap.
• De plaats waar de micro-organsimen leven, bijv. het slib, is de habitat. Deze kunnen erg
verschillend zijn voor een micro-organsime.
o Een organisme groeit in een habitat, omdat het zich aan past aan de habitat.
o Door verschillende habitats krijg je dus verschillende micro-organismen.
o Bijvoorbeeld: bodem, pens van herkauwers, tandplak (“biofilm”), darm (voor
voedselvertering.
• De habitat + microbiële gemeenschap is een ecosysteem. Een ecosysteem is het geheel van
alle organismen, hun interacties en hun fysische en chemische omgeving.
o Je kunt het ecosysteem op verschillende manieren definiëren.
Wanneer je één enkele alg hebt, zie je dit niet op het oppervlakte. Wanneer dus micro-organismen in
grote hoeveelheden aanwezig zijn, zijn ze wel zichtbaar. Door hun grote aantallen beïnvloeden
micro-organismen hun omgeving sterk (ze vertegenwoordigen grootste biomassa op aarde).
De drijvende kracht voor het onderzoek van micro-organismen is de medische microbiologie. De
pathogene micro-organismen zijn niet prettig voor het menselijk lichaam en veroorzaken ziekte.
• Een besmetting heeft te maken met de overdracht van micro-organismen.
• Door te kijken naar ziektes, is men veel te weten gekomen over micro-organismen.
Het grootste succes heeft de laatste 100 jaar plaatsgevonden, om de pathogene micro-organismen te
bestrijden. Vroeger gingen meer mensen dood aan infectie ziekten (1900) dan tegenwoordig. Dit was
ook de voornaamste doodsoorzaak.
• Door bestudering van micro-organismen is de doodsoorzaak door infectie ziekten
teruggedrongen.
Er zijn drie redenen waardoor infectie ziekten onder controle zijn gekomen en niet meer dodelijk zijn:
1. Vaccinaties. Vooral belangrijk voor het voorkomen van virus infecties.
2. Hygiëne. Het heeft ermee te maken met het feit dat het besmettelijke ziektes zijn die kunnen
worden overgedragen van de één naar de ander.
3. Antibiotica.
In Afrika sterven nog steeds meer mensen aan infectieziekten dan in Amerika. Dit komt door de
verslechterde leefomstandigheden. Het grote succes van antibiotica en hygiëne is dat we altijd
“verder” willen gaan. Dit gaat daardoor ook steeds meer tegen ons werken.
• Zo ontstaat antibiotica resistentie.
• Door toename van hygiëne ontstaat een verminderde weerstand, waardoor immuno-
gerelateerde ziektes meer in opkomst komen.
o Ons lichaam moet getraind worden om onszelf te verdedigen tegen indringers.
Menselijk microbioom.
Lang niet alle micro-organismen zijn pathogeen, maar ze kunnen ons ook helpen en nuttig zijn. Er
leven veel micro-organismen op ons lichaam en dit wordt het menselijk microbioom genoemd.
Rond 1950 is door middel van genetische technieken, waarbij naar het DNA van micro-organismen
werd gekeken, het “humane microbiome project” opgestart om deze te identificeren.
,Farmaceutische microbiologie
• Zowel in je darmen, als mond, neus en huid en de genitaliën zijn micro-organismen aanwezig.
Ze verdwijnen niet. Er zijn 3x zoveel microbiële cellen dan eigen cellen. De micro-organismen
zijn belangrijk voor ons lichaam, zoals de darmflora.
Micro-organismen betekenen ook veel voor de maatschappij:
• Landbouw en veeteelt.
o Voor het omzetten van elementen die nodig zijn voor groei. Zo spelen ze een rol in
de stikstof cyclus. Dit is stikstoffixatie. Wij als mensen pikken één soort stikstof eruit
die we nodig hebben en die we kunnen fixeren en opnemen.
o Methaan productie (broeikasgas)
o Mineralisatie (“nutriënt cycling”)
• Gezondheid
• Voedselproductie
o Conservering. Verschillende fermentaties waardoor producten langer houdbaar zijn.
o Zuivel
o Alcoholische dranken productie van ethanol.
o Brood gebruik van gist.
• Energie en milieu
o Biobrandstoffen
o Mijnindustrie, het koperzout wordt omgezet naar koper door organismen.
o Bioremdiatie.
• Biotechnologie
o Genetische modificatie
o Productie van farmaceutica.
We proberen nu alles te maken met micro-organismen. Dit komt door de grote diversiteit van het
metabolisme. Dus ze kunnen overal voor worden gebruikt, om bepaalde reacties te laten verlopen.
College 2: Microbiële diversiteit – evolutie/diversificatie
Om te weten waar micro-organismen vandaan komen, moet gekeken worden naar evolutie en de
ontwikkeling van het leven op aarde. De aarde is 4,6 miljard jaar oud. Het eerste leven wat zich kon
repliceren, is 4 miljard jaar geleden ontstaan. Hoe het eruit zag is niet bekend. Het was een warme,
reducerende omgeving zonder zuurstof.
• De energie die nodig was om te leven kwam alleen van het licht. Dit gebeurt nu nog steeds,
zoals planten energie uit zonlicht halen. Er werd geleefd in een anaerobe omgeving. Het zijn
fototrofe micro-organismen energie uit licht halen.
De micro-organismen veranderden zich continue en gingen zich aanpassen aan de omgeving.
• Sommige micro-organismen konden water reduceren waardoor zuurstof ontstond. Daardoor
kwam steeds meer zuurstof in de lucht. Zuurstof kon worden gebruikt om energie uit andere
moleculen te halen door oxidatie reacties. Daardoor stapten de micro-organismen van
energiebron van het licht naar chemische oxidatie.
Daardoor ontstaat een grotere verscheidenheid van micro-organismen, door verschillende metabole
processen. Na 2 miljard jaar ontstond een nieuwe celsoort, een eukaryote cel.
• Dit is een ingewikkeldere celsoort en maakte de weg open dat steeds
ingewikkeldere micro-organismen, die meer konden, ontstonden.
0,5 miljard jaar geleden ontstonden dus meercellige organismen, dus cellen met
meerdere functies. Hiervoor waren alleen eencellige organismen aanwezig.
• Hieruit ontstonden vervolgens de planten. Later ontstonden pas de
dieren en de mensen.
o Volgens de schaalverdeling zijn de mensen net ontstaan.
, Farmaceutische microbiologie
We kunnen kijken naar bijv. een overgang van een prokaryote cel naar eukaryote cel. Bij een
overgang waarbij een nieuw organisme ontstaat, zijn twee dingen van belang:
1. Een nieuw organisme ontstaat omdat er een behoefte aan is. Ze gaan ergens anders wonen
waar ze iets anders en dus iets meer moeten kunnen.
• Ze ontstaan uit het oude organisme, maar er is iets bij gekomen, waardoor ze iets
meer kunnen doen waar behoefte aan is.
• Dit is het idee van de biochemie. Het grootste gedeelte is nog het oude, dit werkte
wel goed in de nieuwe omgeving.
2. Wat gebeurt is een selectieproces. Er is een hoeveelheid micro-organismen met een
bepaalde habitat aanwezig, waar ze eigenlijk niet kunnen leven. In een paar micro-
organismen ontstaat daardoor iets waardoor ze wel kunnen leven.
• De ouden lopen dus nog wel door, ze blijven nog wel bestaan.
• Dus de micro-organismen van de “gele band” zijn afgekomen van de eerste micro-
organismen. De soorten zijn wel wat aangepast en veranderd.
• Wat dus nu aanwezig is, is het resultaat van verschillende micro-organismen die
ontstaan zijn in verloop van de tijd. Er kunnen ook micro-organismen verdwijnen.
Tree of life
We kunnen ook kijken naar de tree of life. Hierin is ook het ontstaan van leven zichtbaar.
• Luca is het begin van de tijd van leven. De verschillende vertakkingen laten het ontstaan van
verschillende micro-organismen zien.
De “tree of life” is gebaseerd op genetische informatie.
Hieruit blijkt dat er 3 grote groepen zijn, dit zijn domeinen:
• Bacteriën
• Archaea
• Eukarya
Dit zijn de drie domeinen van het leven. Dit zijn drie grote
levensvormen, gebaseerd op genetische informatie door sequenching van het DNA.
• Door de volgordes met elkaar te vergelijken kan worden gekeken naar hoe de evolutie heeft
plaatsgevonden en hoe we terug rekenen naar de oorsprong van leven.
Er zijn twee soorten cellen aanwezig:
• Prokaryoten; eenvoudige cellen qua opbouw.
o Archaea en bacteriën. Vroeger waren de bacteriën en archaea één groep. Dit bleek
niet juist te zijn en is bekend rond 1970.
o Dit werd ontdekt door het kijken naar genetische informatie waarbij ze genetische
toch verschillen van de bacteriën.
▪ Het is niet zichtbaar aan het celtype.
• Eukaryoten; dit zijn meer ingewikkeldere cellen met meerdere celtypen.
o Ze bestaan uit meerdere celtypes en kunnen meer dan een bacterie, meercellig.
o Planten, dieren, schimmels en protisten.
Micro-organismen zijn eenvoudige cellen en dus eencelligen. Dus de prokaryoten zijn micro-
organismen.
• Dus bacteriën en archaea.
Een deel van de eukaryoten zijn ook micro-organismen.
• Zoals de schimmels en protisten.
Micro-organismen zijn alle bacteriën en arachea en een deel van de eukaryoten. Het grootste deel
van het leven op aarde zijn micro-organismen.
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper Hennique. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €6,49. Je zit daarna nergens aan vast.
Is Stuvia te vertrouwen?
4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)
Afgelopen 30 dagen zijn er 83225 samenvattingen verkocht
Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen