100% tevredenheidsgarantie Direct beschikbaar na je betaling Lees online óf als PDF Geen vaste maandelijkse kosten
logo-home
Eerder door jou gezocht
Eerder door jou gezocht
logo
Aantekeningen hoorcollege 2: Protein structures & sequence profiles . Introduction to Bioinformatics €4,48
In winkelwagen
Snel navigeren naar
Voorbeeld
  2.  
  3. Vrije Universiteit Amsterdam (VU)
  4.  
  5. Introduction to Bioinformatics

College aantekeningen

Aantekeningen hoorcollege 2: Protein structures & sequence profiles . Introduction to Bioinformatics
 0 keer verkocht

De aantekeningen van hoorcollege 2 over Protein structures & sequence profiles van het vak introduction to bioinformatics. Het document bevat duidelijke afbeeldingen. Verder is het overzichtelijk en duidelijk gemarkeerd.

Voorbeeld 1 van de 4  pagina's

Document informatie

  • 14 februari 2024
  • 4
  • 2023/2024
  • College aantekeningen
  • Evert bosdriesz
  • Hoorcollege 2

Onderwerpen

Geschreven voor

Alle documenten voor dit vak (6)

Verkoper

avatar-seller
dboone264

Ontvangen beoordelingen

Voorbeeld van de inhoud

Introduction to bioinformatics
Hoorcollege 2 – 10 januari 2024
Protein structures & sequence profiles
Typical BLAST output
High scores are red, low score are black. Colors for alignment score
Proteins to below
Length of the sequence (4000). It’s a query sequence
Matching sequences are drawn below
From top to bottom there are sorted. Best alignment on top  Sorted by decreasing
alignment
Protein homologs are evolutionary related. Proteins look similar, because they started at the
same point


Possible output in more detail
Zoomed in
It’s a protein sequence, because there are more than 4 letters (all started by M)
Columns that are similar are highlighted, in a way they match the most
We want to recognize the conserved area’s / similar parts (*)
Protein family that is found in different species
Some are highly variable / some conserved, other don’t
Proteins that are conserved, is for a reason, called function
Common ancestor  all sequence? What happens in between?
- Mutation happens randomly
- Over a long time, in both parts same amount of mutations
- Natural selection  they died through an mutation
- Any mutation must be legal?
Running BLAST gives information about evolutionary


Summarize alignment, because there are big
Profiles are used  PSSM (position specific scoring matrix) is a type of profile
Sequence are down (amino acids)
To the right are the scores (sequence position)
…

Dit zijn jouw voordelen als je samenvattingen koopt bij Stuvia:

Bewezen kwaliteit door reviews

Bewezen kwaliteit door reviews

Studenten hebben al meer dan 850.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet jij zeker dat je de beste keuze maakt!

In een paar klikken geregeld

In een paar klikken geregeld

Geen gedoe — betaal gewoon eenmalig met iDeal, creditcard of je Stuvia-tegoed en je bent klaar. Geen abonnement nodig.

Direct to-the-point

Direct to-the-point

Studenten maken samenvattingen voor studenten. Dat betekent: actuele inhoud waar jij écht wat aan hebt. Geen overbodige details!

Veelgestelde vragen

Wat krijg ik als ik dit document koop?

Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.

Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?

Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.

Van wie koop ik deze samenvatting?

Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper dboone264. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.

Zit ik meteen vast aan een abonnement?

Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €4,48. Je zit daarna nergens aan vast.

Is Stuvia te vertrouwen?

4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)

Afgelopen 30 dagen zijn er 64257 samenvattingen verkocht

Opgericht in 2010, al 15 jaar dé plek om samenvattingen te kopen

Begin nu gratis

Laatst bekeken door jou

Tentamen (uitwerkingen) ·

(0)

A-Level June 2022 Chemistry Paper 3 General and Practical Principles in Chemistry

Tentamen (uitwerkingen) ·

(0)

BIO 353 cell bio exam Questions and Answers 100% Pass
€4,48
  • (0)
In winkelwagen
Toegevoegd