Prac%cum 1 – Uitgebreide handleiding
Practicum 1: R Studio…………………..…………………………………………………………………………………… 2
R Studio ............................................................................................................................................. 2
R file openen .................................................................................................................................................................... 3
PMBIS_LAB0_2024.R ......................................................................................................................... 3
#text ................................................................................................................................................................................. 3
Uitvoeren van opdrachten in R Studio ............................................................................................................................. 4
R files opslaan .................................................................................................................................................................. 4
Values in R Studio .............................................................................................................................. 4
Waarden opslaan in R Studio ........................................................................................................................................... 4
R Studio waarden laten ‘onthouden’ ............................................................................................................................... 5
Variabelen ........................................................................................................................................................................ 5
Variabelen overschrijven.................................................................................................................................................. 6
Rekenen met variabelen .................................................................................................................................................. 6
Vector variabele................................................................................................................................. 7
Variabele met meerdere waardes, een vector ................................................................................................................. 7
Character vector en Numeric vector ................................................................................................................................ 7
Rekenen met vectoren ..................................................................................................................................................... 7
Vector classificeren .......................................................................................................................................................... 7
Datasets ............................................................................................................................................ 8
Dataset aanmaken ........................................................................................................................................................... 8
Data selecteren uit kolom van de tabel ........................................................................................................................... 9
Meerdere data selecteren uit kolommen van de tabel .................................................................................................... 9
Data selecteren uit rij van de tabel ................................................................................................................................ 10
Voorwaarde aan data selecteren meegeven.................................................................................................................. 10
SubsePng, adding and modifying data ......................................................................................................................... 11
FuncTes toepassen op dataset ...................................................................................................................................... 12
R Studio Help ................................................................................................................................................................. 13
Packages in R Studio ........................................................................................................................ 14
Packages installeren in R Studio ..................................................................................................................................... 14
Package laden ................................................................................................................................................................ 14
Package ‘car’ in R Studio ................................................................................................................................................ 15
Datasets importeren ........................................................................................................................ 15
Dataset importeren ........................................................................................................................................................ 16
Geimporteerde dataset bekijken ................................................................................................................................... 16
Data uit je geimporteerde dataset selecteren ............................................................................................................... 17
PMBIS_LAB1_2024.R .................................................................................................................... 18
Nieuw R Studio bestand ................................................................................................................... 18
R file openen .................................................................................................................................................................. 18
3 nieuwe pakkeYen instaleren ....................................................................................................................................... 18
Dataset importeren en bekijken .................................................................................................................................... 18
Data uit je geimporteerde dataset selecteren ............................................................................................................... 20
StaJsJsche analyse van dataset ....................................................................................................... 20
StaTsTsche beschrijving ................................................................................................................................................. 20
Grafieken in R .................................................................................................................................. 22
ggplot ............................................................................................................................................................................. 22
Histogram....................................................................................................................................................................... 23
Grafiek verder invullen, labs ( ) ...................................................................................................................................... 24
1
,Prac&cum 1: R Studio
R Studio
• Wanneer je R studio voor het eerst opent ziet de interface er ongeveer zo uit:
• Het kan zijn dat sommige vlakken niet uitgevouwen zijn, druk hiervoor op:
• Linksboven: Codeervlak
o In dit vlak vind je je .R bestand waar je in gaat werken en coderen.
o In het geval van voor het eerst R Studio openen heet je document waarschijnlijk
‘UnGteld1’.
• Linksonder: Console
o Hier vind je de ‘Console’, ‘Terminal’ en ‘Background Jobs’.
o Hiervan ben jij vooral bezig in ‘Console’.
§ Dit is de plek waar wat jij codeert linksboven in je bestand, uitgewerkt wordt.
§ Als je bv en som typt linksboven, krijg je links onder in ‘Console’ het antwoord
op die som te zien.
• Rechtsboven
o Hier vind je je ‘Environment’, ‘History’, ‘ConnecGons’ en ‘Tutorial’.
o Hiervan ben jij vooral bezig in ‘Environment’
2
, § Dit is de plek waar je jouw gedefinieerde waardes (je variabelen of je
datasets) kunt terugvinden
§ Als je bv. x = 2 meegeeV aan R studio, kun je dat in ‘Environment’
terugvinden, hierover later meer.
• Rechtsonder
o Hier vind je ‘Files’, ‘Plots’, ‘Packages’, ‘Help’, ‘Viewer’, en ‘PresentaGon’.
o Hiervan ben jij vooral bezig in ‘Plots’ en ‘Packages’
§ ‘Plots’ is de plek waar je grafieken te zien krijgt wanneer je die gecodeerd
hebt
§ ‘Packages’ in de plek waar je speciale pakkeZen kan downloaden die extra
funcGes bevaZen voor in R, hierover later meer.
R file openen
• In R Studio kan je ook R bestanden (R scripts) openen (herkenbaar als .R)
• Download hiervoor een bestaand R bestand, of zoek er een op je computer.
• Ga om dit bestand te openen ga je naar File > Open File…> Selecteer hier het R document.
• Je zult zien dat dit document in een nieuw ‘tabblad’ linksboven in je scherm opent.
PMBIS_LAB0_2024.R
#text
• Boven in het document zie je een boel groene tekst met hashtags
• Deze tekst voor onszelf bedoeld en wordt niet gelezen als code
• Dit is dus een manier om aantekeningen bij je code te zeZen, zonder dat R Studio het leest als
iets om uit te voeren.
• Zo kan je bijvoorbeeld je code opdelen in hoofdstukken om een beetje structuur aan je
document te geven
3
,Uitvoeren van opdrachten in R Studio
• Simpel gezegd is R Studio en hele heeeele uitgebreide rekenmachine, die je opdrachten kan
meegeven om uit te laten voeren zodat je zelf geen reken- en tekenwerk hoeV te doen en niet
door mega datasets hoeV te scrollen.
• Om R studio een opdracht te laten uitvoeren doe je hetvolgende:
o Selecteer de tekst/de opdracht
o En ‘run’ de tekst, dit kan op 2 manieren:
§ Druk linksboven op:
§ Of sneltoets op de Mac: Command + Enter
• Hierdoor verschijnt het antwoord in de console beneden
• VOORBEELD: R Studio 3 plus 3 laten uitvoeren:
Codeervlak:
Console uitkomst:
• VOORBEELD: R Studio 6 gedeeld door 2 keer 3 laten uitvoeren:
Codeervlak:
Console uitkomst:
R files opslaan
• Als je gaat coderen en codes gaat uitvoeren, oVwel in het bestand werken, moet je wel je
aanpassingen opslaan.
• Je ziet rechtsboven in dat de Gtel van je bestand rood is als je aanpassingen hebt gemaakt die
je nog niet hebt opgeslagen.
• Als je op save drukt (zelfde als bij een Word document) dan wordt de Gtel weer zwart en is je
bestand goed opgeslagen.
• Vergeet dit dus tussendoor het werken niet te doen!!
Values in R Studio
Waarden opslaan in R Studio
• Je hebt nu gewerkt met cijfers in R Studio, maar je kan ook werken met variabelen (objecten)
en die een bepaalde waarde geven.
4
, • VOORBEELD: Je wil werken met variabele x die gelijk is aan 2. Dus x = 2. Hierdoor kan je
berekeningen maken met die variabelen, met die x. Dus bijvoorbeeld x + 2 = 4, of x * 10 = 20.
o Je kan R Studio dus als het ware laten ‘onthouden’ wat de waarde van x is, zodat je
niet steeds het getal 2 hoeV te typen.
R Studio waarden laten ‘onthouden’
• Om R Studio waarde te laten onthouden moet je een object aanmaken.
• Object aanmaken zorgt ervoor dat je waardes opslaat binnen R Studio.
• Dit ‘opslaan’ kan doormiddel van een = of <-
o = en <- doen precies hetzelfde, het is meer de voorkeur van de codeur welke van de 2
je gebruikt.
• VOORBEELD: Je wil werken met variabele x die gelijk is aan 2. Dus x = 2. Om dit te coderen in R
Studio:
Codeervlak:
OF
• Vervolgens run je deze code weer
Console:
o De console rekent nu niks uit, maar bevesGgt eigenlijk dat je x nu de waarde 2 hebt
gegeven
• Hierna zie je de waarde (de variabele) die je aan x hebt toegekend ook in je ‘Environment’
rechtsboven terug:
Environment:
o In je environment komen dus alle variabelen te staan die jij hebt gedefinieerd en dus
opgeslagen in R Studio
§ LET OP! Met opslaan bedoelen we niet dat je document is opslagen! Hiervoor
moet je nog wel op save drukken, het betekent alleen dat het programma
‘onthoudt’ dat jij iets een waarde hebt gegeven voor de volgende keer dat je
die waarde weer gebruikt.
Variabelen
• Je kunt variabelen ook andere namen geven dan alleen de leZer x en je kunt variabelen ook
andere waarden geven dan alleen het cijfer 2
• Zo kan je je eigen Gtels bedenken voor je variabelen en zelfs tekstuele waardes meegeven.
• VOORBEELD: Variabele y met de waarde “some tekst” en variabele getal met de waarde “10”
Codeervlak:
Console:
5
, Environment:
Variabelen overschrijven
• Als je oude variabelen hergebruikt dan overschrijV R Studio deze.
o Dus stel je hebt de variabele x = 2 genoemd, maar later in je code zeg je x = 3 (en je
runt deze ook), dan zal R Studio je laatste gegeven waarde onthouden, en gaat R
Studio er dus vanuit dat x nu 3 waard is.
o Let dus op dat je elke keer andere namen gebruikt voor nieuwe variabelen!
• Je kan dit veranderen van variabelen ook in je voordeel gebruiken
o Je kan namelijk variabelen hierdoor ook corrigeren, door je oude variabele te
vervangen
§ Stel je x = 2, maar veel later in je code kom je erachter dat x eigenlijk alGjd 2
waardes hoger moet zijn, dan kan je +2 optellen bij je oude x, en zal R Studio
dus aannemen dat x = 4
Codeervlak:
Rekenen met variabelen
• Nu je x een waarde hebt gegeven, kan je er ook meer rekenen.
• VOORBEELD: stel je wil x (= 2) keer 5 doen:
Codeervlak:
Console:
• Let op dat je geen berekeningen kan maken met getallen en tekst
o Je kan bijvoorbeeld bij de tekst “some tekst” niet het getal +2 optellen
o Als je in R Studio zet y +2 geeV dat dus een foutmelding in de console
o R Studio geeV zelf aan ‘non-numeric argument’ oVwel; geen getal als argument
gegeven, namelijk “some tekst” dat kan hij dus niet bij het getal 2 optellen
6
