Scriptie
Eiwitkloneringsonderzoek MSH2 MBO
- Vak
- B05MBO (B05MBO)
- Instelling
- Hogeschool Leiden (HSL)
Een volledig uitgewerkt verslag met de benodigde sequenties, achtergrond informatie, kloneringsstrategie en referenties
[Meer zien]Voorbeeld 2 van de 15 pagina's
Voorbeeld 2 van de 15 pagina's
In winkelwagengesponsord bericht van onze partner
Verkoper
Volgen
Voorbeeld van de inhoud
MSH2 (DNA Mismatch RepairProtein)
Datum: 03-11-20
Naam: Elise Sugrim
Studentnummer: 1120009
Klas: LM2G
Docent: Kitty Verzijlbergen
, MBO peptide letter: E
MBO plasmide nr: 14
I Achtergrond informatie
Achtergrond
I.1 Peptiden alignen & eiwitsequentie
De verkregen aminozuursequentie is KQIKLDSSAQFGYYFRVTCKEEKVLRNNKNFSTVDIQKN (bijlage 1). Er
is een Protein Blast1 gedaan en bevindt zich in de coderende aminozuursequentie van DNA mismatch
repair protein Msh2 isoform 12. Het accessienummer is NP_000242.12 en het accessienummer van
het mRNA is NM_000251.33.
Er bestaat ook een DNA mismatch repair protein Msh2 isoform 2, maar dit eiwit is niet relevant bij dit
onderzoek.
"MAVQPKETLQLESAAEVGFVRFFQGMPEKPTTTVRLFDRGDFYT
AHGEDALLAAREVFKTQGVIKYMGPAGAKNLQSVVLSKMNFESFVKDLLLVRQYRVEV
YKNRAGNKASKENDWYLAYKASPGNLSQFEDILFGNNDMSASIGVVGVKMSAVDGQRQ
VGVGYVDSIQRKLGLCEFPDNDQFSNLEALLIQIGPKECVLPGGETAGDMGKLRQIIQ
RGGILITERKKADFSTKDIYQDLNRLLKGKKGEQMNSAVLPEMENQVAVSSLSAVIKF
LELLSDDSNFGQFELTTFDFSQYMKLDIAAVRALNLFQGSVEDTTGSQSLAALLNKCK
TPQGQRLVNQWIKQPLMDKNRIEERLNLVEAFVEDAELRQTLQEDLLRRFPDLNRLAK
KFQRQAANLQDCYRLYQGINQLPNVIQALEKHEGKHQKLLLAVFVTPLTDLRSDFSKF
QEMIETTLDMDQVENHEFLVKPSFDPNLSELREIMNDLEKKMQSTLISAARDLGLDPG
KQIKLDSSAQFGYYFRVTCKEEKVLRNNKNFSTVDIQKNGVKFTNSKLTSLNEEYTKN
KTEYEEAQDAIVKEIVNISSGYVEPMQTLNDVLAQLDAVVSFAHVSNGAPVPYVRPAI
LEKGQGRIILKASRHACVEVQDEIAFIPNDVYFEKDKQMFHIITGPNMGGKSTYIRQT
GVIVLMAQIGCFVPCESAEVSIVDCILARVGAGDSQLKGVSTFMAEMLETASILRSAT
KDSLIIIDELGRGTSTYDGFGLAWAISEYIATKIGAFCMFATHFHELTALANQIPTVN
NLHVTALTTEETLTMLYQVKKGVCDQSFGIHVAELANFPKHVIECAKQKALELEEFQY
IGESQGYDIMEPAAKKCYLEREQGEKIIQEFLSKVKQMPFTEMSEENITIKLKQLKAE
VIAKNNSFVNEIISRIKVTT"
I.2 Correcte gennaam + cDNA sequentie + ensembl of NCBI transcript ID
of accession nummer
Het gennaam is MSH22. Ook bekend als COCA1; FCC1; hMSH2; HNPCC; HNPCC1 en LCFS2. Het DNA
mismatch repair protein Msh2 isoform 1 ook bekend als Homo sapiens mutS homolog 2 (MSH2),
transcript variant 1. Dit is het cDNA en het CDS is bruin gemarkeerd (bijlage 2). Het accessienummer
is NM_000251.33.
1 gcattttctt caaccaggag gtgaggaggt ttcgacatgg cggtgcagcc gaaggagacg
61 ctgcagttgg agagcgcggc cgaggtcggc ttcgtgcgct tctttcaggg catgccggag
121 aagccgacca ccacagtgcg ccttttcgac cggggcgact tctatacggc gcacggcgag
181 gacgcgctgc tggccgcccg ggaggtgttc aagacccagg gggtgatcaa gtacatgggg
241 ccggcaggag caaagaatct gcagagtgtt gtgcttagta aaatgaattt tgaatctttt
301 gtaaaagatc ttcttctggt tcgtcagtat agagttgaag tttataagaa tagagctgga
361 aataaggcat ccaaggagaa tgattggtat ttggcatata aggcttctcc tggcaatctc
421 tctcagtttg aagacattct ctttggtaac aatgatatgt cagcttccat tggtgttgtg
481 ggtgttaaaa tgtccgcagt tgatggccag agacaggttg gagttgggta tgtggattcc
541 atacagagga aactaggact gtgtgaattc cctgataatg atcagttctc caatcttgag
601 gctctcctca tccagattgg accaaaggaa tgtgttttac ccggaggaga gactgctgga
661 gacatgggga aactgagaca gataattcaa agaggaggaa ttctgatcac agaaagaaaa
721 aaagctgact tttccacaaa agacatttat caggacctca accggttgtt gaaaggcaaa
781 aagggagagc agatgaatag tgctgtattg ccagaaatgg agaatcaggt tgcagtttca
841 tcactgtctg cggtaatcaa gtttttagaa ctcttatcag atgattccaa ctttggacag
901 tttgaactga ctacttttga cttcagccag tatatgaaat tggatattgc agcagtcaga
961 gcccttaacc tttttcaggg ttctgttgaa gataccactg gctctcagtc tctggctgcc
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper elisereadsbigbookselise. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €5,49. Je zit daarna nergens aan vast.
Is Stuvia te vertrouwen?
4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)
Afgelopen 30 dagen zijn er 66579 samenvattingen verkocht
Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen