Tutor task 2: Polymerase Chain Reaction and SNP
analyse
Assignment 1: PCR and multiplex PCR
Multiplex PCR:
Multiplex polymerase chain reaction (Multiplex PCR) refers to the use of polymerase chain reaction
to amplify several different DNA sequences simultaneously (as if performing many separate PCR
reactions all together in one reaction). This process amplifies DNA in samples using multiple primers
and a temperature-mediated DNA polymerase in a thermal cycler. The primer design for all primers
pairs has to be optimized so that all primer pairs can work at the same annealing temperature during
PCR. This technique requires two or more probes that can be distinguished from each other and
detected simultaneously. There is a range of different probe technologies available, all using
fluorophores.
Types of multiplex PCR:
1. Single template PCR reaction:
- This technique uses a single template which can be a genomic DNA.
- Along with several pairs of forward and reverse primes to amplify specific regions within a
template; in the same reaction tube.
2. Multiple template PCR reaction:
- This technique uses multiple templates.
- Several primers sets of forward and reverse primers for each template and regions within
the template; in the same reaction tube.
Probes:
Probes are primers with an addition on one group that allows us to see the primer. This change can
be a molecule that fluoresces and shines when hit with light, or it can be an attachment to a colored
bead, for example. This then allows us to visualize when a probe (primer with a colored bead
attached to it) attaches to DNA. Since we designed the probe, we can tell what the DNA sequence is
at that particular point in the DNA.
Questions:
How has the PCR protocol been adapted in comparison with the standard PCR protocol?
In multiplex PCR multiple primers are released on one or more pieces of DNA. As a result,
multiple pieces of DNA are amplified in 1 sample. If the sample is on gel, multiple straps will
arise.
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper SharonAerdts. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €3,49. Je zit daarna nergens aan vast.