Samenvatting - Biochemie - Van Lint - Tandheelkunde/BMW
18 keer bekeken 0 keer verkocht
Vak
Biochemie en moleculaire biologie (E08X3A)
Instelling
Katholieke Universiteit Leuven (KU Leuven)
Geen zin om een samenvatting te maken en geen zin om tijd te steken in het boek van biochemie? Dan is deze samenvatting perfect voor jou!
Dit is een samenvatting van het boek van Biochemie geschreven door prof. Van Lint. Ook staan er extra dingen bij die in de ppt's tijdens de les zijn gezegd e...
H1 BIOMOLECULEN
20 AMINOZUREN
1. Non-polair, alifatisch
- Glycine (Gly)
o Niet-asymmetrisch
o Geen zijketen (H)
o Conformationele flexibiliteit
- Alanine (Ala), Valine (Val), Leucine (Leu), Isoleucine (Ile), Mathionine (Met)
o Inert, alifatisch
o Non-polair, hydrofoob
o Geen functionele groepen
o Clusteren zijketens -> structuur stabiliseren (hydrofobe interacties)
o Verschillende vormen -> structuur door ruimte
2. Aromatisch
- Fenylaline (Phe)
o Benzeenring
o Hydrofoob, weinig reactief
o Apolair
- Tyrosine (Tyr)
o Intermediair polair
o Waterstofbruggen
o OH-groep = belangrijk functionele groep + belangrijk voor fosforylatie (door
tyrosinekinasen -> signaaltransductie)
- Tryptofaan (Trp)
o Intermediair polair (N in indolring)
o Grootste zijketen
o Zeldzaam
--> absorberen uv-licht (280nm) -> concentratie bepalen, zuiveringsproces
3. Polair, ongeladen
- Cysteïne (Cys)
o Sulfylhydryl R-groep (SH) -> polair (pKa 8,2)
o Ioniseert op licht
o Oxidatie -> disulfide (cystine)
o Disulfidebruggen -> 3D-structuur eiwit -> stabiliserend
o Katalytisch centrum van enzyme
o Ionisatie SH -> S- + H+ -> sterk nucleofiele zwavelgroep
- Serine (Ser), Threonine (Thr)
o OH-groep -> polair
o Waterstofbruggen (H-donor of H-acceptor)
o Fosforylatie -> signaaltransductie
- Asparagine (Asn), Glutamine (Gln)
o Amiden van asparaginezuur en glutaminezuur
o Relatief polair
, o Waterstofbruggen (H-donor of H-acceptor)
- Proline (Pro)
o Cyclisch, ongeladen
o Rigide conformatie (vanwege ring)
o Geen waterstofbruggen
o Speciale structuur (knik) -> cisconfiguratie
4. Positief geladen
- Arginine (Arg)
o Guanidinogroep (positief geladen)
o pKa = 10 -> sterk positief geladen
- Lysine (Lys)
o Primair amine
o pKa = 10 -> sterk positief geladen
- Histidine (His)
o Imidazol
o pKa = 7
o Elektrofiele N = H-donor
Nucleofiele N = H-acceptor
o Nucleofiele katalysator -> katalytisch centrum
o Niet-geladen vorm = protonacceptor
Geladen vorm = protondonor
o Veelzijdige eigenschappen
5. Negatief geladen
- Aspraginezuur (Asp), Glutaminezuur (Glu)
o Carboxylgroepen
o pKa (Asp) = 3, pKa (Glu) = 4
o volledig geïoniseerd bij pH 7-> zeer polair
o sterk negatief -> kationen en metalen cheleren (complexvorming)
SUIKERS
Mono- en disachariden
o D-glucose
o D-galactose: hydrolyse van lactose
o D-fructose
o D-ribose: nucleïnezuren
o Maltose: 2 glucoses
o Lactose: glucose + galactose
o Sucrose: fructose + glucose
- Suikerzuren: ‘-uronzuur’, ‘-onzuur’
o Glucuronzuur
o Gluconzuur
o gluconolaction
- Suikeralcohols: reductie van carbonylgroepen
o Sorbitol
o Glycerol
, o Ribitol
- Deoxysuikers : 1 zuurstof minder
- Suikerresten
- Aminosuikers: aminogroep
o Muraminezuur
o Neuraminezuur
Polysachariden: homo- of hetero-
o Zetmeel: aardappel
o Glycogeen: lever
§ Korte takken -> monomeren glucose uit te halen
o Cellulose: celwand plant
§ Lineair, onvertakt
§ Onverteerbaar
§ Waterstofbrugvorming -> grote sterkte
§ Stabiel
o Chitine: exoskeletten
§ Onverteerbaar
- Peptidoglycans: in bacteriële celwand
§ Peptide-crosslinks -> sterke wand
§ <-> lysozome en penicilline
- Glucosaminoglycans (GAG’s)
§ Herhaalde disachariden
§ N-acetylglucosamine of N-acetylgalactosamine met -uronzuur
§ Soms sulfaat -> negatief -> afstoting -> lineaire structuur (minimaliseren
van afstotingen)
§ Extracellulaire matrix -> ‘jungle’
§ Gesulfateerd en niet-gesulfateerd -> specifieke herkenning
proteïneliganden -> elektrostatisch binden
§ Covalent binden met proteïnen -> proteoglycans
o Hyaluronzuur
§ Glasachtig, translucent
§ Viskeus
§ Glijmiddel
§ Spankracht in extracellulaire matrix
§ Hyaluronidase (enzyme): splitsen -> verder doordringen bacteriën in
weefsels (zie ook zaadcellen tot eicel)
o Chondroïtinesulfaat
§ ‘gewricht’
§ Spansterkte
o Dermatansulfaat
§ ‘huid’
§ Plooibaarheid
o Keratansulfaten
§ ‘hoorn’
§ Geen -uronzuur
§ In hoornachtige structuren gevormd door dode cellen
o Heparine
, § ‘lever’
§ Anticoagulans -> sterk elektrostatisch
Glycoconjugaten: suikerpolymeren en eiwitten of lipiden
- Proteoglycans
o Macromoleculen in plasmamembraan of cellulaire matrix
o GAG-moleculen vastgehecht aan ‘core-proteïne’ (trisacharidebrug)
o Voorzien van mutipele bindingsplaatsen -> elektrostatische binding of
waterstofbruggen
o Bindweefsel (bv. kraakbeen) -> covalente interacties
o Aggrecans (complexen van meerdere core-proteïne) -> collageen binden ->
spankracht
o Integrale membraaneiwitten (bv syndecan) -> connectie tussen extracellulair
en intracellulair -> genexpressie beïnvloeden
o Onvertakte suikers
- Glycoproteïnen
o Kleiner, diverser dan GAG’s en proteoglycans
o Alle mogelijke functionele klassen van eiwitten
o O-linked of L-linked
o Vertakte suikers
o Complexer
o Hexosen, acetyl hexosamines, pentosen, methylpentosen, siaalzuren
o Functies
§ Modulatie: oplosbaarheid, viscositeit,...
§ Bescherming tegen proteolyse
§ Beïnvloeden proteolytische processing
§ Biologische activiteit
§ “reisaspecten” -> insertie, migratie,...
§ Embryonale ontwikkeling en secretie
§ Invloed metastasering van tumorcellen (uitzaaiing)
- Glycolipiden
o Gangliosiden
§ Membraanlipiden
§ Complexvorming
§ Bv. bloedgroepantigenen
o Lipopolysachariden (LPS)
§ Buitenste membraan gramnegatieve bacteriën (bv. E. coli)
§ Primaire doelwitten van antistoken
§ Serotypes (specifieke antistoken) bepaald door samensteling LPS
§ Toxisch -> infectie -> bloeddrukdaling -> ‘toxic shock syndrome’
- Lectines
§ Cel-herkenning + adhesie
§ Lectine (selectine) herkennen T-lymfocyt -> vertragen
§ Herkenning glycolipiden of glycoproteïnen
§ Virale lectine
§ Toxine als lectine
§ Als bacteriële vasthechting
VETTEN
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper paulien15694. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €11,16. Je zit daarna nergens aan vast.
