Samenvatting
GEN30306 Genomics Samenvatting
- Instelling
- Wageningen University (WUR)
Uitgebreide samenvatting van zowel de collegestof als de practicals van het vak GEN-30306 Genomics.
[Meer zien]Voorbeeld 1 van de 13 pagina's
Voorbeeld 1 van de 13 pagina's
In winkelwagengesponsord bericht van onze partner
Voorbeeld van de inhoud
GENOMICSLECTURE 2: GENETIC AND PHYSICAL MAPS
COLLEGESTOF
Gene mapping bepalen van de positie van een gen
en de afstanden tussen genen
Verschillende typen van genomic maps
Cytogenetic map representatie van positie
van genen op een chromosoom
Genetic linkage map volgorde van
genetische markers en genetic distance tussen
de markers
Physical map door genoom in stukjes te
knippen wordt de fysieke afstand tussen
markers bepaald
Genetic linkage mapping
Gebruik van polymorphic markers
o tonen variatie voor een bepaalde positie (polymorfisme, verschillende allelen)
o Microsatellites en SNPs
Pedigree noodzakelijk
o bepalen overerving van allelen informative meioses bepalen
Informative meioses bepalen welke van de 2 allelen van de ouders worden doorgegeven aan de
nakomelingen
Linkage mapping gebaseerd op recombinatie tijdens meiose
genen dicht bij elkaar gelegen, dan weinig mogelijkheid tot recombinatie weinig recombinanten
waargenomen
markers zeer ver uit elkaar of op verschillend chromosoom recombination frequency= 0.5
Recombination frequency aantal recombinants / (niet recombinants + recombinants) R/(N+R)
LOD score
bepalen of de gevonden recombinatie frequency significant verschilt van een random verdeling van de
allelen
o hoeveel x meer waarschijnlijk is het dat de geobserveerde frequentie wordt waargenomen ipv
frequentie voor random
verdeling van de allelen?
LOD score 10loglog
(Pobserved/Pnull)
Zie voorbeeldberekening
Aanvullingen:
Niet vergeten van biominale coefficient
totaal nakomelingen linksboven, aantal recombinanten rechts onder)
LOD >3.0log de gevonden data ondersteunt de aanwezigheid van linkage
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper eknaw. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €5,49. Je zit daarna nergens aan vast.
Is Stuvia te vertrouwen?
4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)
Afgelopen 30 dagen zijn er 52510 samenvattingen verkocht
Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen