Samenvatting
Summary Lecture 7 - Posttranscriptional gene control and nuclear transport #3
Lecture 7 - Posttranscriptional gene control and nuclear transport #3
[Meer zien]Voorbeeld 2 van de 8 pagina's
Voorbeeld 2 van de 8 pagina's
In winkelwagengesponsord bericht van onze partner
Voorbeeld van de inhoud
Biochemistry and Molecular Biology II – Lecture 7: Posttranscriptional genecontrol and nuclear transport #3 – Lecture by Ger Pruijn
14-05-2018
Post transcriptional regulation in the cytoplasm:
The efficiency of mRNA translation/survival is regulated by micro and siRNAs.
Regulation can be very cell-specific or mRNA specific.
MicroRNAs (miRNAs) and RNA-interference:
mRNA precursors/double-stranded RNA can be converted into ds miRNA/siRNA by
dicer the ds mi/siRNA associates with RISC-complex (RNA-induced silencing
complex). When associated with RISC, the si/miRNA is active two different routes
are followed:
1. Perfect/complete base pairing: target cleavage (siRNAs)
2. Incomplete base pairing: translation repression (miRNAs)
- siRNAs are usually not encoded in the genome, but introduced by
viruses/researchers, in order to regulate gene expression.
- miRNAs are encoded in the genome.
Nucleotides 2 to 7 of a miRNA are the most critical for targeting it to a specific
mRNA.
Exportin 5 is specialized in transporting pre-mRNA from the nucleus into the
cytoplasm.
, Drosha (in the nucleus) generates one end of the
miRNA, by cleavage
Dicer (in the cytoplasm) is an RNase II
endonuclease that generates the other end of the
miRNA.
TRBP (in the cytoplasm) is a double strand RNA
binding protein (dsRBP) that is required for the
recruitment of Ago2 (Argonaute protein) to the
small interfering RNA (siRNA) bound by Dicer.
TRBP increases HIV-1 expression and replication
by inhibiting the interferon-induced protein kinase
PKR and by increasing translation of viral mRNA.
Dicer, Ago2, and TRBP are the main components
of the RNA-induced silencing complex (RISC)
(source: https://www.phosphosite.org/proteinAction?id=15651&showAllSites=true)
Argonaute protein: one strand is released, other
strand remains bound to the RISC-complex.
Argonaute proteins activate and cleave the mRNA
RNAi
Ago2 is an RNase and is the catalytic center of
RISC catalyzing mRNA
Binding of RISC to a perfectly complementary mRNA
generally results in silencing due to endonucleolytic cleavage of the mRNA specifically by
AGO2. Binding of RISC to a partially complementary mRNA results in silencing through
inhibition of translation, and this is independent of endonuclease activity. (Source:
https://www.uniprot.org/uniprot/Q9UKV8)
The RISC-complex consists out of the loaded ds
mi/siRNA + dicer + TRBP + Ago2 (Argonaut
protein).
*siRNAs are complementary to their target mRNA.
Often, a combination of miRNAs leads to efficient
regulation of RNAi.
- miRNA-regulation is very cell-specific;
miRNAs are not expressed in any cell.
RNA-interference takes place due to interference by siRNAs and miRNAs.
Amplification of RNAi-effects in plants and worms:
A small amount of trigger dsRNA is processed into siRNA;
RdRP (RNA-dependent RNA polymerase) reaction converts target mRNAs into new
dsRNAs.
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper rishology. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €3,99. Je zit daarna nergens aan vast.
Is Stuvia te vertrouwen?
4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)
Afgelopen 30 dagen zijn er 67474 samenvattingen verkocht
Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen