Samenvatting
Samenvatting Cellen en Weefsels deeltentamen 1
- Instelling
- Universiteit Utrecht (UU)
Samenvatting Cellen en Weefsels deeltentamen 1
[Meer zien]Voorbeeld 4 van de 46 pagina's
Voorbeeld 4 van de 46 pagina's
In winkelwagengesponsord bericht van onze partner
Voorbeeld van de inhoud
Cellen en Weefsels Deeltentamen 1H5 DNA Replication, Repair & Recombination
H5-1 Replication
Mutatie rate: 1 nucleotide substitutie per 10^10 cel generatie
E coli: 10^6 nucleotide paren
Mens: 10^9 nucleotide paren
DNA polymerase
- ‘5 —> ‘3 chain growth
- Twee katalytische site:
- Polymeriseren (P-site)
- Editen (E-site)
- Exonucleotide proofreading
- Exonucleose knipt foute DNA eruit
- Door de twee sites kan DNA polymerase niet:
- Replicatie initiëren
- Primase nodig (RNA polymerase)
- Repliceren ‘5 —> ‘3
- Als er nucleotide wordt uitgehaald en polymerase gaat
van ’3 —> ‘5 is er geen energiebron om weer een nucleotide in te zetten
(fosfaatgroep is weg)
- Met sliding clamp
Sliding clamp
- Houdt DNA polymerase op DNA
,Helicase
- Haalt strengen uit elkaar
- Met ATP hydrolyse
Single strand DNA binding protein
- Bindt aan DNA op lagging strand waar later Okazaki fragmenten op komen
- Om hairpin formatie te voorkomen, niet om base pair vorming te voorkomen
Strand directed mismatch repair machine
- Extra check op mismatches
- Repair eiwitten halen alleen nucleotiden uit nieuwe streng niet uit
template streng
- Hoe?:
- Bacterien: Methylatie op oude streng en nick op de nieuwe
streng
- Eukaryoten: Nicks op lagging strand door Okazaki fragmenten
- MutS & MutL
“Winding” probleem oplossen
- DNA topoisomerase I
- Maakt single strand break (fosfodiester binding)
- Koppelt hieraan om energie niet verloren te laten gaan
- Gebruikt geen ATP
- DNA topoisomerase II
- Maakt double strand break
- Gebruikt 2 ATP
Initiatie van DNA replicatie in bacteriën
- 1 Ori: AT-rijke sequentie makkelijk uit elkaar te halen
- Hebben twee waterstofbruggen
1. Initiate eiwitten binden aan Ori
2. DNA helices gebonden aan een helicase-loading-eiwit bindt aan Ori
3. Helicase loading eiwit eraf, activatie van helicasen
4. DNA primase —> RNA primer
5. DNA polymerase
6. Nog twee DNA polymerases op lagging strand —————>>
- Moeten genoeg nutriënten zijn
- Na initiatie: initiatie eiwitten worden afgebroken
, - Refractory periode: geen nieuwe initiatie kan worden gestart
- Door DAM methylatie: specifieke methylatie patroon
Initiate van DNA replicatie in eukaryoten
- Veel Ori’s
- Mag maar 1 keer per celcyclus worden geactiveerd
- G1: ORC bindt —> helicase’s binden maar zijn nog niet actief
- S: helicase’s en ORC worden gefosforyleerd —> helicase actief, ORC inactief
- G1 weer: ORC defosforyleerd, ORC weer actief
Transcriptie stopt niet door stopcodons
Telomeren
- Beschermt DNA eind: moet niet herkent worden als een double strand break
- Dat niet evt chromosomen aan elkaar worden gebonden
- Telomeren worden korter en korter totdat ze niet meer kunnen delen
- Zonder telomeren kunnen cellen niet meer delen
- Om ze te beschermen tegen DNA reparatie:
- Single strand overhang wordt gemaakt
- Overhang wordt gevormd doordat hier RNA primer zat maar die wordt opgegeten
- Telomerase maakt een overhang
- Looped en bindt aan dubbelstrengs DNA
- Shelterin eiwit is een cap die op de loop bindt en het stabiel
houdt
H5-2 Repair & Recombination
DNA wordt constant beschadigd
- Interacties met water
- Depuriniatie
- Deaminatie
- Leidt tot abnormale basen
- Behalve gemethyleerd cytosine —> thymine
- Repareren hiervan leid tot onbetrouwbare reparaties
- Dus worden dit niet gedaan en verdwijnen cytosines steeds
Base excision repair
- DNA glycosylases
, - Flippen basen naar buiten, abnormale basen worden eruit
geknipt
- Endouclease en fosfodiesterase verwijderen suiker fosfaat
deel van streng
- DNA polymerase
- DNA ligase
- Deaminaties & Depurinaties
Nucleotide excision repair
- Bij grote beschadigingen
- Bulky guanine adducts
- Pyrimidine dimeer vorming:
- Bijv door zonlicht
- Nuclease knipt groot stuk weg
- Verwijdering met behulp van (in dit geval) helicase
- DNA polymerase
- Ligase
- Koppeling tussen repair en transcriptie belangrijk
Translesie
- Bij zware beschadigingen
- Sliding clamp geubiquitineerd —> DNA polymerase laat los
- Translesie DNA polymerase bindt
- Minder kieskeurig, minder nauwkeurig
- Educated guess welke base moet worden geplaatst
- Sneller mutatie
Non homologous end joining
- Beschadiging in beide DNA strengen
- Double strand breaks
- Ku Heterodimeren herkenennen einden
- Bijgeknipt en willekeurig aan elkaar geplakt
- Snel
- Litteken in DNA (mutatie)
- Kan twee chromosomen aan elkaar koppelen (translocatie)
Problemen met DNA reparatie mechanismen leidt tot ziekten
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper pipleopold. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €5,96. Je zit daarna nergens aan vast.
Is Stuvia te vertrouwen?
4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)
Afgelopen 30 dagen zijn er 73918 samenvattingen verkocht
Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen