FRNSC 420 - EXAM 2 PRACTICE QUESTIONS AND ANSWERS (100% PASS)
1 keer bekeken 0 aankoop
Vak
FRNSC421W /FRNSC 420
Instelling
FRNSC421W /FRNSC 420
FRNSC 420 - EXAM 2 PRACTICE QUESTIONS AND
ANSWERS (100% PASS)
nucleosome assembly/reassembly after replication - Answer️️ -- old H3-H4
tetramers remain bound to one of two daughter duplexes at random
- old H2A-H2B dimers dissociate and compete to associate with tetramers
- DNA sliding clam...
replication fork - Answer✔️✔️-Y-shaped region that directs synthesis, allows for
synthesis of two strands at once
- continuous replication of the leading strand towards the fork
- discontinuous replication of the lagging strand using Okazaki fragments away
from the fork
driving force of DNA synthesis - Answer✔️✔️-the free energy of nucleotide
addition is low, but when coupled with the hydrolysis of pyrophosphate (PPi), the
reaction is favored
- initiation is an SN2 reaction with 3'-OH acting as nucleophile to attack the α-
phosphate of incoming dNTP
- extension of primer 3' end by one nucleotide and release of PPi
- PPi is hydrolyzed by pyrophosphatase to yield two inorganic phosphate (Pi)
molecules
3-D structure of DNA polymerase - Answer✔️✔️-like a cupped right hand with
palm, fingers, and thumb
- palm: a β-sheet holding active site. binds metal (Mg or Zn) to initiate synthesis
and monitors base pairing through H-bond contacts with minor groove. allows for
proofreading, will release primer at a mismatch
- fingers: α-helices that act in positioning nucleotides, pushing active site
components together. Arg and Lys residues form electrostatic interactions to
ensure proper orientation; Tyr residues base stack for stability. also can bend the
backbone to expose first template base
- thumb: α-helices that maintain correct positioning of primer and active site.
maintains association between polymerase and template. works in concert w/ palm
to move synthesized DNA from active site, contributes to processivity
physical ways DNA polymerase maintains fidelity - Answer✔️✔️-active site has
discriminator site of neutral, nonpolar, and aromatic amino acids that can
differentiate between NTPs and dNTPs
- normally, AAs interact w/ ribose ring and 3'-OH of neighboring base pair attack
phosphate group of incoming nucleotide
- activity is blocked with 2'-OH group in NTPs due to steric hinderance; base will
tilt and not be recognized by neighbor 3'-OH
- dNTP binding pocket is small, most other ribonucleotides wont fit
enzymatic ways DNA polymerase maintains fidelity - Answer✔️✔️-a 3' to 5'
exonuclease in the replisome has proofreading, will degrade unpaired DNA
- geometry of strand is altered from a mismatch, leading to decrease in polymerase
activity
- primer:template junction is destabilized, creating several unpaired bases
- exonuclease has high affinity for ssDNA, will recognize and hydrolyze
unpaired/mismatched bases
3'-5' vs 5'-3' exonucleases - Answer✔️✔️-- 3' to 5' has proofreading and moves
backwards on the strand to removed mismatched bases
- 5' to 3' is not proofreading; repair for damaged DNA and removal of RNA
primers (Taq polymerase)
3
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper OliviaWest. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €11,51. Je zit daarna nergens aan vast.
