Deze samenvatting bevat alle belangrijkste punten van het vak moleculaire biologie (B-B1MB05).
Alle onderdelen zijn ordelijk onder elkaar uitgezet en worden kort maar krachtig toegelicht om efficiënt te leren.
De samenvatting komt voort uit: aantekeningen, werkcolleges, leerdoelen en teksten uit...
H2 – atomen en moleculen
𝒙
𝒚𝒁
• X= atoommassa [p+n → isotopen ander aantal neutronen maar reageren hetzelfde in chemische reactie]
• Y= atoomnummer [aantal p+; bepaald identiteit atoom / aantal e-; vermogen bindingen te vormen]
o Valentie elektronen: e- in buitenste schil= aantal te maken bindingen
▪ zelfde valentie elektronen als in zelfde kolom in periodiek systeem
o Lewis structuur: bindingen en vrije-elektronenparen
➔ Octeregel: molecuul streeft naar edelgasconfiguratie= buitenste e—schil vol (covalente binding=2)
➔ Volle valentie-schil dan inert, reageert niet/nauwelijks
Radioactieve isotopen: onstabiel, radioactief verval naar ander atoom 1n-->1p+ + 1e-
- Halveringstijd= 50% vervallen van ouder --> dochter isotoop F=o.5x
▪ F=o.5x met F=fractie, x=n halfwaardetijden
Elektronenschil= energie level, e- verplaatsen alleen als verloren/verkregen energie gelijk is aan verschil 2 lagen
- e- bevat potentiële energie: hogere schil= E opgenomen / lagere schil= E verloren
1e schil= 2 elektronen max Per orbitaal 2 e-
2e schil= 8 elektronen max --> 1s
3 schil= 8 elektronen max
e
--> 2s, 2px, 2py, 2pz
➔ reactiviteit atoom door ongepaarde elektronen in orbitaal
BINDINGEN
• covalente: gemeenschappelijk elektronenpaar (delen verbonden orbitaal)
- apolair: lading opgeheven door symmetrie ∆EN<0.5
- polair: 𝛿 + en 𝛿 - 0.5<∆EN<1.6
➔ elektronegativiteit hoger als element meer rechtsboven in periodieksysteem staat
➔ O>N>C>H
• ion- (zout): elektrostatische aantrekking +atoom (kation) en -atoom (anion)
• waterstofbrug: tussen moleculen, partiële lading H2O, NH3 OH+2---N-H3
• van der Waals: ongelijke lading verdeling in atoom, sterker bij groter molecuul
H3 – chemie van water [H2O]
H2O
- polair molecuul [𝐻 𝛿+ en 𝑂𝛿− ]
- onderlinge waterstofbruggen [bij ijs vast in kristalstructuur]
▪ O kent 4 orbitalen in valentieschil, 2 gedeeld in covalente binding met H, 2 over voor H-brug
- hoge oppervlaktespanning door cohesie watermoleculen
▪ adhesie: aantrekkingskracht 2 verschillende stoffen
- thermische energie opslag [1 calorie= 1gram H2O + 1C°]
▪ hoge soortelijke warmte= weinig temp. Verandering als H2O warmte afgeeft/opneemt
▪ Hitte afgeven= H-brug vormen
▪ Hitte absorberen= H-brug verbreken
▪ hoge verdampingswarmte zorgt voor verdampingskoeling oppv. [energie voor 1gram (l) --> (g)]
Oplossing: homogeen mengsel vloeistof met >2 opgeloste stoffen
- waterige oplossing: H2O= oplosmiddel (hydratie vormt hydraat van ion)
- hydrofiel: lost goed op in H2O (ionisch/polair)
1. waterstofion H+ (hydrogen) [H+][OH-]=10-14 --> lage pH=zuur=veel H+
2. hydroxide ion OH -
[H ]=10
+ -pH
3. hydronium ion H3O+ pH=-log[H+] → sterk
- zuur: geeft H af+
← zwak (evenwicht)
→
- base: neemt H+ op “geconjugeerde…”
- buffers: enzym regulatie
▪ zodat carboxy (-COOH) en amino (NH2) groep niet ioniseren van aminozuren
, H4 – basis van moleculaire diversiteit
• 1mol= molecuulmassa in u
• Molariteit (M)= gram/u (1L water= 1000gram)
• Organisch: bevat C-atomen [koolwaterstof= alleen C-H]
- Methaan CH4
- Ethaan C2H6 etheen C2H4 / ethyn C2H2
- Propaan C3H8 tetraëders: viervlak bij enkele binding
- Butaan C4H10
Isomeer: zelfde molecuulformule, andere structuurformule & ruimtelijke structuur
1. Structuur-: atomen verschillende volgorde verbonden/gearrangeerd
2. Cis-/trans- [geometrisch]: dubbele binding, 2-atoom(groepen) wisselen
▪ Cis= 2 groepen aan dezelfde kant
▪ Trans= 2 groepen aan tegenovergestelde kant
3. Optische- / spiegelbeeld-[enantiomerie]: asymmetrisch C-atoom (chiraal)= C met 4 verschillende atoomgroepen
▪ Aminozuren kennen 2-enantiomeren (allen L-vorm voor eiwitsynthese --> -OH links van chiraal C-atoom)
ATOOMGROEP MOLECUULFORMULE NAAM & EIGENSCHAP
hydroxyl -OH Alcohol (-ol) --> polair voor grotere oplosbaarheid
carbonyl C=O Keton (in C-skelet) of aldehyde (aan einde C-skelet)
carboxyl -COOH Carbonzuur= organisch zuur geeft H+ af
amino -NH2 Amine= base neemt H+ op
sulhydryl -SH Thiol, vormen crosslinks
Fosfaat -OPO32- Organisch fosfaat, reageert met water
methyl -CH3 Methylering bepaalt expressie van genen in DNA
ATOOM ATOOMNUMMER VALENTIE-e- ∆EN
O 8 (2,6) 2
---------->
N 7 (2,5) 3
C 6 (2,4) 4
H 1 (1) 1
Zuur/base pH berekenen Vb.
waterstofion H+ (hydrogen) [H+][OH-]=10-14 [10-2][10-12]=10-14
[H+]=10-pH
hydroxide ion OH- pH=-log[H+] [H+]=10-7
hydronium ion H3O+ 7=-log[10-7]
Figuur 1 structuurformule ATP
Adenine + ribose + 3 fosfaatgroepen
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper Marissa18. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €3,99. Je zit daarna nergens aan vast.
