Brock Biology of Microorganisms - Chapter
9 Exam Study Guide.
Genome - answer✔entire complement of genetic information (including genes, regulatory
sequences, and noncoding DNA)
genomics - answer✔discipline of mapping, sequencing, analyzing, and comparing genomes
sequencing - answer✔determining the precise order of nucleotides in a DNA or RNA molecule
genome annotation - answer✔converting raw sequence data into a list of genes present in the
genome ("bottleneck")
bioinformatics - answer✔storing and analyzing sequences and structures
dideoxy method - answer✔-method of sequencing DNA invented by Fred Sanger
-copy original ssDNA
-small amounts of dideoxyribonucleotides (ddNTPs) used with dNTPs
-originally used radioactivity, but now use fluorescent labels
dideoxyribonucleotides (ddNTPs) - answer✔chain terminators that prevent further elongation of
DNA chain
pyrosequencing - answer✔-"next-generation sequencing"
-uses luciferase (bioluminescent enzyme) to detect incorporation of dNTPs
Functional ORF - answer✔ORF that actually encodes a protein; can be identified by a computer
codon bias - answer✔some codons used more frequently than others
how to find and identify ORFs - answer✔1) locate start and stop codons and Shine-
Dalgarno/ribosome-binding sequences
hypothetical proteins - answer✔-uncharacterized ORFs; proteins that likely exist but whose
function is currently unknown (due to lack of aa sequence homology with knowns)
-assigned to family or general function
noncoding RNA - answer✔-RNA that is not translated (like tRNA, rRNA, noncoding regulatory
RNAs)
-lack start codons and have multiple stop codons
comparative genomics - answer✔uses databases to probe genomes for correlation between
genome size and ORF content
small genomes - answer✔-these genomes belong to parasitic or endosymbiotic prokaryotes
-this size means these symbionts are totally dependent on host for nutrients, but provide host
with essential aa and nutrients it can't synthesize
-Ex. Mycoplasma (Bacteria) and Nanoarchaeum equitans (Archaea) are the most extreme of
these
-probably needs at least 250-300 genes to be viable
-tend to encode more translational processes
large genomes - answer✔-some bacterial genomes are as "***" as some eukaryotic microbes
-can even have more genes than eukaryotes due to lack of introns
-Ex. Sorangium cellulosum (Bacteria)
-Archaeal extremes are typically smaller than Bacteria extremes in this manner
-tend to encode more transcriptional regulation and signal transduction processes
metabolic genes - answer✔typically the most abundant class of genes
Archaeal genomes - answer✔-these genomes tend to devote higher % of genomes to energy and
coenzyme production
-have fewer genes for carbohydrate metabolism and membrane functions
-subject to change as more types of this genome are able to be studied
mitochondria and chloroplast genomes - answer✔-encode necessary machinery for protein
synthesis
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper sirjoel. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €9,94. Je zit daarna nergens aan vast.
