100% tevredenheidsgarantie Direct beschikbaar na betaling Zowel online als in PDF Je zit nergens aan vast
logo-home
Microben Hoorcollege aantekeningen €6,49   In winkelwagen

College aantekeningen

Microben Hoorcollege aantekeningen

 4 keer bekeken  0 keer verkocht

Aantekeningen van Microben hoorcolleges met begrippen onderstreept en schuingedrukt.

Laatste update van het document: 1 week geleden

Voorbeeld 4 van de 67  pagina's

  • 24 oktober 2024
  • 24 oktober 2024
  • 67
  • 2022/2023
  • College aantekeningen
  • Leendert hamoen
  • Alle colleges
Alle documenten voor dit vak (10)
avatar-seller
YaraBMW
Hoorcollege 1 – Hamoen
Inleiding
- MRSA-bacterie: Methicillin-resistant Staphylococcus aureus à resistant tegen antibiotica (ziekenhuis)

Bacteriële ziektes:
- Longontsteking: Streptococcus pneumoniae
- Tuberculose (TB): Mycobacterium tuberculosis
- Voedselvergiftiging: Salmonella typhimutium, Escherichia coli
- Maagzweer: Helicobacter pylori
- Gonorroe: Neisseria gonorrhoeae
- Veteranenziekte: Legionella pneumophila
- Hersenvliesontsteking: Haemophilus influenzae
- Miltvuur (antrax): Bacillus anthracis
Dier valt neer à perfect voor de voedingsbodem à ander rund eet het en valt ook weer neer
- Slaapziekte: Trypanosoma brucei is een eencellige parasiet

Bacterial plant pathogens:
- Citrus kanker
- Bacterial leaf scorch à armpjes om aan plant te binden

Mycorrhiza: een samenlevingsvorm van schimmels en planten via de wortels.

Panama disease: fusarium oxysporum à schimmel op banaan
Aardadppelziekte: Phytophthora infestans à aardappelen oneetbaar
In Europa niet zo een groot probleem à meerdere aardappelsoorten
In Ierland wel een groot probleem

En zijn schimmels gevaarlijk voor de mens?
Fungal infection primarily problematic for immunee compromised
Candida albicans (yeast) normal part of vaginal & mouth flora, can cause opportunistic infection

Meest belangrijke eukaryote pathogenen zijn eukartyote protozoa (human parasites)…
- Malaria (Plasmodium falciparum) meest dodelijk à eencellige parasiet à gaat in rode bloedcellen zitten
- Slaapziekte
- Leishmaniasis – parasite, infectie van de huid

Leishmania major: een intracellulair pathogeen dat de macrofagen en dendritische cellen van het
immuunsysteem infecteert

Tobacco mosaic disease à tomaten
- Wat voor ziekteverwekker is dit? Virus à ontdekt door TMD
- Deze ziekte ging wel door een filter dus geen bacterie

Voorbeelden van virus infecties bij mensen?
- Corona
- Polio
- HIV
- Hepatitis
- Mazelen
- Dengue - knokkelkoorts

Voorbeelden van food preservation/processing:
- Chilling
- Freezing

,- Sugaring
- Salting
- Canning
- Vacuum Packing

3 essential roles of bacteria
- Improved soil structure and soil aggregation
- Recycling of soil nutrients
- Water recycling.

Immunization: the stimulation of an immune response by deliberate inoculation with an attenuated
pathogen
- Ontdekt door Louis Pasteur
- Ontwikkelde het eerste vaccine (tegen hondsdolheid en voor kippen cholera)

De goede kanten van microben
- Bier & wijn, Kaas & worst
- Tempeh: rhizopus oligosporus
- Natto: bacillus subtilis


Essentiele rol van microben
- Nitrogen fixatie à omzetten NO3 naar N en O à Knolletjesbacterie
- Symbiose: korstmossen (lichens) à symbiose tussen schimmel en een plant/alg
- Essentiele symbiose met hogere organismes: Microbioom
Menselijke microbioom (in de darmen) ~500 soorten à zorgt voor vertering/voedingsstoffen
Moeilijk te onderzoeken want je mag geen onderzoek doen aan het menselijke microbioom
Veel ziektes zijn te linken aan het microbioom
- Huid microbioom heel verschillend

Nutrienten recycling
- Nutrient cycle (plant microbiome) à Moleculen worden afgebroken en gebruikt voor groei van andere
organisme

Biotechnologie: productie van chemische verbindingen en enzymen
- Vitamines
- Enzymen
- Biofuels

Alexander Fleming: kwam erachter dat penicillium sommige bacteriën dood
De eerste commerciële antibiotica dat mensenlevens redde

Kunnen virussen ook nuttig zijn?
- Voor de nutriënten cyclus
- Voor het beheersen van bacteriën door middel van bacteriofagen
- Virussen worden gebruikt in gentherapie

Veel moleculaire biologie technieken zijn gebaseerd op systemen uit bacteriofagen en virussen:
- Restrictie enzymen
- CRISPR-Cas

Microbes:
- Infections
- Microbiome

,- Immune respons
Komt allemaal samen in molecular microbiology, biotechnology & microbial ecology à biology

Basic forms (bacilli, cocci, spiral)

De bacteriële cel
Lichtmicroscoop
- Met de lichtmicroscoop kan je veel bacteriën in kaart brengen à ontdekt door Antoni van Leeuwenhoek
- Robert Hooke à De eerste versie van de microscoop nu
- De golflengte moet gelijk of kleiner zijn dan de orde van het object à natuurkunde
- Bright-field microscopy: genereert een donker omgeving om het object wat belicht moet worden
- The Gram stain
Gram-positieve: dikke celwand – meerdere lagen
Gram- negatieve: dunne celwand + extra buitenmembraan – 1/2 laag/lagen
- Periplasma: een ruimte tussen de binnenste celmembraan en buitenste membraan bij gram-negatieve
bacteriën of de equivalente ruimte buiten de binnenste membraan bij gram-positieve bacteriën.
- Phase-contrast microcopy: Superimposes refracted light and transmitted light shifted out of phase
Zwart-wit
- Fluorescence microscopy: the specimen absorbs light of a defined wavelength, and then emits light of
lower energy, thus longer wavelength; that is, the specimen fluoresces
A fluorophore is een fluorescent waarmee je delen kan kleuren
- Immunofluorescent: 2 antibodies kleuren en kijken waar ze naar toe gaan, aan elkaar binden
- GFP: groen fluorescerend eiwit
Elektronenmicroscopie
- Kan kleinere cellen zien dan de lichtmicroscoop
- 2 types
1) Transmissie(TEM): het hele sample à gehele plaatje
2) Scanning(SEM): de oppervlakte van het sample à op een bepaald gebied
- Tomografie: je bestraalt de sample met elektronen en je verandert steeds de hoek zodat de computer
een 3D-model kan maken
- Magnetic filled magnetosome: richt altijd of naar het noorden of naar het zuiden à wordt bepaald door
het magnetische veld
- Microbial scale (micrometres)
- Bij een hele grote vergroting is er olie nodig om de vergroting te kunnen zien
- Septum: the new cell wall that forms between two daughter cells as a result of cell division

Cell envelop
- DNA in bacteriën wordt nucleoid genoemd
- Eukaryotic membranes contain cholesterol that lowers the membrane fluidity
- In some bacteria, the same function is filled by hopanoids
- Most bacteria cell walls are made up of peptidoglycan (or murein)
- The molecule consists of
- 4 suiker
- transglycosilation + transpeptidation
- Zitten in de D-configuratie, niet in de L
- Normale cellen zitten in de L-configuratie
De een werkt niet als medicijn maar de ander wel
- Lipid II à is een belangrijk target voor verschillende antibiotica
- LPS: zitten aan de buitenkant van gram-negatieve cellen à omzeilen van immuunsysteem

Capsule
- Made of polysaccharide and glycoprotein
- Protects cells from phagocytosis
- Found in Gram-negative & positive cells

, S-layer: is een laag dat wordt gebruikt als alternatief voor buitenmembraan, bestaat uit een enkele laag
eiwit moleculen, beschermen de cel
Sommige cellen hebben geen cell wall, bijvoorbeeld mycoplasma
Causes pneumonia and meningitis

Cytoskeleton
3 belangrijke elementen:
1) FtsZ: belangrijk voor de celdeling, ring in het midden (de septum)
2) MreB: zorgt voor de algemene vorm à de ronde vorm
3) CreS: zorgt voor een kromming in de cel

Specialized structures
- Thylakoids: extensively folded intracellular photosynthetic membranes. Not the same as chloroplast
- Carboxysomes: polyhedral bodies packed with the enzyme Rubisco for CO2 fixation
- Gas vesicles: to increase buoyancy
- Storage granules: Glycogen, for energy
- Magnetosomes: membrane-embedded crystals of magnetics
Orient the swimming of magnetotactic bacteria
- Pili or fimbriae are straight filaments of pilin proteins
- Sex pili: are used in conjugation
- Stalks: are membrane-embedded extensions of the cytoplasm
- Flagella: kan een cel zich mee voort bewegen
Bestaat uit de monomeren genaamd flagellin
- Chemotaxis: is het aanpassen van de richting door middel van de chemische gradient

CCW (counter-clockwise) rotation
- Flagella bundle together
- Push cell forward
- “Run”

CW (clockwise) rotation
- Flagellar bundle falls apart
- “Tumble” = bacterium briefly stops, then changes direction

Hoorcollege 2 – Hamoen
Cultivation of bacteria
Types of media
- Complex media: are nutrient rich but poorly defined
- Synthetic media: are precisely defined
- Enriched media: are complex media to which specific blood components are added
- Selective media: favor the growth of one organism over another

LB medium: complex medium
M9 medium: defined/synthetic medium

A defined minimal medium contains only the compounds needed for an organism to grow

Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:

Verzekerd van kwaliteit door reviews

Verzekerd van kwaliteit door reviews

Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!

Snel en makkelijk kopen

Snel en makkelijk kopen

Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.

Focus op de essentie

Focus op de essentie

Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!

Veelgestelde vragen

Wat krijg ik als ik dit document koop?

Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.

Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?

Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.

Van wie koop ik deze samenvatting?

Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper YaraBMW. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.

Zit ik meteen vast aan een abonnement?

Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €6,49. Je zit daarna nergens aan vast.

Is Stuvia te vertrouwen?

4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)

Afgelopen 30 dagen zijn er 85443 samenvattingen verkocht

Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen

Start met verkopen
€6,49
  • (0)
  Kopen