100% tevredenheidsgarantie Direct beschikbaar na betaling Zowel online als in PDF Je zit nergens aan vast
logo-home
Eerder door jou gezocht
Eerder door jou gezocht
logo
Medical Genomics Summary Lecture 4 part 1 Data bases and analysis tools €2,99
In winkelwagen
Snel navigeren naar
Voorbeeld
  2.  
  3. Vrije Universiteit Amsterdam (VU)
  4.  
  5. Medical Genomics (AB_1143)

Samenvatting

Medical Genomics Summary Lecture 4 part 1 Data bases and analysis tools

1 beoordeling
 19 keer bekeken  0 keer verkocht

Orderly and clear summary of lecture 4 part 1 Data bases and analysis tools from the book "Medical Genomics by Sander Groffen". All the summaries of the lectures match with this book therefore you will easily pass your exam. This will save you a lot of time. I passed this course with an 7,3. Good l...

[Meer zien]

Voorbeeld 1 van de 4  pagina's

Document informatie

  • 25 maart 2020
  • 4
  • 2018/2019
  • Samenvatting

Onderwerpen

Geschreven voor

Alle documenten voor dit vak (18)

1  beoordeling

review-writer-avatar

Door: anacarolinaorlandin • 3 jaar geleden

Verkoper

avatar-seller
biomedicalsciencesvu

Ontvangen beoordelingen

Voorbeeld van de inhoud

Medical Genomics – Lecture 4 – Data bases and analysis tools

NIH; National Institutes of Health
NCBI; National Center for Biotechnology Information
NLM; National Library of Medicine

Databases; well-organized collections of data that can be accessed (bereikt) through
the use of query language.
• GenBank; all available protein and nucleotide sequences
• Protein Data Bank; 3D structures of proteins, nucleic acids and carbohydrates

Other important databases; ENA (Euopean nucleotide archive) and DDBJ (DNA
DataBank of Japan). Data exchange occurs daily.

Sequence retrieval (ophalen) systems for users; NCBI, Ensemble, Expasy, DDBJ
etc.

The entrez nucleotide database
NCBI developed entrez nucleotide database.
It is a search and find system. Large scale of data domains, including literature,
nucleotide and protein sequences, complete genomes and 3D structures.

Collection of sequences from;
• GenBank; NIH genetic sequence database, an annotated (van aantekening
voorzien) collection of all publicly DNA sequences
GenBank is part of DDBJ, the European Molecular Biology Laboratory (EMBL)
and GenBank at NCBI.
• RefSeq; collection aims to provide a comprehensive (begrijpelijke), integrated
and non-redundant set of sequences; genomic DNA, transcript (RNA), protein
products. Basis for medical, functional and diversity studies
• PDB (Brookhaven Protein Data Bank); database for 3D structures

The GenBank file format
Locus; locus name, sequence length, molecule type, gen bank division and
modification data

Definition; short description of sequence

Accession; unique identifier for a sequence. (number and letters)

Version; identificationnubmer GI (GenInfo Identifier); parallel to version

Keywords; describe the sequence

Source; where the sequence is from. Short name of the organism.

Organism; scientific name for source organism.

References; Authors that discuss the data

Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:

Verzekerd van kwaliteit door reviews

Verzekerd van kwaliteit door reviews

Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!

Snel en makkelijk kopen

Snel en makkelijk kopen

Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.

Focus op de essentie

Focus op de essentie

Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!

Veelgestelde vragen

Wat krijg ik als ik dit document koop?

Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.

Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?

Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.

Van wie koop ik deze samenvatting?

Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper biomedicalsciencesvu. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.

Zit ik meteen vast aan een abonnement?

Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €2,99. Je zit daarna nergens aan vast.

Is Stuvia te vertrouwen?

4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)

Afgelopen 30 dagen zijn er 56326 samenvattingen verkocht

Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen

Start met verkopen
€2,99
  • (1)
In winkelwagen
Toegevoegd