Questions for chapter “Timeline of genome sequencing”
1. Study the timeline on the first page of the chapter. Make your personal top 5 of the key
moments in the history of genome sequencing. For each of the 5 items, explain why
you think it belongs to the top 5.
1.complete human genome
2.Watson & Crcik double helix modal
3.Sanger sew.
4.Isolation DNA
5.Taq polymerase
2. In 1973, a method was invented to clone DNA fragments in bacteria. Why was this
invention important?
To make more DNA fragments -->amplified it, otherwise signal is way to weak.
3. In 1977, Frederic Sanger developed a method to sequence DNA.
a. What was the goal of this method?
Base-by-base sequencing
b. Why was it necessary to add 1 modified nucleotide to each sample mixture?
Describe the difference between a normal and modified nucleotide in your own
words, and explain why this difference is important.
Modified nucleotide is the dideoxy nucleotide. They have no O group to 3’. So,
terminate the chain.
Do this with different nucleotides and sequence can be read by gel electrophorese
The band will correspond to the chain length.
c. If you want to sequence a DNA genome of 100 base pairs using this method,
how would you do that? How many Eppendorf vials would you need to make?
How would the gel for separation look like? And how would you read the
sequence from the gel?
Eppendorf vials; 4 vials, for each base pair (GATC)
Gel look like; 4 lanes with bands (lane for G, A, T and C)
How read sequence; bottom to the top
4. Later, the sequencing method was improved and accelerated. Draw how a PCR
reaction with 2 primers can yield an exponential amplification, whereas a cycle
sequencing reaction with 1 primer will yield a linear amplification. Tip: draw both parent
DNA strands, the primers and the products of the two first cycles.
Cycle sequencing and PCR zie schrift
5. Describe how the use of dyedeoxy nucleotides made the Sanger method 4-fold more
effective.
By four color/one lane sequencing technique; the dideoxy nucleotides are labeled with
fluorescent dye. Instead of having to perform 4 sequence reactions, all four nucleotides
could now be read from a single sequence reaction, so 4-fold more effective.
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper biomedicalsciencesvu. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €2,99. Je zit daarna nergens aan vast.