Samenvatting deel 2 algemene biochemie Christophe Ampe Bart Devreese
Samenvatting algemene biochemie deel 1 Christophe Ampe, Bart Devreese
Alles voor dit studieboek
(5)
Geschreven voor
Universiteit Gent (UGent)
Biologie
Biochemie I: biomoleculen (COOO1365A)
Alle documenten voor dit vak (1)
Verkoper
Volgen
evadrr
Voorbeeld van de inhoud
Biochemie I
H1 Inleiding
Belangrijke historische figuren
- Wöhler
- Pasteur: fermentatie processen
- Buncher
4 soorten bouwstenen van biomacromoleculen:
- Aminozuren: in waterige oplossing als zwitterion.
Eiwitten: ketens van AZ (20 verschillende)
- Koolhydraten, suikers: polysachariden, opslag van
energie
- Nucleotiden: DNA, RNA (4 verschillende)
- Lipiden: associeren tot membranen (geen ketens)
Wetten van thermodynamica
- 1e wet: energie kan niet worden gecreërd, allen worden omgezet. In cel
chemische energie omzetten.
- 2e wet: entropie van systeem neemt toe.
Spontane reactie = reactie waar geen energie voor moet geleverd worden,
G<0, exergonisch.
In de cel reacties die energie
vereisen koppelen aan reacties die
energie leveren.
Katabolisme: van kleine moleculen naar
grote moleculen.
Anabolisme: grote moleculen afbreken
naar kleine.
Door peptide spontane assemblage tot
celachtige structuren.
,H2 Chemie in een waterige omgeving
2.1 Eigenschappen van water
Gebogen moleculen, polair, sterk elektronegatief. Polariteit is een gevolg van het
verschil in elektronegativiteit.
- Covalente binding is gemiddeld 1A = 1 angstrum
- Waterstofbruggen
- Ijs: structuur hiervan bepaald door H-bruggen, elke watermolecule omringd
door 4 andere. De centrale watermolecule: 2x donor, 2x acceptor. Zet uit
bij bevriezen.
- Vloeibaar: wordt netwerk ban H-bruggen gevormd (geen vast rooster,
constand fluctuerend netwerk). Hierdoor hoge oppervlaktespanning
(cohesief karakter).
2.2 De bindingen in biomoleculen
Niet-covalente bindingen
Tussen positieve kern en negatieve elektronen wolk, relatief zwak,
elektrostatisch.
- Intermoleculair: DNA:
basepaarvorming
- Intramoleculair: eiwitten
Ionaire bindingen
Vander waals interacties (zwak)
2.3 water als oplosmiddel
Solvatatie = het elektronegatieve karakter van water laat toe om ionaire en
sterk polaire verbindingen te disspciëren = oplossen
Hydrofoob effect
= wanner apolair verbinding opgelost wordt in water oriënteren
ze zich zodanig dat apolair gedeelten zo minimaal mogelijk in
contact komen met water (GEEN KRACHT OF INTERCTIE)
Ordening van watermoleculen om interacties met lipiden
te vermijden is entropisch gedreven.
Vetzuren: vorming micellen
Membranen vormen barrières
Biomoleculaire interacties zijn gebasseerd op complementariteit,
moet perfecte match zijn tussen eiwitten.
pH bloed = 7
, CO2 als buffer, reageert spontaan maar wordt versnelt door enzym.
Wisselwerking zorgt voor stabilisatie. Bij teveel protonen, meer koolzuur
In boek lezen
Hyperventilatie: verhoogd uitstoot CO2, aantal protonen dalen waardoor
de pH stijgt. Oplossing: in zakje ademen zodat je weer CO2 krijgt (die dan
met H+ kunnen binden).
H3 Aminozuren
3.1 chemische structuur
Eiwit = opeenvolging van 20
standaardaminozuren (komen niet allemaal
noodzakelijk voor).
α-aminozuren = aminogroep en
carboxylgroep gebonden aan zelfde
koolstof.
3.2 Algemene eigenschappen
Aminogroep & carboxylgroep ioniseren in water. AZ kan zowel als zuur als als
base optreden.
Zwitterion: sterk oplosbaar in water.
3.3 De 20 standaard aminozuren
Indeling volgens zijketens/ R-groepen
Apolair (H, koolstofketen, aromate
, Aromaten: Phenylalanine & tryptofaan: volimineuw en zeer apolair
Polair (OH, SH, CONH2) – H-bruggen maken
Cystine: disulfidebrug
Polair, geladen (COOH, NH2)
pK waarden gelden enkel voor vrije aminozuren.
Hydrofoob effect: polaire AZ richten zich naar het water en de apolaire
zonderen zich af van het water.
3.4 Zuur-base eigenschappen
De pH waarbij de netto lading van het AZ = 0 isoeleltrisch punt
Eerste proton dat afgestoten: α-COOH groep (dichter bij aminogroep)
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper evadrr. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €7,36. Je zit daarna nergens aan vast.
