This is a compact (20 pag.) summary for plant biotechnology Wageningen University. I've added 87 common test bank questions and answers from all chapters and lectures.
,
,-1- Plant genomes
There are 3 types of genomes in plant cells:
• Chloroplast genome = circular, double stranded DNA that ranges from 120 to 160 kb in
size and contains about 120-140 genes. If there are inverted repeats it is type II
chloroplast genome.
• Mitochondrial genome = 200 – 2500 kb and thus much larger than mammals. Lots of
non- coding DNA, few genes. Promiscuous DNA = chloroplast DNA in mitochondrial DNA
• Nuclear genome = DNA/chromosomes in cell Nucleus
DNA -> histones -> nucleosomes(DNA 150bp wrapped around histones, cores H2A, H2B, H3 and H4)
-> 30nm fibre -> wrapped into chromosomes
microRNA = short (21-24 nucleotides) RNAs that are found in the genome regions that are not
associated with protein-coding genes. They are generally well conserved among plant species.
First a hairpin needs to be synthetized from the miRNA. These
are produced by RNA polymerase II, like normal RNA. Dicer, a
RNAse III endonucleoase, splices the duplex into mature
miRNA which is also referred to as RNA induced silencing
complex (RISC). Not shown in picture, RISC also has an
Argonaut molecule (AGO1) attached.
In translation of a gene, transcription factors (TFIID) bind to
the TATA-box. These transcription factors then attract RNA-
polymerase II and the gene is activated.
Ribosomes attach to the 5’ side of the mRNA and move one
codon in the 3’ direction.
Gene expression can be influenced by:
• Chromatin conformation (eu- and heterochromatin, open and closed), also including
DNA methylation
• Gene transcription (promotor, cis-elements = sequence elements that function to recruit
the proteins that regulate transcription of a gene located on the same DNA-strand as the
coding region for the gene, transcription factors)
• RNA modification (splicing, alternative splicing = combining exons in different ways)
• Translation
• Post translational modification (phosphorylation, glycosylation and acetylation)
• Localization (protein needs to be transported to compatible location)
• Protein turnover
Essential are promotor cis elements and a poly A signal.
Alternative splicing = combining exons differently to obtain different proteins from the same gene.
Promotor analysis = determining how long the upstream promotor sequence is by testing various
promotor gene fusions. The moment that the gene product is not produced anymore determines
how long the promotor fragment is.
, promotor examples:
• Light regulated gene expression using light-responsive elements (LREs)
• Abscisic acid-induced gene expression ABA
• Tissue specific expression
-2- Plant tissue culture
Plant cells are totipotent = each individual plant cell can under right circumstances develop into a full
plant.
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper Scriptiebibliotheek. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €6,16. Je zit daarna nergens aan vast.
