Samenvatting
Samenvatting colleges Microbial Evolution and Ecology
- Instelling
- Universiteit Leiden (UL)
Samenvatting van alle colleges van het vak Microbial Evolution and Ecology. Veel uitleg met afbeeldingen.
[Meer zien]Voorbeeld 4 van de 48 pagina's
Voorbeeld 4 van de 48 pagina's
In winkelwagengesponsord bericht van onze partner
1 beoordeling
Door: cmkolmeijer • 3 jaar geleden
Voorbeeld van de inhoud
SamenvattingMICROBIAL
EVOLUTION &
ECOLOGY
,INHOUD
- College 1: Microbial diversity p.2
- College 2: Mechanisms of diversity p.6
- College 3: Virus Ecology p.10
- College 4: Protists p.14
- College 5: Plasmids p.16
- College 6: Antimicrobial Resistance p.19
- College 7: Transformation p.22
- College 8: Phage p.25
- College 9: Experimental evolution p.29
- College 10: Microbes and medicine p.33
- College 11: Plant/Microbe interactions p.36
- College 12: Symbiosis p.39
- College 13: Insect Symbionts p.42
- College 14: Microbiomes plants p.44
- College 15: Microbiomes animals p.46
1
,College 1: Microbial diversity
Drivers and consequences of soil microbial diversity
Inleiding
Welke processen worden uitgevoerd door microben?
Aandrijven van biogeochemische kringlopen en het recyclen van nutriënten.
Afbraak van organisch materiaal.
Voorkomen van ziektes.
Antagonist van pathogenen (ziekteverwekkers)
Zuiveren van water en het reinigen van de omgeving.
Reeks van symbiotische interacties.
Het behouden van de bodemstructuur.
Hoeveel microben zijn er? 1030 microbiële cellen op aarde.
De aarde bevat meer microbiële cellen dan menselijke cellen.
Aarde: een microbiële planeet
De aarde is door organismen,
specifiek micro-organismen, zo
gevormd dat men er kan leven.
Microben en plantmicroben
interacties reguleren het klimaat van
de aarde.
3 biljoen jaar lang bestonden er
alleen maar microben op de aarde.
Cyanobacteriën zorgde voor de influx
van zuurstof.
The extent of life
Microben kunnen in extreme
omstandigheden (over)leven.
Zie rechts het verschil met eukaryoten
2
, The three domains
of life bestaan uit:
Bacteria, Archea en
Eukaryoten
Waarom weten we zo weinig over de ecologie van microben?
Ze zijn erg klein, zonder microscoop zijn ze niet te zien.
Het is erg moeilijk om soorten van elkaar te onderscheiden.
Het is erg moeilijk om de individuele activiteiten van de microben te meten.
Ze zijn erg divers.
De meerderheid kan niet gecultiveerd worden in het lab.
Grote doorbraken en trends in microbiële ecologie:
Ontdekking dat microben bestaan.
Ontdekking dat microben verantwoordelijk zijn voor veel activiteiten.
Cultivatie en karakterisering van microben.
Het gebruik van moleculaire methodes om microbiële populaties te karakteriseren.
Carl Woese introduceerde ‘the three domains of life’
Human genome Project
Sequencing van menselijk genoom
Maar ook van veel microben.
Metagenomica = de studie van rechtstreeks uit omgevingsmonsters gewonnen
genetisch materiaal.
Evolutie van DNA sequencing:
Sequencing wordt exponentieel goedkoper en sneller
454
Illumina
Ion Torrent
Microbial Diversity
Microben soorten bepalen:
Onmogelijk via de morfologie of het fenotype.
70% DNA kruis-hybridisatie wanneer het DNA van 2 organismen ‘gesmolten’
wordt en daarna bij elkaar wordt gedaan en het voor 70% correct is, worden de
organismen als 1 soort gezien.
Moleculaire studies gebruiken 16S RNA gensequenties voor identificatie.
Genomische studies kijken nu ook naar het aantal genen die organismen gemeen
hebben.
Diversiteit:
Alpha diversiteit: aantal soorten in een sample.
Beta diversiteit: de diversiteit tussen samples.
‘Evenness’: hoe eerlijk zijn soorten verdeeld.
Fylogenetische diversiteit: de fylogenetische afstand tussen de geobserveerde
sequenties.
‘Coverage’: Het geschatte deel van de totale diversiteit van een gemeenschap je in je
dataset hebt.
3
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper huijkelomloes. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €4,49. Je zit daarna nergens aan vast.
Is Stuvia te vertrouwen?
4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)
Afgelopen 30 dagen zijn er 67474 samenvattingen verkocht
Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen